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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 107 / 139 下载 TSV

上一页 107 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001423 Chr02 NC_080388.1:26829588-26829599promoter 内 3619-3630 bp + 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 26829970-26830536(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTACGACGTGGA
SmilChr01G000834 Chr01 NC_080387.1:18020130-18020141promoter 内 3612-3623 bp + 378 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 18020519-18023491(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr04G001862 Chr04 NC_080390.1:30345823-30345834promoter 内 3599-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 30342269-30345432(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G005876 Chr01 NC_080387.1:74708747-74708758promoter 内 3595-3606 bp + 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 74707107-74708352(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTAA
SmilChr01G000322 Chr01 NC_080387.1:6324484-6324495promoter 内 3593-3604 bp + 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 6324892-6328186(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr03G000218 Chr03 NC_080389.1:2531715-2531726promoter 内 3589-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2530498-2531314(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATGACGTGAG
SmilChr03G002007 Chr03 NC_080389.1:29978280-29978291promoter 内 3587-3598 bp - 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 29974726-29977877(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr04G000331 Chr04 NC_080390.1:3039322-3039333promoter 内 3582-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3039741-3040732(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTTCGACGTGGA
SmilChr03G002172 Chr03 NC_080389.1:33776592-33776603promoter 内 3576-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 33777017-33780060(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr03G004427 Chr03 NC_080389.1:62416282-62416293promoter 内 3570-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 62416713-62418479(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCATGC
SmilChr01G005754 Chr01 NC_080387.1:73639847-73639858promoter 内 3547-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 73631093-73639404(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTAA
SmilChr03G002058 Chr03 NC_080389.1:31354741-31354752promoter 内 3502-3513 bp + 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 31355240-31358356(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G000447 Chr01 NC_080387.1:9145663-9145674promoter 内 3489-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 9140781-9145162(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G000678 Chr01 NC_080387.1:14994955-14994966promoter 内 3486-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 14991419-14994451(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr04G001119 Chr04 NC_080390.1:16205524-16205535promoter 内 3483-3494 bp - 507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16202153-16205017(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr02G001033 Chr02 NC_080388.1:18275572-18275583promoter 内 3478-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 18276095-18279205(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr02G001315 Chr02 NC_080388.1:24463387-24463398promoter 内 3478-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24459765-24462875(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G001181 Chr01 NC_080387.1:23860880-23860891promoter 内 3469-3480 bp - 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23859430-23860359(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTATGACGTGTC
SmilChr01G000514 Chr01 NC_080387.1:10564761-10564772promoter 内 3464-3475 bp + 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 10565298-10568405(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G001225 Chr01 NC_080387.1:24538123-24538134promoter 内 3461-3472 bp - 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24531958-24537594(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTATGACGTGTC
SmilChr02G000429 Chr02 NC_080388.1:5491743-5491754promoter 内 3459-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 5488388-5491212(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G000473 Chr01 NC_080387.1:9655178-9655189promoter 内 3454-3465 bp - 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 9650730-9654642(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G000776 Chr01 NC_080387.1:16872695-16872706promoter 内 3451-3462 bp - 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16873245-16883623(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCACAA
SmilChr03G001903 Chr03 NC_080389.1:26590981-26590992promoter 内 3438-3449 bp + 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 26591544-26594763(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr02G001721 Chr02 NC_080388.1:31661764-31661775promoter 内 3435-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 31662330-31665400(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr02G000187 Chr02 NC_080388.1:2347191-2347202promoter 内 3430-3441 bp + 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2347762-2349042(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTTCGACGTGGA
SmilChr02G001373 Chr02 NC_080388.1:25976102-25976113promoter 内 3416-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 25972695-25975528(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G004155 Chr01 NC_080387.1:60062278-60062289promoter 内 3393-3404 bp + 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 60062886-60068092(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGTGACGTGTA
SmilChr01G000513 Chr01 NC_080387.1:10554208-10554219promoter 内 3390-3401 bp + 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 10554819-10557684(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr03G002951 Chr03 NC_080389.1:46232176-46232187promoter 内 3382-3393 bp + 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 46228713-46231568(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGAAC
SmilChr01G000456 Chr01 NC_080387.1:9330440-9330451promoter 内 3376-3387 bp + 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 9331065-9334016(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr03G004052 Chr03 NC_080389.1:59481909-59481920promoter 内 3376-3387 bp - 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 59473631-59481295(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGTGACGTGAT
SmilChr01G003973 Chr01 NC_080387.1:58167355-58167366promoter 内 3350-3361 bp + 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 58164188-58166715(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGAAA
SmilChr03G004713 Chr03 NC_080389.1:64386956-64386967promoter 内 3350-3361 bp + 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 64383621-64386316(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGAAC
SmilChr03G000398 Chr03 NC_080389.1:4342545-4342556promoter 内 3332-3343 bp + 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 4340710-4341887(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATTG
SmilChr01G000539 Chr01 NC_080387.1:11072075-11072086promoter 内 3252-3263 bp - 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 11072824-11074457(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACTT
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SmilChr02G002526 Chr02 NC_080388.1:43953007-43953018promoter 内 3203-3214 bp - 787 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 43953805-43955960(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCACA
SmilChr01G002715 Chr01 NC_080387.1:45408072-45408083promoter 内 3193-3204 bp + 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 45408880-45418329(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGTC
SmilChr02G001418 Chr02 NC_080388.1:26808930-26808941promoter 内 3167-3178 bp + 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 26809764-26810826(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATGACGTGAG
SmilChr03G003642 Chr03 NC_080389.1:55099847-55099858promoter 内 3139-3150 bp - 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55097370-55098996(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTTCGACGTGGT
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SmilChr04G001738 Chr04 NC_080390.1:28626931-28626942promoter 内 3028-3039 bp + 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 28621910-28625969(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGAAC
SmilChr03G003419 Chr03 NC_080389.1:52538278-52538289promoter 内 3005-3016 bp - 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 52531900-52537293(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAACGACGTGGT
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SmilChr03G002735 Chr03 NC_080389.1:43485067-43485078promoter 内 2882-2893 bp - 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 43486186-43490448(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGTTT