转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 78 / 121 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002652 Chr02 NC_080388.1:45979183-45979197promoter 内 421-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 45972579-45975617(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATTTGATTCT
SmilChr02G001871 Chr02 NC_080388.1:33995482-33995496promoter 内 406-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33990153-33991901(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGGTGGAGATCTGGT
SmilChr02G002406 Chr02 NC_080388.1:41969985-41969999promoter 内 372-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41973614-42011446(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGGATTAGATCTAGC
SmilChr02G005469 Chr02 NC_080388.1:74966363-74966377promoter 内 371-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 74969993-74970778(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACACATGGATCTGAA
SmilChr01G000893 Chr01 NC_080387.1:18975621-18975635promoter 内 356-370 bp - 3631 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 18979266-18980289(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTAGATCTATTCCC
SmilChr03G002807 Chr03 NC_080389.1:44533337-44533351promoter 内 346-360 bp - 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44527081-44529696(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAATATAGATCTAAC
SmilChr02G004997 Chr02 NC_080388.1:71797356-71797370promoter 内 315-329 bp + 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 71801042-71803192(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAAGTTAGATCTGTT
SmilChr04G000592 Chr04 NC_080390.1:6618394-6618408promoter 内 276-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 6612261-6614683(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTAAAGGA
SmilChr03G003284 Chr03 NC_080389.1:50870434-50870448promoter 内 268-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 50874167-50874983(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGAGTTAGATCTCAT
SmilChr02G000115 Chr02 NC_080388.1:1456473-1456487promoter 内 265-279 bp - 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1460209-1463014(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTCTCTCC
SmilChr04G002856 Chr04 NC_080390.1:44667274-44667288promoter 内 249-263 bp - 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44671026-44672169(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAAGATCTAACTCC
SmilChr01G001729 Chr01 NC_080387.1:31841952-31841966promoter 内 199-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 31845754-31846979(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTATAGATCTAGG
SmilChr02G001776 Chr02 NC_080388.1:32532360-32532374promoter 内 189-203 bp + 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 32536172-32538199(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGCTAGATCCAGG
SmilChr01G003085 Chr01 NC_080387.1:49685890-49685904promoter 内 163-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49689728-49693147(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGAGAGAGATCTGAA
SmilChr03G000358 Chr03 NC_080389.1:4023274-4023288promoter 内 159-173 bp + 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4018307-4019446(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGGGTTTT
SmilChr03G000520 Chr03 NC_080389.1:5592773-5592787promoter 内 106-120 bp - 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 5596668-5597834(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGAGATCTATTTTC
SmilChr02G002409 Chr02 NC_080388.1:42040684-42040698promoter 内 105-119 bp + 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 42044580-42045591(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGGATTAGATCTAGC
SmilChr03G002532 Chr03 NC_080389.1:40375894-40375908promoter 内 75-89 bp - 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 40379820-40380477(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCCAGATCTAAGACA
SmilChr01G002774 Chr01 NC_080387.1:46182293-46182307promoter 内 65-79 bp + 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 46186229-46186729(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCATACAGATCTGCT
SmilChr03G000367 Chr03 NC_080389.1:4098817-4098831promoter 内 42-56 bp + 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4102776-4104254(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAAGATAGATCTAAG
SmilChr02G000528 Chr02 NC_080388.1:7273236-7273250promoter 内 19-33 bp + 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7265033-7269268(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTCTCTCC
SmilChr01G000270 Chr01 NC_080387.1:5329119-5329133promoter 内 3399-3413 bp - 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 6 5329721-5330807(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GACAGATCTAGCTGT
SmilChr01G002514 Chr01 NC_080387.1:43077325-43077339promoter 内 3796-3810 bp - 191 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 43076010-43077134(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCACTAGATCTAAT
SmilChr01G001856 Chr01 NC_080387.1:33513716-33513730promoter 内 2992-3006 bp - 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 33511321-33512721(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAACAGATCTGGG
SmilChr02G001036 Chr02 NC_080388.1:18441364-18441378promoter 内 2749-2763 bp - 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 18436349-18440126(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G003014 Chr01 NC_080387.1:49171203-49171217promoter 内 2440-2454 bp - 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 49172764-49176736(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCCAGATCTGTTGTG
SmilChr03G002109 Chr03 NC_080389.1:32812935-32812949promoter 内 2146-2160 bp - 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 32807897-32811094(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G000228 Chr01 NC_080387.1:4262636-4262650promoter 内 2075-2089 bp + 1912 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 4264562-4267628(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G000230 Chr01 NC_080387.1:4281261-4281275promoter 内 2075-2089 bp + 1912 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 4283187-4286253(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr02G001577 Chr02 NC_080388.1:29326233-29326247promoter 内 2040-2054 bp + 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 29328194-29331231(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G000289 Chr01 NC_080387.1:5658498-5658512promoter 内 2020-2034 bp + 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 5660479-5663588(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G000502 Chr01 NC_080387.1:10191799-10191813promoter 内 2018-2032 bp - 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 10187311-10189830(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G000575 Chr01 NC_080387.1:11925994-11926008promoter 内 2017-2031 bp + 1970 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 11927978-11931142(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr02G001380 Chr02 NC_080388.1:26122564-26122578promoter 内 2017-2031 bp - 1970 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 26117462-26120594(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr03G001792 Chr03 NC_080389.1:24457616-24457630promoter 内 1995-2009 bp + 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 24459622-24462615(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr04G001187 Chr04 NC_080390.1:18118837-18118851promoter 内 1976-1990 bp + 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 18120862-18123724(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr03G001688 Chr03 NC_080389.1:22347808-22347822promoter 内 1965-1979 bp - 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 22342720-22345786(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr03G001700 Chr03 NC_080389.1:22587769-22587783promoter 内 1951-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 22582678-22585733(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr03G000413 Chr03 NC_080389.1:4457640-4457654promoter 内 1367-1381 bp + 2620 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 4454107-4455020(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGTAGATCTAGTCCC
SmilChr04G001259 Chr04 NC_080390.1:19859497-19859511promoter 内 323-337 bp + 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 19863175-19864535(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G000811 Chr01 NC_080387.1:17490802-17490816promoter 内 225-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 17485733-17487040(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr02G000573 Chr02 NC_080388.1:8114215-8114229promoter 内 185-199 bp + 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 8118031-8119196(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr01G000549 Chr01 NC_080387.1:11410421-11410435promoter 内 183-197 bp - 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 11405391-11406617(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr04G000750 Chr04 NC_080390.1:9187161-9187175promoter 内 144-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 9191018-9192135(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
SmilChr02G000796 Chr02 NC_080388.1:13194385-13194399promoter 内 97-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 13189369-13190495(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAC
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SmilChr02G001448 Chr02 NC_080388.1:27154444-27154458promoter 内 3887-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 27154238-27154344(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTGCCGCA
SmilChr05G001551 Chr05 NC_080391.1:14244348-14244362promoter 内 3872-3886 bp + 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 14241996-14244233(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATTCGATTCC
SmilChr01G005059 Chr01 NC_080387.1:68500415-68500429promoter 内 3803-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 68500613-68523773(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTAGATCTATATAT