转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 12 / 149 下载 TSV

上一页 12 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000985 Chr05 NC_080391.1:7980471-7980481promoter 内 521-531 bp - 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 7976363-7977001(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr01G002364 Chr01 NC_080387.1:40802719-40802729promoter 内 481-491 bp + 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 40806239-40815704(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr01G000310 Chr01 NC_080387.1:6009855-6009865promoter 内 380-390 bp - 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6013476-6058274(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTG
SmilChr01G000164 Chr01 NC_080387.1:2727381-2727391promoter 内 230-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 2731152-2731907(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCGG
SmilChr02G003413 Chr02 NC_080388.1:55308861-55308871promoter 内 37-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 55292135-55304907(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr01G004320 Chr01 NC_080387.1:61368586-61368596promoter 内 15-25 bp + 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 61372572-61375018(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCA
SmilChr06G001007 Chr06 NC_080392.1:9967288-9967298promoter 内 3809-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 9967480-9967972(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr01G005718 Chr01 NC_080387.1:73371689-73371699promoter 内 1340-1350 bp + 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 73374350-73376322(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCA
SmilChr01G003323 Chr01 NC_080387.1:51933216-51933226promoter 内 1322-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 51929249-51930547(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCC
SmilChr01G004965 Chr01 NC_080387.1:67745518-67745528promoter 内 3821-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 67742964-67745348(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr05G001007 Chr05 NC_080391.1:8273625-8273635promoter 内 3555-3565 bp - 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 8274071-8277762(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr05G001006 Chr05 NC_080391.1:8245868-8245878promoter 内 3465-3475 bp - 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 8246404-8248998(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr05G003332 Chr05 NC_080391.1:43711555-43711565promoter 内 3346-3356 bp + 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 43708546-43710910(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr02G004342 Chr02 NC_080388.1:65673968-65673978promoter 内 3088-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 65674881-65678148(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCA
SmilChr06G000611 Chr06 NC_080392.1:5275061-5275071promoter 内 2517-2527 bp + 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 5265840-5273587(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr01G001868 Chr01 NC_080387.1:33676667-33676677promoter 内 2425-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 33678243-33680006(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr02G004341 Chr02 NC_080388.1:65673968-65673978promoter 内 2423-2433 bp + 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 65669848-65672400(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr01G004259 Chr01 NC_080387.1:60853218-60853228promoter 内 2414-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 60854805-60856481(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr01G001912 Chr01 NC_080387.1:34265164-34265174promoter 内 2251-2261 bp - 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 34266914-34268749(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr04G000984 Chr04 NC_080390.1:13311070-13311080promoter 内 2178-2188 bp + 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 13312893-13392871(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCC
SmilChr06G002290 Chr06 NC_080392.1:32919698-32919708promoter 内 1904-1914 bp - 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 32916812-32917611(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCC
SmilChr01G005717 Chr01 NC_080387.1:73371689-73371699promoter 内 1756-1766 bp + 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 73368484-73369454(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr05G004294 Chr05 NC_080391.1:56685208-56685218promoter 内 1666-1676 bp - 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 56680717-56682883(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCA
SmilChr02G002436 Chr02 NC_080388.1:42480787-42480797promoter 内 1446-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 42476395-42478242(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCA
SmilChr06G001997 Chr06 NC_080392.1:25463226-25463236promoter 内 1223-1233 bp - 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 25466004-25468718(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr04G000616 Chr04 NC_080390.1:6956968-6956978promoter 内 925-935 bp - 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 6960044-6962334(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr01G000555 Chr01 NC_080387.1:11576766-11576776promoter 内 918-928 bp - 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 11571615-11573693(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCC
SmilChr01G000774 Chr01 NC_080387.1:16865949-16865959promoter 内 622-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 16859469-16862580(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCC
SmilChr01G001267 Chr01 NC_080387.1:25357154-25357164promoter 内 616-626 bp + 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 25352681-25353779(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr02G000453 Chr02 NC_080388.1:6035871-6035881promoter 内 594-604 bp - 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 6028130-6032474(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCC
SmilChr03G002786 Chr03 NC_080389.1:44377648-44377658promoter 内 208-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 44370390-44373865(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGG
SmilChr06G001008 Chr06 NC_080392.1:9967288-9967298promoter 内 3-13 bp - 3988 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 9971286-9973336(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAC
SmilChr06G001980 Chr06 NC_080392.1:25193213-25193223promoter 内 3775-3785 bp + 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 6 25193439-25195096(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G001077 Chr04 NC_080390.1:15454033-15454043promoter 内 894-904 bp + 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 6 15457140-15458507(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G000590 Chr01 NC_080387.1:12827157-12827167promoter 内 325-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 6 12820889-12823491(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr02G000609 Chr02 NC_080388.1:8892868-8892878promoter 内 2837-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 8894032-8900571(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr02G000930 Chr02 NC_080388.1:16201734-16201744promoter 内 688-698 bp - 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 16205047-16214520(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr06G001842 Chr06 NC_080392.1:21617283-21617293promoter 内 498-508 bp + 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 21620786-21622113(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G001055 Chr04 NC_080390.1:15020346-15020356promoter 内 3617-3627 bp + 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 15020730-15023338(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr02G001863 Chr02 NC_080388.1:33878111-33878121promoter 内 2946-2956 bp + 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 33879166-33880307(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G003001 Chr05 NC_080391.1:37130041-37130051promoter 内 2748-2758 bp - 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 37131294-37131878(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr02G001554 Chr02 NC_080388.1:28831604-28831614promoter 内 2624-2634 bp - 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 28829675-28830237(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G002021 Chr03 NC_080389.1:30244220-30244230promoter 内 2565-2575 bp - 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 30236730-30242794(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G003258 Chr05 NC_080391.1:42108570-42108580promoter 内 2392-2402 bp - 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 42110179-42111174(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr02G002050 Chr02 NC_080388.1:36916490-36916500promoter 内 2164-2174 bp - 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 36918327-36927870(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr02G000912 Chr02 NC_080388.1:15780214-15780224promoter 内 2130-2140 bp - 1861 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 15778015-15778353(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G001184 Chr04 NC_080390.1:17984991-17985001promoter 内 1880-1890 bp + 2111 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 17987112-17989627(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G002034 Chr05 NC_080391.1:21162141-21162151promoter 内 1766-1776 bp - 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 21164376-21166848(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr02G001432 Chr02 NC_080388.1:27024335-27024345promoter 内 1716-1726 bp + 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 27026620-27037270(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G001890 Chr03 NC_080389.1:26389903-26389913promoter 内 1602-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 26385874-26387514(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA