转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 18 / 149 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001046 Chr05 NC_080391.1:8626380-8626390promoter 内 2491-2501 bp - 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 8623771-8624880(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
SmilChr05G001047 Chr05 NC_080391.1:8634967-8634977promoter 内 2491-2501 bp - 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 8632358-8633467(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
SmilChr01G001310 Chr01 NC_080387.1:26043838-26043848promoter 内 2344-2354 bp + 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 26045495-26046293(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
SmilChr04G002609 Chr04 NC_080390.1:41498283-41498293promoter 内 2190-2200 bp - 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 41495415-41496482(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
SmilChr04G002312 Chr04 NC_080390.1:37436135-37436145promoter 内 2186-2196 bp - 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 37433374-37434330(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
SmilChr05G001192 Chr05 NC_080391.1:9987654-9987664promoter 内 2116-2126 bp + 1875 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 9989539-9992850(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
SmilChr03G000044 Chr03 NC_080389.1:493629-493639promoter 内 1942-1952 bp + 2049 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 487964-491580(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGA
SmilChr01G001829 Chr01 NC_080387.1:33233349-33233359promoter 内 1931-1941 bp - 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 33227865-33231289(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCG
SmilChr01G000408 Chr01 NC_080387.1:8333934-8333944promoter 内 1375-1385 bp - 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 8329720-8331318(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
SmilChr04G002313 Chr04 NC_080390.1:37436135-37436145promoter 内 1223-1233 bp - 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 37438913-37443356(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr02G002091 Chr02 NC_080388.1:37542196-37542206promoter 内 1144-1154 bp + 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 37538642-37539349(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr03G002295 Chr03 NC_080389.1:36147611-36147621promoter 内 634-644 bp - 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 36150978-36156889(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr02G002668 Chr02 NC_080388.1:46183367-46183377promoter 内 443-453 bp + 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 46186925-46187875(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCG
SmilChr03G004267 Chr03 NC_080389.1:61152289-61152299promoter 内 3926-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 61151847-61152224(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACGGCTGTCA
SmilChr04G001965 Chr04 NC_080390.1:31878961-31878971promoter 内 3865-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 31879097-31880597(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGA
SmilChr03G001545 Chr03 NC_080389.1:19385354-19385364promoter 内 3839-3849 bp + 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 19383634-19385202(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr01G005364 Chr01 NC_080387.1:70870668-70870678promoter 内 3675-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 70864563-70870352(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACGGCTGTCA
SmilChr06G000685 Chr06 NC_080392.1:6058350-6058360promoter 内 3646-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 6058705-6061755(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGA
SmilChr02G000112 Chr02 NC_080388.1:1427784-1427794promoter 内 3600-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 1426595-1427393(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACGGCTGTCA
SmilChr03G001171 Chr03 NC_080389.1:13466612-13466622promoter 内 3540-3550 bp + 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 13464853-13466161(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr06G002757 Chr06 NC_080392.1:40160125-40160135promoter 内 3535-3545 bp - 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 40160591-40161925(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr04G000376 Chr04 NC_080390.1:3788244-3788254promoter 内 3474-3484 bp - 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3788771-3790013(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr01G004301 Chr01 NC_080387.1:61186253-61186263promoter 内 3454-3464 bp - 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 61186800-61187971(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr04G002610 Chr04 NC_080390.1:41498283-41498293promoter 内 3419-3429 bp - 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 41498865-41499871(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr07G002543 Chr07 NC_080393.1:24139824-24139834promoter 内 3383-3393 bp + 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 24137542-24139216(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr04G000361 Chr04 NC_080390.1:3594330-3594340promoter 内 3352-3362 bp - 639 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3594979-3596101(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr02G002256 Chr02 NC_080388.1:39995457-39995467promoter 内 3312-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 39996146-40004715(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCG
SmilChr02G001931 Chr02 NC_080388.1:34716221-34716231promoter 内 3276-3286 bp - 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 34716946-34717989(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr03G000355 Chr03 NC_080389.1:3976550-3976560promoter 内 3275-3285 bp - 716 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3977276-3978322(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr01G002409 Chr01 NC_080387.1:41461288-41461298promoter 内 3180-3190 bp - 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 41462109-41463061(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr06G000522 Chr06 NC_080392.1:4301565-4301575promoter 内 3178-3188 bp - 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 4302388-4303335(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr02G003500 Chr02 NC_080388.1:56211982-56211992promoter 内 2810-2820 bp + 1181 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56206043-56210801(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGA
SmilChr02G005141 Chr02 NC_080388.1:72827909-72827919promoter 内 2776-2786 bp + 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 72829134-72829556(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCG
SmilChr03G000253 Chr03 NC_080389.1:2996191-2996201promoter 内 2752-2762 bp + 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 2993546-2994952(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC
SmilChr02G003708 Chr02 NC_080388.1:58638025-58638035promoter 内 2676-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 58634544-58636710(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGA
SmilChr02G003554 Chr02 NC_080388.1:56724020-56724030promoter 内 2517-2527 bp + 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56717584-56722546(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGA
SmilChr02G002016 Chr02 NC_080388.1:36316017-36316027promoter 内 2514-2524 bp - 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 36313282-36314540(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
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SmilChr04G000065 Chr04 NC_080390.1:587643-587653promoter 内 2438-2448 bp + 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 589206-590540(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCG
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SmilChr01G006100 Chr01 NC_080387.1:76484332-76484342promoter 内 2288-2298 bp + 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 76486045-76487897(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCG
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SmilChr04G001360 Chr04 NC_080390.1:22079048-22079058promoter 内 2017-2027 bp + 1974 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 22081032-22087702(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCG
SmilChr03G000643 Chr03 NC_080389.1:7132853-7132863promoter 内 2004-2014 bp - 1987 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7127426-7130866(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAGGCTGTCA
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SmilChr03G000466 Chr03 NC_080389.1:5002314-5002324promoter 内 1840-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 4977151-5000163(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGC