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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 68 / 123 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000602 Chr02 NC_080388.1:8761580-8761594promoter 内 3349-3363 bp - 638 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 8762232-8763090(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACGGTGGT
SmilChr01G004453 Chr01 NC_080387.1:62656162-62656176promoter 内 2784-2798 bp - 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 62657379-62661525(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACTCACAC
SmilChr02G005102 Chr02 NC_080388.1:72564594-72564608promoter 内 2750-2764 bp - 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 72561030-72563357(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAATCCGTCGGTGAG
SmilChr01G002682 Chr01 NC_080387.1:45033902-45033916promoter 内 2632-2646 bp + 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 45031437-45032547(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACCACCCC
SmilChr02G001989 Chr02 NC_080388.1:35942827-35942841promoter 内 1813-1827 bp - 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 35945015-35949222(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACGGTGGT
SmilChr01G001667 Chr01 NC_080387.1:30769125-30769139promoter 内 1779-1793 bp + 2208 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 30762761-30766917(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACGGTGGT
SmilChr08G003686 Chr08 NC_080394.1:41138738-41138752promoter 内 1606-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 41141133-41147193(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACTGTCCC
SmilChr03G002540 Chr03 NC_080389.1:40558983-40558997promoter 内 1477-1491 bp + 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 40551539-40556473(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCAGCACA
SmilChr06G002373 Chr06 NC_080392.1:34573583-34573597promoter 内 1304-1318 bp - 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 34569996-34570900(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAGACGTCGGTGAA
SmilChr02G004254 Chr02 NC_080388.1:64746065-64746079promoter 内 1065-1079 bp + 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 64749001-64750761(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCGTCGTCGGTGAT
SmilChr08G002107 Chr08 NC_080394.1:18932566-18932580promoter 内 725-739 bp - 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 18926376-18929304(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAGGGAGTCGGTGGT
SmilChr04G002465 Chr04 NC_080390.1:39479314-39479328promoter 内 661-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 39482654-39487438(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACAAGTTG
SmilChr01G005657 Chr01 NC_080387.1:72913918-72913932promoter 内 562-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 72917357-72919095(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AATTATGTCGGTGCT
SmilChr01G001673 Chr01 NC_080387.1:30876044-30876058promoter 内 380-394 bp + 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 30879665-30882603(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAGGGGGTCGGTGGA
SmilChr03G004064 Chr03 NC_080389.1:59602785-59602799promoter 内 3884-3898 bp - 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 59602902-59607842(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCACAAGA
SmilChr03G004743 Chr03 NC_080389.1:64552089-64552103promoter 内 3884-3898 bp - 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 64548949-64551986(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAGTGGTCGGTGGT
SmilChr04G001168 Chr04 NC_080390.1:17402313-17402327promoter 内 3835-3849 bp - 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17402479-17402584(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACGGACTT
SmilChr08G002757 Chr08 NC_080394.1:27229492-27229506promoter 内 3745-3759 bp - 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 27226334-27229250(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCTGGCGGTGGT
SmilChr05G001636 Chr05 NC_080391.1:15287783-15287797promoter 内 3731-3745 bp + 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15288053-15289353(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGCGGCGGCGGTGGT
SmilChr05G002507 Chr05 NC_080391.1:27811525-27811539promoter 内 3722-3736 bp + 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 27811804-27815790(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTTCATGTCGGTGGG
SmilChr05G001514 Chr05 NC_080391.1:13894236-13894250promoter 内 3493-3507 bp - 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 13889456-13893742(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGGCGTCGGTGTC
SmilChr06G000094 Chr06 NC_080392.1:665529-665543promoter 内 3446-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 666084-670549(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGTTATGGCGGTGGT
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SmilChr05G000833 Chr05 NC_080391.1:6555983-6555997promoter 内 3292-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 6556692-6557778(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGTTATGGCGGTGGT
SmilChr06G002255 Chr06 NC_080392.1:31983051-31983065promoter 内 3235-3249 bp - 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 31983817-31985971(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACTCCCTC
SmilChr08G004330 Chr08 NC_080394.1:52978168-52978182promoter 内 3221-3235 bp + 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 52978948-52983828(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGTTATGGCGGTGGT
SmilChr01G000391 Chr01 NC_080387.1:8060487-8060501promoter 内 3216-3230 bp + 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 8061272-8062313(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTGCTGACGGTGGT
SmilChr06G000742 Chr06 NC_080392.1:6894861-6894875promoter 内 3170-3184 bp - 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 6895692-6896402(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACTCAGAC
SmilChr05G003660 Chr05 NC_080391.1:49328416-49328430promoter 内 3150-3164 bp - 837 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49314170-49327579(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCCTTGTCGGTGTC
SmilChr02G005173 Chr02 NC_080388.1:73036707-73036721promoter 内 3074-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 73031943-73035794(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCACCGACGACACA
SmilChr05G001878 Chr05 NC_080391.1:19040794-19040808promoter 内 3068-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 19037772-19039875(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCTGGCGGTGGT
SmilChr07G003893 Chr07 NC_080393.1:48786370-48786384promoter 内 3004-3018 bp + 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 48783201-48785387(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCACCGACGACACA
SmilChr01G006192 Chr01 NC_080387.1:77530508-77530522promoter 内 2987-3001 bp + 1000 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 77523699-77529508(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACTGCTGC
SmilChr01G000383 Chr01 NC_080387.1:7872843-7872857promoter 内 2910-2924 bp - 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7873934-7877658(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACTCCCTC
SmilChr01G004876 Chr01 NC_080387.1:66852434-66852448promoter 内 2886-2900 bp + 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 66853549-66854501(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCGTCGGCGGTGGT
SmilChr04G001976 Chr04 NC_080390.1:32020459-32020473promoter 内 2881-2895 bp + 1106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 32021579-32022190(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCGAAGTCGGTGGT
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SmilChr07G000246 Chr07 NC_080393.1:1585225-1585239promoter 内 2688-2702 bp + 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1582773-1583926(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGCACCGACGATCGC
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SmilChr04G001710 Chr04 NC_080390.1:28265488-28265502promoter 内 2569-2583 bp - 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 28261211-28264070(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCGACGTCGGTGTC
SmilChr06G002524 Chr06 NC_080392.1:36206145-36206159promoter 内 2510-2524 bp + 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 36201530-36204668(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCACCGACAATTAA
SmilChr06G001476 Chr06 NC_080392.1:15661889-15661903promoter 内 2473-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15658947-15660375(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAGGGAGTCGGTGGT
SmilChr02G004755 Chr02 NC_080388.1:69732275-69732289promoter 内 2464-2478 bp - 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 69733812-69737345(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCGCA
SmilChr06G000720 Chr06 NC_080392.1:6575513-6575527promoter 内 2356-2370 bp + 1631 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 6571914-6573882(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AACACCGACGCCAGC
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SmilChr05G003680 Chr05 NC_080391.1:49856766-49856780promoter 内 2138-2152 bp - 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49858629-49865914(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCAGCACA
SmilChr02G005552 Chr02 NC_080388.1:75493636-75493650promoter 内 2078-2092 bp + 1909 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 75495559-75498044(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTAGCTGTCGGTGCA