转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 100 / 136 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G004271 Chr08 NC_080394.1:52201897-52201907promoter 内 2828-2838 bp - 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52197183-52200734(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr02G005350 Chr02 NC_080388.1:74296080-74296090promoter 内 2826-2836 bp - 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 74294780-74294915(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr08G002579 Chr08 NC_080394.1:25133978-25133988promoter 内 2797-2807 bp - 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25135182-25139365(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr05G001788 Chr05 NC_080391.1:17602739-17602749promoter 内 2783-2793 bp - 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17603957-17607323(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr07G001999 Chr07 NC_080393.1:17699913-17699923promoter 内 2757-2767 bp + 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17701157-17703881(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCC
SmilChr02G005169 Chr02 NC_080388.1:73018084-73018094promoter 内 2685-2695 bp - 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 73013770-73016778(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCATG
SmilChr03G004728 Chr03 NC_080389.1:64454513-64454523promoter 内 2685-2695 bp - 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 64455829-64458642(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G001575 Chr04 NC_080390.1:26147007-26147017promoter 内 2670-2680 bp + 1321 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26142214-26145686(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G002525 Chr08 NC_080394.1:24470701-24470711promoter 内 2638-2648 bp + 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 24465559-24469348(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr02G001536 Chr02 NC_080388.1:28602127-28602137promoter 内 2627-2637 bp - 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28603501-28604426(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G002868 Chr08 NC_080394.1:28530393-28530403promoter 内 2622-2632 bp + 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28528263-28529024(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGT
SmilChr06G000811 Chr06 NC_080392.1:7630750-7630760promoter 内 2586-2596 bp + 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7625645-7629345(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr02G002571 Chr02 NC_080388.1:44727118-44727128promoter 内 2583-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44725036-44725710(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G002072 Chr04 NC_080390.1:33474240-33474250promoter 内 2537-2547 bp + 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33467828-33472786(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr05G000222 Chr05 NC_080391.1:1735758-1735768promoter 内 2495-2505 bp + 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1731104-1734262(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr01G000351 Chr01 NC_080387.1:7306613-7306623promoter 内 2484-2494 bp - 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7308130-7311543(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G002049 Chr08 NC_080394.1:18338286-18338296promoter 内 2472-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 18329765-18336767(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr03G002136 Chr03 NC_080389.1:33248480-33248490promoter 内 2463-2473 bp - 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33240495-33246952(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCT
SmilChr06G001862 Chr06 NC_080392.1:22055255-22055265promoter 内 2432-2442 bp - 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 22056824-22059858(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000368 Chr03 NC_080389.1:4113814-4113824promoter 内 2407-2417 bp + 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4115408-4119854(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr08G001530 Chr08 NC_080394.1:12445318-12445328promoter 内 2376-2386 bp + 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 12446943-12455016(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCATG
SmilChr05G001799 Chr05 NC_080391.1:17745938-17745948promoter 内 2312-2322 bp - 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17739206-17744259(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr04G000025 Chr04 NC_080390.1:270572-270582promoter 内 2305-2315 bp + 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 264758-268886(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr06G003061 Chr06 NC_080392.1:43510470-43510480promoter 内 2293-2303 bp - 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43505133-43508772(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr06G003015 Chr06 NC_080392.1:43008326-43008336promoter 内 2276-2286 bp + 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43004066-43006611(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000669 Chr03 NC_080389.1:7487818-7487828promoter 内 2274-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7489545-7492450(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G002955 Chr04 NC_080390.1:45889361-45889371promoter 内 2274-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 45876801-45887644(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr01G004883 Chr01 NC_080387.1:66902689-66902699promoter 内 2230-2240 bp - 1761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 66896875-66900928(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr08G002044 Chr08 NC_080394.1:18277259-18277269promoter 内 2224-2234 bp + 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 18268790-18275492(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr03G000318 Chr03 NC_080389.1:3636848-3636858promoter 内 2151-2161 bp - 1840 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3638698-3641891(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G004704 Chr08 NC_080394.1:56499349-56499359promoter 内 2138-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56494693-56497496(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G004705 Chr08 NC_080394.1:56506952-56506962promoter 内 2137-2147 bp + 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56502343-56505098(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G003948 Chr03 NC_080389.1:58535979-58535989promoter 内 2124-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 58531954-58534112(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr08G003639 Chr08 NC_080394.1:39816739-39816749promoter 内 2112-2122 bp - 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 39818628-39819346(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr02G002232 Chr02 NC_080388.1:39669756-39669766promoter 内 2083-2093 bp + 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 39665191-39667848(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr01G000366 Chr01 NC_080387.1:7570966-7570976promoter 内 2059-2069 bp - 1932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7572908-7575735(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr05G004174 Chr05 NC_080391.1:55679956-55679966promoter 内 2056-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 55676818-55678021(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr01G000531 Chr01 NC_080387.1:10842603-10842613promoter 内 2051-2061 bp + 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10837853-10840663(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr02G005531 Chr02 NC_080388.1:75369425-75369435promoter 内 2047-2057 bp + 1944 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 75364076-75367481(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr07G002381 Chr07 NC_080393.1:22202178-22202188promoter 内 2040-2050 bp + 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 22197445-22200227(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr06G002415 Chr06 NC_080392.1:34896601-34896611promoter 内 2033-2043 bp + 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 34891816-34894643(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G001874 Chr04 NC_080390.1:30567687-30567697promoter 内 2009-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 30569679-30572231(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000815 Chr03 NC_080389.1:9326206-9326216promoter 内 1991-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9321230-9324206(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000816 Chr03 NC_080389.1:9333745-9333755promoter 内 1991-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9328780-9331745(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G002605 Chr08 NC_080394.1:25420100-25420110promoter 内 1990-2000 bp - 2001 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25422111-25425051(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr05G000646 Chr05 NC_080391.1:4889203-4889213promoter 内 1986-1996 bp + 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4891218-4892076(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCACAGCGCG
SmilChr02G002572 Chr02 NC_080388.1:44727118-44727128promoter 内 1984-1994 bp + 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44729135-44729890(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr05G000922 Chr05 NC_080391.1:7319038-7319048promoter 内 1984-1994 bp - 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7321055-7323686(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G002564 Chr08 NC_080394.1:24986878-24986888promoter 内 1968-1978 bp - 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 24983779-24984855(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr08G004258 Chr08 NC_080394.1:52062965-52062975promoter 内 1964-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52058314-52060938(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA