转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 92 / 148 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000045 Chr06 NC_080392.1:370617-370630promoter 内 3307-3320 bp + 681 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 366661-369936(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAGTTAA
SmilChr01G002414 Chr01 NC_080387.1:41514732-41514745promoter 内 3294-3307 bp + 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 41515439-41518688(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr06G002573 Chr06 NC_080392.1:36938677-36938690promoter 内 3104-3117 bp + 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36935321-36937793(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAAGACCC
SmilChr02G000126 Chr02 NC_080388.1:1727657-1727670promoter 内 3084-3097 bp - 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1723714-1726753(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr01G001819 Chr01 NC_080387.1:33127193-33127206promoter 内 3050-3063 bp - 938 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 33123324-33126255(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr05G003465 Chr05 NC_080391.1:46041585-46041598promoter 内 3019-3032 bp + 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 46042567-46045546(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr01G002410 Chr01 NC_080387.1:41468869-41468882promoter 内 3014-3027 bp + 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 41469856-41472909(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr07G002743 Chr07 NC_080393.1:26959607-26959620promoter 内 3009-3022 bp - 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26955723-26958628(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr05G003660 Chr05 NC_080391.1:49328567-49328580promoter 内 3000-3013 bp + 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 49314170-49327579(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTCGCCG
SmilChr06G001623 Chr06 NC_080392.1:18084536-18084549promoter 内 3000-3013 bp - 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 18080625-18083548(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr04G001380 Chr04 NC_080390.1:22397415-22397428promoter 内 2998-3011 bp + 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 22398418-22401324(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr07G004242 Chr07 NC_080393.1:54838543-54838556promoter 内 2975-2988 bp + 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54839569-54842415(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr02G003200 Chr02 NC_080388.1:53161924-53161937promoter 内 2970-2983 bp - 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53158001-53160906(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr06G003170 Chr06 NC_080392.1:44649629-44649642promoter 内 2967-2980 bp - 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44647209-44648608(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGACTAACACGTGG
SmilChr04G003075 Chr04 NC_080390.1:47350436-47350449promoter 内 2959-2972 bp + 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47351478-47354351(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr07G002137 Chr07 NC_080393.1:19515750-19515763promoter 内 2956-2969 bp - 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19516795-19517657(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATTTGCG
SmilChr07G004534 Chr07 NC_080393.1:58001842-58001855promoter 内 2954-2967 bp - 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57997890-58000808(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr03G000851 Chr03 NC_080389.1:9707334-9707347promoter 内 2897-2910 bp + 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9708438-9711293(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr08G000861 Chr08 NC_080394.1:6381871-6381884promoter 内 2890-2903 bp - 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6378167-6380773(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTAGCTTCACGTGC
SmilChr06G001629 Chr06 NC_080392.1:18229173-18229186promoter 内 2879-2892 bp - 1109 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 18218045-18228064(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGTTTTCACGTGG
SmilChr03G000194 Chr03 NC_080389.1:2173700-2173713promoter 内 2684-2697 bp - 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2169373-2172396(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr05G000600 Chr05 NC_080391.1:4514342-4514355promoter 内 2666-2679 bp + 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4508429-4513020(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGGGAG
SmilChr05G002656 Chr05 NC_080391.1:30062068-30062081promoter 内 2651-2664 bp - 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30063418-30065256(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATCTAAT
SmilChr03G001240 Chr03 NC_080389.1:14287935-14287948promoter 内 2634-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14289302-14294842(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATATTTCACGTGG
SmilChr02G004498 Chr02 NC_080388.1:67487203-67487216promoter 内 2621-2634 bp - 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 67482937-67485836(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr03G003127 Chr03 NC_080389.1:48453688-48453701promoter 内 2619-2632 bp + 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 48455070-48457050(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGACTCCACGTGG
SmilChr03G001165 Chr03 NC_080389.1:13421419-13421432promoter 内 2600-2613 bp + 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 13422820-13425557(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr06G002498 Chr06 NC_080392.1:35871428-35871441promoter 内 2594-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 35865010-35870034(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATGTGTCACGTGT
SmilChr07G003889 Chr07 NC_080393.1:48687423-48687436promoter 内 2592-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 48680258-48686027(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACAACTG
SmilChr03G001167 Chr03 NC_080389.1:13435221-13435234promoter 内 2586-2599 bp + 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 13436636-13439364(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr02G002012 Chr02 NC_080388.1:36263668-36263681promoter 内 2560-2573 bp - 1428 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36259333-36262240(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr04G001428 Chr04 NC_080390.1:23231955-23231968promoter 内 2547-2560 bp + 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23233409-23235945(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr01G000687 Chr01 NC_080387.1:15388613-15388626promoter 内 2511-2524 bp - 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15387034-15387136(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAGTCTCACGTGC
SmilChr07G001321 Chr07 NC_080393.1:10149635-10149648promoter 内 2443-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 10144583-10148090(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTATTG
SmilChr01G001055 Chr01 NC_080387.1:21892703-21892716promoter 内 2435-2448 bp - 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21887929-21891150(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTGAAACACGTGG
SmilChr06G000522 Chr06 NC_080392.1:4300725-4300738promoter 内 2338-2351 bp - 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4302388-4303335(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCAAC
SmilChr05G001996 Chr05 NC_080391.1:20682704-20682717promoter 内 2316-2329 bp - 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 20684389-20687840(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAACTTT
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SmilChr06G001515 Chr06 NC_080392.1:16258221-16258234promoter 内 2181-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16254121-16256414(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACAATACACGTGG
SmilChr02G003228 Chr02 NC_080388.1:53554359-53554372promoter 内 2076-2089 bp - 1912 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53549063-53552447(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGGTTCACGTGT
SmilChr06G002603 Chr06 NC_080392.1:37417444-37417457promoter 内 2071-2084 bp - 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 37410472-37415527(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTACGTGCACGTGG
SmilChr06G003221 Chr06 NC_080392.1:44967771-44967784promoter 内 2042-2055 bp + 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44969730-44973776(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTGCTTCACGTGC
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SmilChr04G001193 Chr04 NC_080390.1:18255377-18255390promoter 内 1963-1976 bp + 2025 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 18249630-18253352(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGACAAG
SmilChr07G003890 Chr07 NC_080393.1:48687423-48687436promoter 内 1933-1946 bp + 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 48689491-48689818(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGTTGTCACGTGC
SmilChr05G002514 Chr05 NC_080391.1:27897338-27897351promoter 内 1870-1883 bp + 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27891862-27895220(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGACTTA
SmilChr07G002481 Chr07 NC_080393.1:23472254-23472267promoter 内 1817-1830 bp - 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23469227-23470083(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCAAATCACGTGC
SmilChr06G002575 Chr06 NC_080392.1:36994167-36994180promoter 内 1745-1758 bp - 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36989858-36991924(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTTCCTCACGTGA
SmilChr02G005604 Chr02 NC_080388.1:75749901-75749914promoter 内 1722-1735 bp - 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 75739543-75747635(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGGTTCACGTGT