转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 101 / 136 下载 TSV

上一页 101 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000194 Chr03 NC_080389.1:2174451-2174461promoter 内 1936-1946 bp + 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2169373-2172396(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G001383 Chr04 NC_080390.1:22489229-22489239promoter 内 1932-1942 bp + 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 22484790-22487170(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000128 Chr03 NC_080389.1:1410524-1410534promoter 内 1923-1933 bp + 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1405567-1408456(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr02G004498 Chr02 NC_080388.1:67487954-67487964promoter 内 1873-1883 bp + 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 67482937-67485836(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr06G002454 Chr06 NC_080392.1:35329220-35329230promoter 内 1872-1882 bp + 2119 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35324385-35327101(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr07G003173 Chr07 NC_080393.1:33776823-33776833promoter 内 1862-1872 bp - 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33778962-33781907(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G001165 Chr03 NC_080389.1:13420671-13420681promoter 内 1852-1862 bp - 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 13422820-13425557(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G003320 Chr04 NC_080390.1:49941178-49941188promoter 内 1847-1857 bp + 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49937744-49939034(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCG
SmilChr03G001167 Chr03 NC_080389.1:13434473-13434483promoter 内 1838-1848 bp - 2153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 13436636-13439364(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000672 Chr03 NC_080389.1:7525997-7526007promoter 内 1827-1837 bp + 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7520940-7523833(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr02G002012 Chr02 NC_080388.1:36264419-36264429promoter 内 1812-1822 bp + 2179 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 36259333-36262240(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr06G000776 Chr06 NC_080392.1:7269565-7269575promoter 内 1805-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7271761-7274401(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G001428 Chr04 NC_080390.1:23231207-23231217promoter 内 1799-1809 bp - 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 23233409-23235945(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000312 Chr03 NC_080389.1:3553132-3553142promoter 内 1792-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3555341-3558022(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr01G005182 Chr01 NC_080387.1:69534719-69534729promoter 内 1783-1793 bp + 2208 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 69536937-69538900(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCACAGCGCG
SmilChr05G001774 Chr05 NC_080391.1:17449000-17449010promoter 内 1739-1749 bp + 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17443923-17446748(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G000657 Chr08 NC_080394.1:4891844-4891854promoter 内 1669-1679 bp + 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4883834-4889522(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr01G005574 Chr01 NC_080387.1:72486165-72486175promoter 内 1668-1678 bp - 2323 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 72488498-72489364(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G000786 Chr04 NC_080390.1:9681093-9681103promoter 内 1598-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9676495-9678700(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr07G001170 Chr07 NC_080393.1:8808766-8808776promoter 内 1561-1571 bp + 2430 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8803935-8806336(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr06G003043 Chr06 NC_080392.1:43282015-43282025promoter 内 1557-1567 bp - 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43276520-43279581(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCC
SmilChr07G002507 Chr07 NC_080393.1:23778103-23778113promoter 内 1527-1537 bp + 2464 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 23780577-23781203(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCACAGCGCG
SmilChr04G002221 Chr04 NC_080390.1:35900073-35900083promoter 内 1520-1530 bp + 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35894991-35897602(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G003971 Chr03 NC_080389.1:58749830-58749840promoter 内 1515-1525 bp - 2476 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 58743127-58747354(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr05G001721 Chr05 NC_080391.1:16489915-16489925promoter 内 1502-1512 bp - 2489 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16485265-16487426(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr02G001932 Chr02 NC_080388.1:34736781-34736791promoter 内 1469-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 34739313-34740095(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G002070 Chr04 NC_080390.1:33452426-33452436promoter 内 1428-1438 bp + 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33447699-33449863(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G001703 Chr04 NC_080390.1:28167209-28167219promoter 内 1393-1403 bp - 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28169817-28170251(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G004149 Chr04 NC_080390.1:56215983-56215993promoter 内 1364-1374 bp - 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56211535-56213356(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCC
SmilChr02G005348 Chr02 NC_080388.1:74296080-74296090promoter 内 1349-1359 bp - 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 74287529-74293438(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr03G003467 Chr03 NC_080389.1:53126699-53126709promoter 内 1333-1343 bp - 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 53123903-53124041(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr01G000621 Chr01 NC_080387.1:13739078-13739088promoter 内 1244-1254 bp + 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 13734991-13736331(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr07G003555 Chr07 NC_080393.1:41388781-41388791promoter 内 1222-1232 bp - 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41391560-41392252(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr01G001588 Chr01 NC_080387.1:29906604-29906614promoter 内 1183-1193 bp + 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 29909422-29911316(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCT
SmilChr04G001618 Chr04 NC_080390.1:26968643-26968653promoter 内 1171-1181 bp - 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26954229-26965823(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCATG
SmilChr03G001684 Chr03 NC_080389.1:22219375-22219385promoter 内 1139-1149 bp - 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 22222237-22223700(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr02G004964 Chr02 NC_080388.1:71553193-71553203promoter 内 1097-1107 bp + 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 71556097-71562272(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr03G001586 Chr03 NC_080389.1:20088841-20088851promoter 内 1095-1105 bp - 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 20091747-20094864(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G004266 Chr03 NC_080389.1:61145814-61145824promoter 内 1093-1103 bp + 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 61138318-61142916(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr03G000307 Chr03 NC_080389.1:3499076-3499086promoter 内 1074-1084 bp + 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3493752-3496159(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr01G003070 Chr01 NC_080387.1:49553336-49553346promoter 内 1031-1041 bp + 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49544645-49550376(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGT
SmilChr08G004541 Chr08 NC_080394.1:55003513-55003523promoter 内 987-997 bp - 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 54998214-55000509(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr05G003312 Chr05 NC_080391.1:43391356-43391366promoter 内 977-987 bp + 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43386744-43388342(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr07G000988 Chr07 NC_080393.1:7201465-7201475promoter 内 968-978 bp - 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7204498-7207878(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr04G002219 Chr04 NC_080390.1:35871988-35871998promoter 内 934-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35868149-35868931(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr05G000246 Chr05 NC_080391.1:1895349-1895359promoter 内 922-932 bp - 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1881277-1892280(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr01G002826 Chr01 NC_080387.1:46862202-46862212promoter 内 895-905 bp + 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 46865308-46866386(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCT
SmilChr02G001533 Chr02 NC_080388.1:28602127-28602137promoter 内 889-899 bp - 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28598548-28599025(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr08G003589 Chr08 NC_080394.1:38694435-38694445promoter 内 888-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 38691226-38691332(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr08G004484 Chr08 NC_080394.1:54450319-54450329promoter 内 873-883 bp + 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 54445857-54447201(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA