转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 79 / 134 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002304 Chr03 NC_080389.1:36270166-36270180promoter 内 784-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 5 36273383-36273455(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAAAAATGATTAC
SmilChr01G000150 Chr01 NC_080387.1:2561859-2561873promoter 内 3912-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 2559918-2561784(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAAACAATGATTGA
SmilChr01G000603 Chr01 NC_080387.1:13123791-13123805promoter 内 2025-2039 bp - 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 13125767-13129092(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTATTATC
SmilChr02G004333 Chr02 NC_080388.1:65595495-65595509promoter 内 3923-3937 bp - 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 65593541-65595431(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAAACAATGATTGA
SmilChr02G004834 Chr02 NC_080388.1:70459252-70459266promoter 内 3827-3841 bp + 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 70459426-70471260(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGGTAATGATAGG
SmilChr01G003064 Chr01 NC_080387.1:49500644-49500658promoter 内 3671-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 49500974-49501057(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCGCACAC
SmilChr01G001597 Chr01 NC_080387.1:30104258-30104272promoter 内 3647-3661 bp - 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 30104612-30107131(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTAATATT
SmilChr02G003940 Chr02 NC_080388.1:61536597-61536611promoter 内 3360-3374 bp + 627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 61537238-61542890(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGAAAATGATTAT
SmilChr01G003133 Chr01 NC_080387.1:50145879-50145893promoter 内 3298-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 50146582-50147477(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATTATTACTTAT
SmilChr01G003065 Chr01 NC_080387.1:49500644-49500658promoter 内 3199-3213 bp - 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 49501446-49501588(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCGCACAC
SmilChr03G003003 Chr03 NC_080389.1:46879133-46879147promoter 内 3021-3035 bp - 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 46880113-46883906(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTTTCATT
SmilChr01G002908 Chr01 NC_080387.1:47799968-47799982promoter 内 2444-2458 bp - 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 47797201-47798425(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAAACAATGATTGA
SmilChr01G001486 Chr01 NC_080387.1:28650394-28650408promoter 内 2415-2429 bp - 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 28647329-28648822(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCCCTAATGATGAT
SmilChr01G001517 Chr01 NC_080387.1:29047161-29047175promoter 内 2168-2182 bp + 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 29048994-29051927(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGAGAAATGATTAG
SmilChr03G003177 Chr03 NC_080389.1:49231431-49231445promoter 内 2126-2140 bp - 1861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 49233306-49238855(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACATCATTACAACA
SmilChr02G000501 Chr02 NC_080388.1:6887207-6887221promoter 内 1987-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 6883782-6885207(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTAACTTC
SmilChr01G002909 Chr01 NC_080387.1:47799968-47799982promoter 内 1857-1871 bp - 2130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 47802112-47805860(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTGTTTAC
SmilChr03G002298 Chr03 NC_080389.1:36198166-36198180promoter 内 1833-1847 bp + 2154 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 36193158-36196012(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGAGCA
SmilChr03G002120 Chr03 NC_080389.1:32943643-32943657promoter 内 1821-1835 bp + 2166 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 32945823-32946908(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGAGTAATGATTTT
SmilChr02G002706 Chr02 NC_080388.1:46913453-46913467promoter 内 1692-1706 bp + 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 46906815-46911158(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTATTATC
SmilChr02G002708 Chr02 NC_080388.1:46950044-46950058promoter 内 1369-1383 bp - 2618 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 46945602-46947426(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGATAATGATAAT
SmilChr02G005568 Chr02 NC_080388.1:75580519-75580533promoter 内 1300-1314 bp + 2687 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 75583220-75584946(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAAGTAATGATAAT
SmilChr01G003939 Chr01 NC_080387.1:57721843-57721857promoter 内 1258-1272 bp - 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 57724586-57724936(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTATATTC
SmilChr03G002323 Chr03 NC_080389.1:36576574-36576588promoter 内 1141-1155 bp - 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 36579434-36582596(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCAGAGTT
SmilChr01G003769 Chr01 NC_080387.1:56055257-56055271promoter 内 1098-1112 bp + 2889 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 56050375-56052368(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATAGCCATC
SmilChr01G002540 Chr01 NC_080387.1:43447094-43447108promoter 内 602-616 bp - 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 43450493-43453062(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTATCATTACCTCT
SmilChr02G000500 Chr02 NC_080388.1:6887207-6887221promoter 内 480-494 bp + 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 6882747-6883700(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTAACTTC
SmilChr02G000350 Chr02 NC_080388.1:4520781-4520795promoter 内 261-275 bp - 3726 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 4524521-4525545(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGGGAT
SmilChr02G005567 Chr02 NC_080388.1:75580519-75580533promoter 内 3967-3981 bp + 20 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 75580553-75583002(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAAGTAATGATAAT
SmilChr02G000911 Chr02 NC_080388.1:15756588-15756602promoter 内 3964-3978 bp - 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15751612-15756565(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATATCTAATGATGGA
SmilChr01G005633 Chr01 NC_080387.1:72774673-72774687promoter 内 3951-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 72769177-72774637(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGAAAATGATTAT
SmilChr01G005298 Chr01 NC_080387.1:70279860-70279874promoter 内 3927-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 70279934-70281517(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGAGTAATGATGTT
SmilChr01G005463 Chr01 NC_080387.1:71636897-71636911promoter 内 3861-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 71637037-71641223(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATCAAA
SmilChr02G005592 Chr02 NC_080388.1:75688309-75688323promoter 内 3669-3683 bp + 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 75687908-75687991(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCGCACAC
SmilChr01G001200 Chr01 NC_080387.1:24170133-24170147promoter 内 3458-3472 bp + 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24160292-24169604(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTAGAAAG
SmilChr01G003062 Chr01 NC_080387.1:49500644-49500658promoter 内 3441-3455 bp - 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49495889-49500098(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGTGCGATGATTAA
SmilChr01G001241 Chr01 NC_080387.1:24826135-24826149promoter 内 3410-3424 bp + 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24816330-24825558(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTAGAAAG
SmilChr01G003479 Chr01 NC_080387.1:53352390-53352404promoter 内 3355-3369 bp + 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 53353036-53357047(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTCGTAATGATTTC
SmilChr03G002077 Chr03 NC_080389.1:31781426-31781440promoter 内 3332-3346 bp - 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31778762-31780771(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGCAGCAATGATTGT
SmilChr01G004007 Chr01 NC_080387.1:58449743-58449757promoter 内 3326-3340 bp + 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 58450418-58450613(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTATGAAATGATTAT
SmilChr02G002386 Chr02 NC_080388.1:41793520-41793534promoter 内 3275-3289 bp - 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 41794246-41799827(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACTTTG
SmilChr02G005591 Chr02 NC_080388.1:75688309-75688323promoter 内 3201-3215 bp + 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 75687379-75687523(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCGCACAC
SmilChr01G005462 Chr01 NC_080387.1:71636897-71636911promoter 内 3152-3166 bp - 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 71632959-71636062(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTGATAATGATTGA
SmilChr01G005029 Chr01 NC_080387.1:68243928-68243942promoter 内 3088-3102 bp - 899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 68242265-68243029(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAAGTAATGATAAT
SmilChr03G002439 Chr03 NC_080389.1:38738108-38738122promoter 内 3068-3082 bp + 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 38739041-38739967(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AACTCTGATGATTAT
SmilChr01G002550 Chr01 NC_080387.1:43604709-43604723promoter 内 2958-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 43605752-43610948(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTCCACC
SmilChr01G002332 Chr01 NC_080387.1:40469172-40469186promoter 内 2887-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40470286-40471841(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACTAAC
SmilChr02G005120 Chr02 NC_080388.1:72684275-72684289promoter 内 2856-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 72685420-72692120(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTATTATC
SmilChr03G001078 Chr03 NC_080389.1:12474423-12474437promoter 内 2846-2860 bp - 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 12475578-12477656(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGAATTT
SmilChr02G002171 Chr02 NC_080388.1:38918734-38918748promoter 内 2562-2576 bp + 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 38920173-38920694(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCATCTAATGATGAG