转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 114 / 149 下载 TSV

上一页 114 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003050 Chr05 NC_080391.1:38271040-38271050promoter 内 1820-1830 bp - 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 38273221-38273979(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr02G005063 Chr02 NC_080388.1:72322938-72322948promoter 内 1551-1561 bp - 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72318466-72320498(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr03G003732 Chr03 NC_080389.1:56353339-56353349promoter 内 1532-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56355808-56360808(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr03G000664 Chr03 NC_080389.1:7438056-7438066promoter 内 1507-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7440550-7442221(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr01G000622 Chr01 NC_080387.1:13930395-13930405promoter 内 1495-1505 bp - 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13932901-13935849(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr03G001649 Chr03 NC_080389.1:21447236-21447246promoter 内 1413-1423 bp - 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 21427909-21444658(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr01G002042 Chr01 NC_080387.1:36096868-36096878promoter 内 1408-1418 bp + 2583 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 36091412-36094285(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr03G001572 Chr03 NC_080389.1:19859123-19859133promoter 内 1362-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19853416-19856494(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr02G000512 Chr02 NC_080388.1:7082106-7082116promoter 内 1275-1285 bp - 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7076226-7079390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr01G004922 Chr01 NC_080387.1:67301173-67301183promoter 内 1272-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 67303902-67303973(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr05G002331 Chr05 NC_080391.1:25172107-25172117promoter 内 1234-1244 bp - 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 25163997-25169350(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr03G000195 Chr03 NC_080389.1:2183847-2183857promoter 内 1230-1240 bp - 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2178065-2181086(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr05G002327 Chr05 NC_080391.1:25105899-25105909promoter 内 1222-1232 bp - 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 25097661-25103130(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr06G002250 Chr06 NC_080392.1:31925810-31925820promoter 内 1186-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 31920323-31923005(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr03G002732 Chr03 NC_080389.1:43420713-43420723promoter 内 1108-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43414949-43417830(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr01G001055 Chr01 NC_080387.1:21894075-21894085promoter 内 1066-1076 bp - 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 21887929-21891150(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr01G000732 Chr01 NC_080387.1:16291012-16291022promoter 内 1027-1037 bp + 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 16287167-16288048(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr05G002613 Chr05 NC_080391.1:29414094-29414104promoter 内 1017-1027 bp + 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 29408325-29411120(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr06G001322 Chr06 NC_080392.1:13743042-13743052promoter 内 1001-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13735491-13740052(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr05G003051 Chr05 NC_080391.1:38271040-38271050promoter 内 973-983 bp - 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 38274068-38274871(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr07G002103 Chr07 NC_080393.1:19124000-19124010promoter 内 754-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19127247-19129416(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr01G006073 Chr01 NC_080387.1:76163609-76163619promoter 内 750-760 bp + 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 76166860-76175433(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr02G004844 Chr02 NC_080388.1:70567411-70567421promoter 内 748-758 bp + 3243 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 70570664-70571957(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr07G002086 Chr07 NC_080393.1:18973661-18973671promoter 内 738-748 bp - 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18976924-18978780(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr01G003099 Chr01 NC_080387.1:49794367-49794377promoter 内 655-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49797713-49799255(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr05G001784 Chr05 NC_080391.1:17573367-17573377promoter 内 568-578 bp + 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 17566128-17569944(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr01G001229 Chr01 NC_080387.1:24578089-24578099promoter 内 552-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 24569064-24574650(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr04G003055 Chr04 NC_080390.1:47140204-47140214promoter 内 518-528 bp + 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47135548-47136731(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr04G001548 Chr04 NC_080390.1:25584953-25584963promoter 内 488-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 25578979-25581450(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr07G002957 Chr07 NC_080393.1:30047660-30047670promoter 内 464-474 bp + 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 30042192-30044133(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr06G001266 Chr06 NC_080392.1:13215732-13215742promoter 内 416-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13219317-13221743(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr07G001359 Chr07 NC_080393.1:10539071-10539081promoter 内 359-369 bp + 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10531922-10535439(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr01G004079 Chr01 NC_080387.1:59208925-59208935promoter 内 327-337 bp + 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59212599-59214259(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr02G000958 Chr02 NC_080388.1:16667950-16667960promoter 内 316-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 16671635-16675520(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGAGCTGTCC
SmilChr04G001118 Chr04 NC_080390.1:16192676-16192686promoter 内 299-309 bp - 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 16188334-16188984(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr01G004923 Chr01 NC_080387.1:67301173-67301183promoter 内 252-262 bp + 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 67304922-67304993(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr05G000786 Chr05 NC_080391.1:6144855-6144865promoter 内 252-262 bp - 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6140027-6141116(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr01G005900 Chr01 NC_080387.1:74907266-74907276promoter 内 243-253 bp + 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 74901583-74903518(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr05G000645 Chr05 NC_080391.1:4886044-4886054promoter 内 239-249 bp - 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4889806-4890300(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr03G002406 Chr03 NC_080389.1:38190661-38190671promoter 内 174-184 bp - 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 38173463-38186844(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr01G005904 Chr01 NC_080387.1:74925137-74925147promoter 内 132-142 bp - 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 74919083-74921278(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr01G002776 Chr01 NC_080387.1:46198265-46198275promoter 内 79-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46202187-46210470(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr04G001762 Chr04 NC_080390.1:28982802-28982812promoter 内 28-38 bp - 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 28986775-28987281(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAC
SmilChr04G003142 Chr04 NC_080390.1:47993079-47993089promoter 内 3929-3939 bp + 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 47993151-48004402(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTGGCTGTCA
SmilChr01G002013 Chr01 NC_080387.1:35680172-35680182promoter 内 3890-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 35676485-35680071(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTGGCTGTCA
SmilChr02G002950 Chr02 NC_080388.1:50039752-50039762promoter 内 3177-3187 bp + 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 50038232-50038938(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGC
SmilChr03G000808 Chr03 NC_080389.1:9236138-9236148promoter 内 2971-2981 bp - 1020 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 9237168-9238748(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTT
SmilChr02G003640 Chr02 NC_080388.1:57762637-57762647promoter 内 2345-2355 bp - 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 57756494-57760991(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCG
SmilChr01G003685 Chr01 NC_080387.1:55232300-55232310promoter 内 2003-2013 bp - 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 55234298-55235568(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAG
SmilChr03G000946 Chr03 NC_080389.1:10742836-10742846promoter 内 1416-1426 bp - 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 10739515-10740261(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCT