转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 75 / 134 下载 TSV

上一页 75 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004741 Chr02 NC_080388.1:69629379-69629393promoter 内 3929-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 69629451-69631396(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAGGAAATGATTAT
SmilChr03G001778 Chr03 NC_080389.1:24287663-24287677promoter 内 3851-3865 bp - 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 24285567-24287527(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTGCAATGATTGA
SmilChr02G003451 Chr02 NC_080388.1:55802034-55802048promoter 内 3836-3850 bp - 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55800901-55801883(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTGAATAATGATTAA
SmilChr01G003558 Chr01 NC_080387.1:54195851-54195865promoter 内 3797-3811 bp - 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54196055-54198940(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTTCATTC
SmilChr01G003287 Chr01 NC_080387.1:51555827-51555841promoter 内 3796-3810 bp + 191 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51556032-51558906(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGTCATGATGATTAA
SmilChr02G000788 Chr02 NC_080388.1:12959212-12959226promoter 内 3792-3806 bp - 195 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 12959421-12959777(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTATCATTATTTTA
SmilChr02G000829 Chr02 NC_080388.1:14046561-14046575promoter 内 3760-3774 bp - 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14045221-14046334(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTTGCTAATGATTAG
SmilChr01G001095 Chr01 NC_080387.1:22422463-22422477promoter 内 3722-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 22419061-22422198(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAGAAAATGATTAC
SmilChr02G003922 Chr02 NC_080388.1:61291781-61291795promoter 内 3686-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 61292096-61295382(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAGGAAATGATTAA
SmilChr02G004162 Chr02 NC_080388.1:63951832-63951846promoter 内 3666-3680 bp - 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 63947914-63951511(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATGATGTA
SmilChr01G003937 Chr01 NC_080387.1:57687733-57687747promoter 内 3652-3666 bp - 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57685818-57687398(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGGAGCAATGATTGG
SmilChr03G001663 Chr03 NC_080389.1:21566198-21566212promoter 内 3636-3650 bp + 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21564855-21565847(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATACTG
SmilChr02G005079 Chr02 NC_080388.1:72428630-72428644promoter 内 3596-3610 bp + 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 72421915-72428239(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTGCAAGT
SmilChr03G001872 Chr03 NC_080389.1:25933280-25933294promoter 内 3475-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 25933806-25940905(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTATCATTATTCTT
SmilChr02G004970 Chr02 NC_080388.1:71597469-71597483promoter 内 3452-3466 bp - 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 71595479-71596934(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTGCAATGATTGA
SmilChr01G002736 Chr01 NC_080387.1:45695436-45695450promoter 内 3394-3408 bp + 593 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 45696043-45696201(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTGCATAATGATGAG
SmilChr02G004858 Chr02 NC_080388.1:70721248-70721262promoter 内 3294-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 70719282-70720555(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTAGGAAA
SmilChr03G000230 Chr03 NC_080389.1:2726828-2726842promoter 内 3233-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2727596-2728591(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTGCAAGT
SmilChr02G000614 Chr02 NC_080388.1:8954389-8954403promoter 内 3189-3203 bp - 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 8955201-8959169(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATACTG
SmilChr01G000177 Chr01 NC_080387.1:2910270-2910284promoter 内 3133-3147 bp + 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2906711-2909416(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAAAACT
SmilChr02G003218 Chr02 NC_080388.1:53363012-53363026promoter 内 3106-3120 bp + 881 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53358199-53362131(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTGCAAGT
SmilChr01G002962 Chr01 NC_080387.1:48520531-48520545promoter 内 3082-3096 bp - 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 48514321-48519626(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTGCAATGATTGA
SmilChr01G003354 Chr01 NC_080387.1:52295727-52295741promoter 内 3066-3080 bp - 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52291283-52294806(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGTAATAATGATTGA
SmilChr03G000899 Chr03 NC_080389.1:10271138-10271152promoter 内 2942-2956 bp - 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 10272197-10276604(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTATCATTACTTTT
SmilChr02G000975 Chr02 NC_080388.1:17046326-17046340promoter 内 2930-2944 bp - 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 17041698-17045269(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTGCAATGATTGA
SmilChr02G001362 Chr02 NC_080388.1:25533905-25533919promoter 内 2904-2918 bp - 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 25531465-25532822(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAATCTGATGATTAT
SmilChr01G004440 Chr01 NC_080387.1:62482882-62482896promoter 内 2870-2884 bp + 1117 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62479382-62481765(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTATTTTC
SmilChr01G005155 Chr01 NC_080387.1:69323449-69323463promoter 内 2817-2831 bp - 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 69324633-69326962(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTTCCTAT
SmilChr02G000830 Chr02 NC_080388.1:14046561-14046575promoter 内 2794-2808 bp - 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14047768-14048901(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTAGCAAG
SmilChr02G000536 Chr02 NC_080388.1:7391000-7391014promoter 内 2764-2778 bp - 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7392237-7393374(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTATTCAT
SmilChr02G000437 Chr02 NC_080388.1:5702748-5702762promoter 内 2685-2699 bp + 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5699949-5701446(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTTGTG
SmilChr01G000131 Chr01 NC_080387.1:2204432-2204446promoter 内 2641-2655 bp + 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2199994-2203086(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTGCAAGT
SmilChr02G004402 Chr02 NC_080388.1:66355042-66355056promoter 内 2548-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 66353008-66353603(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAATTAATGATTGT
SmilChr01G005718 Chr01 NC_080387.1:73372862-73372876promoter 内 2513-2527 bp + 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73374350-73376322(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTGCAATGATTGA
SmilChr01G000086 Chr01 NC_080387.1:1599333-1599347promoter 内 2507-2521 bp - 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1600827-1602069(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTTGTG
SmilChr02G001407 Chr02 NC_080388.1:26704635-26704649promoter 内 2456-2470 bp - 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26706180-26709397(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTGTCAAT
SmilChr01G002157 Chr01 NC_080387.1:37581639-37581653promoter 内 2436-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 37583204-37586022(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCTCACAATGATTAC
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