转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G004136; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000866-RA_Salv SmilChr04G004136 MYB XP_057806072.1 MP00627 TTACCTACCG

可能结合的靶基因

9835 个结合位点 8075 个候选靶基因 第 60 / 162 下载 TSV

上一页 60 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000439 Chr01 NC_080387.1:8802774-8802783promoter 内 2105-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 8800797-8800887(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr04G000361 Chr04 NC_080390.1:3593071-3593080promoter 内 2093-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 3594979-3596101(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr03G000907 Chr03 NC_080389.1:10404003-10404012promoter 内 2077-2086 bp + 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 10399492-10402088(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr02G001931 Chr02 NC_080388.1:34714962-34714971promoter 内 2017-2026 bp + 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 34716946-34717989(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr03G000355 Chr03 NC_080389.1:3975290-3975299promoter 内 2015-2024 bp + 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 3977276-3978322(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr01G004227 Chr01 NC_080387.1:60647563-60647572promoter 内 1995-2004 bp + 1997 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 60643350-60645566(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr01G006072 Chr01 NC_080387.1:76160709-76160718promoter 内 1992-2001 bp - 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 76157690-76158709(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr04G000539 Chr04 NC_080390.1:5997889-5997898promoter 内 1989-1998 bp - 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 5999901-6020574(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr07G004066 Chr07 NC_080393.1:51958773-51958782promoter 内 1948-1957 bp + 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 51960826-51961786(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr01G002409 Chr01 NC_080387.1:41460047-41460056promoter 内 1939-1948 bp + 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 41462109-41463061(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr07G000595 Chr07 NC_080393.1:4068432-4068441promoter 内 1802-1811 bp + 2190 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 4060608-4066242(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr07G004267 Chr07 NC_080393.1:55081489-55081498promoter 内 1765-1774 bp - 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 55083725-55087397(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr06G000267 Chr06 NC_080392.1:1814978-1814987promoter 内 1709-1718 bp - 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1810106-1812695(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TTACCTACTG
SmilChr01G002391 Chr01 NC_080387.1:41173858-41173867promoter 内 1689-1698 bp - 2303 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 41176170-41179598(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr05G001018 Chr05 NC_080391.1:8335721-8335730promoter 内 1685-1694 bp - 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 8338037-8340830(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr08G000172 Chr08 NC_080394.1:1183024-1183033promoter 内 1621-1630 bp - 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1178688-1180653(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr04G002908 Chr04 NC_080390.1:45338975-45338984promoter 内 1489-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 45331954-45336472(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr07G004306 Chr07 NC_080393.1:55639711-55639720promoter 内 1357-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 55635760-55637076(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr03G002519 Chr03 NC_080389.1:40154785-40154794promoter 内 1343-1352 bp + 2649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 40137796-40152136(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr05G000283 Chr05 NC_080391.1:2194973-2194982promoter 内 1317-1326 bp + 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 2188993-2192298(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr05G001896 Chr05 NC_080391.1:19257844-19257853promoter 内 1141-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 19260704-19267673(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr07G002321 Chr07 NC_080393.1:21477826-21477835promoter 内 933-942 bp + 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 21480894-21482793(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr03G001987 Chr03 NC_080389.1:29126192-29126201promoter 内 921-930 bp + 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 29109433-29123121(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr07G002265 Chr07 NC_080393.1:20853390-20853399promoter 内 841-850 bp - 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 20856550-20859782(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr02G000222 Chr02 NC_080388.1:2886656-2886665promoter 内 753-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 2882983-2883417(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr05G004024 Chr05 NC_080391.1:54248544-54248553promoter 内 741-750 bp - 3251 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 54243565-54245293(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr05G000046 Chr05 NC_080391.1:224665-224674promoter 内 711-720 bp - 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 220170-221384(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr03G001574 Chr03 NC_080389.1:19865952-19865961promoter 内 688-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 19869265-19870366(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr07G001479 Chr07 NC_080393.1:11639813-11639822promoter 内 640-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 11643174-11647294(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr05G001091 Chr05 NC_080391.1:9100308-9100317promoter 内 585-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 9094467-9096901(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr01G001720 Chr01 NC_080387.1:31681683-31681692promoter 内 511-520 bp - 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 31669833-31678202(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr06G000268 Chr06 NC_080392.1:1814978-1814987promoter 内 498-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1818481-1823537(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr01G001721 Chr01 NC_080387.1:31681683-31681692promoter 内 421-430 bp - 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 31685263-31686471(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr03G000441 Chr03 NC_080389.1:4747260-4747269promoter 内 393-402 bp - 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 4741905-4743661(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr01G001408 Chr01 NC_080387.1:27680043-27680052promoter 内 260-269 bp + 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 27673850-27676311(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr07G001478 Chr07 NC_080393.1:11639813-11639822promoter 内 258-267 bp - 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 11630380-11636079(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TTACCTACTG
SmilChr02G001143 Chr02 NC_080388.1:20728442-20728451promoter 内 246-255 bp + 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 20718475-20724696(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr01G000238 Chr01 NC_080387.1:4465618-4465627promoter 内 238-247 bp + 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 4460922-4461864(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr05G001939 Chr05 NC_080391.1:19758658-19758667promoter 内 152-161 bp - 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 19751612-19754818(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr07G001509 Chr07 NC_080393.1:12044583-12044592promoter 内 84-93 bp + 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 12038522-12040675(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr01G002149 Chr01 NC_080387.1:37479892-37479901promoter 内 3989-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 37479904-37482870(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr03G000848 Chr03 NC_080389.1:9756410-9756419promoter 内 3980-3989 bp - 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 9663105-9756398(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr03G000781 Chr03 NC_080389.1:8899610-8899619promoter 内 3971-3980 bp - 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8891005-8899589(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr02G000939 Chr02 NC_080388.1:16381950-16381959promoter 内 3969-3978 bp - 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 16378949-16381927(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr01G001819 Chr01 NC_080387.1:33126280-33126289promoter 内 3967-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33123324-33126255(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr01G001820 Chr01 NC_080387.1:33136035-33136044promoter 内 3967-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33133079-33136010(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr02G002203 Chr02 NC_080388.1:39238728-39238737promoter 内 3964-3973 bp + 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 39238765-39239775(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr02G001641 Chr02 NC_080388.1:30492220-30492229promoter 内 3960-3969 bp + 32 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 30492261-30495190(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr07G004196 Chr07 NC_080393.1:54009683-54009692promoter 内 3960-3969 bp + 32 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54009724-54012709(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr05G001729 Chr05 NC_080391.1:16695361-16695370promoter 内 3959-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 16692390-16695328(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC