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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 44 / 143 下载 TSV

上一页 44 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000207 Chr04 NC_080390.1:1831532-1831543promoter 内 93-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1835440-1839166(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr02G004209 Chr02 NC_080388.1:64360206-64360217promoter 内 88-99 bp - 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 64352947-64356304(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr01G002998 Chr01 NC_080387.1:48933315-48933326promoter 内 85-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 48927161-48929410(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr03G002360 Chr03 NC_080389.1:37197735-37197746promoter 内 72-83 bp + 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37201664-37203817(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr07G002699 Chr07 NC_080393.1:26333176-26333187promoter 内 27-38 bp + 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 26327640-26329213(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAT
SmilChr02G005423 Chr02 NC_080388.1:74699834-74699845promoter 内 3731-3742 bp - 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 74698809-74699575(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTT
SmilChr01G004830 Chr01 NC_080387.1:66432289-66432300promoter 内 85-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 66436205-66438902(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAA
SmilChr03G000425 Chr03 NC_080389.1:4628549-4628560promoter 内 2533-2544 bp - 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 4630017-4632066(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGA
SmilChr06G003049 Chr06 NC_080392.1:43391986-43391997promoter 内 1994-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 43393993-43396188(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGA
SmilChr08G001219 Chr08 NC_080394.1:9834456-9834467promoter 内 1724-1735 bp + 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 9828144-9832190(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAT
SmilChr03G001587 Chr03 NC_080389.1:20108051-20108062promoter 内 1149-1160 bp + 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 20102180-20105210(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr07G002888 Chr07 NC_080393.1:29169263-29169274promoter 内 944-955 bp + 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 29162196-29166217(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTA
SmilChr08G001676 Chr08 NC_080394.1:14009139-14009150promoter 内 675-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 14003329-14005824(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAG
SmilChr05G003265 Chr05 NC_080391.1:42256779-42256790promoter 内 330-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 42251856-42253119(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAA
SmilChr06G000149 Chr06 NC_080392.1:1047009-1047020promoter 内 3952-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 1047058-1048865(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAA
SmilChr06G000229 Chr06 NC_080392.1:1544853-1544864promoter 内 3521-3532 bp + 469 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 1540443-1544384(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAC
SmilChr03G000076 Chr03 NC_080389.1:930717-930728promoter 内 3311-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 927039-930038(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr03G000314 Chr03 NC_080389.1:3579238-3579249promoter 内 3263-3274 bp + 727 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 3575411-3578511(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr03G001234 Chr03 NC_080389.1:14251568-14251579promoter 内 3220-3231 bp + 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 14249971-14250798(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAT
SmilChr02G000626 Chr02 NC_080388.1:9354540-9354551promoter 内 3103-3114 bp - 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 9350353-9353653(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCTT
SmilChr03G000278 Chr03 NC_080389.1:3163935-3163946promoter 内 3086-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 3160443-3163031(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr03G002802 Chr03 NC_080389.1:44498804-44498815promoter 内 2733-2744 bp - 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 44500072-44508118(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAG
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SmilChr01G002600 Chr01 NC_080387.1:44176744-44176755promoter 内 2075-2086 bp + 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 44170440-44174829(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAC
SmilChr08G000300 Chr08 NC_080394.1:2103402-2103413promoter 内 1936-1947 bp - 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 2105467-2108306(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAT
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SmilChr07G002766 Chr07 NC_080393.1:27526499-27526510promoter 内 1737-1748 bp + 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 27521678-27524246(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr03G004222 Chr03 NC_080389.1:60780996-60781007promoter 内 1665-1676 bp + 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 60783332-60786462(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTT
SmilChr02G005016 Chr02 NC_080388.1:71938053-71938064promoter 内 1479-1490 bp - 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 71934718-71935542(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTT
SmilChr03G001215 Chr03 NC_080389.1:13969326-13969337promoter 内 1391-1402 bp - 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 13971936-13972914(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAT
SmilChr08G001779 Chr08 NC_080394.1:15009853-15009864promoter 内 1270-1281 bp + 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 15004612-15007133(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAG
SmilChr07G000649 Chr07 NC_080393.1:4376902-4376913promoter 内 912-923 bp + 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 4379991-4381759(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTT
SmilChr04G002535 Chr04 NC_080390.1:40453706-40453717promoter 内 695-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 40457012-40457554(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGAG
SmilChr01G002994 Chr01 NC_080387.1:48866295-48866306promoter 内 442-453 bp + 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 48859269-48862747(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAT
SmilChr01G005980 Chr01 NC_080387.1:75458183-75458194promoter 内 3975-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75453629-75458168(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr05G000253 Chr05 NC_080391.1:1935429-1935440promoter 内 3945-3956 bp + 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 1935485-1945953(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAA
SmilChr08G000945 Chr08 NC_080394.1:7034334-7034345promoter 内 3919-3930 bp + 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 7030956-7034263(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCGG
SmilChr01G006151 Chr01 NC_080387.1:76970580-76970591promoter 内 3918-3929 bp - 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 76964924-76970508(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCTA
SmilChr03G003302 Chr03 NC_080389.1:51169564-51169575promoter 内 3910-3921 bp + 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51169655-51173452(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGAA
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SmilChr01G003269 Chr01 NC_080387.1:51377265-51377276promoter 内 3871-3882 bp + 119 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51371398-51377146(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr05G001241 Chr05 NC_080391.1:10524407-10524418promoter 内 3868-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10520062-10524285(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCAG
SmilChr02G003248 Chr02 NC_080388.1:53744942-53744953promoter 内 3813-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 53743126-53744765(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCGT
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SmilChr01G005864 Chr01 NC_080387.1:74579797-74579808promoter 内 3772-3783 bp + 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74579473-74579579(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr02G000532 Chr02 NC_080388.1:7317096-7317107promoter 内 3772-3783 bp - 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 7317325-7317431(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
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