转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 21 / 149 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003156 Chr01 NC_080387.1:50360430-50360440promoter 内 377-387 bp + 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 50364054-50367034(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCT
SmilChr04G001019 Chr04 NC_080390.1:14252382-14252392promoter 内 255-265 bp - 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 14246309-14248646(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGGAA
SmilChr01G004068 Chr01 NC_080387.1:59107092-59107102promoter 内 3970-3980 bp - 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 59107123-59109816(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGG
SmilChr03G001718 Chr03 NC_080389.1:23048386-23048396promoter 内 3950-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 23048437-23049338(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr02G002356 Chr02 NC_080388.1:41345060-41345070promoter 内 3908-3918 bp - 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 41344284-41344977(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr03G001675 Chr03 NC_080389.1:21982455-21982465promoter 内 3882-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 21982574-21983407(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr01G004916 Chr01 NC_080387.1:67195355-67195365promoter 内 3752-3762 bp - 239 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 67193509-67195116(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCT
SmilChr02G004873 Chr02 NC_080388.1:70816071-70816081promoter 内 3739-3749 bp + 252 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 70807608-70815819(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr05G004200 Chr05 NC_080391.1:55862419-55862429promoter 内 3319-3329 bp - 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 55863101-55865906(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr06G002766 Chr06 NC_080392.1:40267417-40267427promoter 内 3268-3278 bp - 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 40261066-40266694(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCT
SmilChr03G003634 Chr03 NC_080389.1:55025130-55025140promoter 内 3108-3118 bp + 883 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 55022605-55024247(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGG
SmilChr02G005172 Chr02 NC_080388.1:73026876-73026886promoter 内 3034-3044 bp - 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 73027843-73038259(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr02G002865 Chr02 NC_080388.1:48818051-48818061promoter 内 2886-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 48813301-48816946(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCT
SmilChr02G002567 Chr02 NC_080388.1:44667383-44667393promoter 内 2818-2828 bp - 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 44668566-44675433(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGG
SmilChr05G001623 Chr05 NC_080391.1:15094132-15094142promoter 内 2728-2738 bp + 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 15089812-15092869(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr01G002383 Chr01 NC_080387.1:41052152-41052162promoter 内 2595-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 41053558-41055142(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr02G002400 Chr02 NC_080388.1:41883720-41883730promoter 内 2524-2534 bp + 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 41885197-41886517(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCT
SmilChr04G001814 Chr04 NC_080390.1:29637572-29637582promoter 内 2200-2210 bp - 1791 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 29639373-29642256(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGG
SmilChr05G000338 Chr05 NC_080391.1:2515211-2515221promoter 内 2072-2082 bp + 1919 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 2517140-2530900(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr05G000214 Chr05 NC_080391.1:1689016-1689026promoter 内 1857-1867 bp - 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 1683802-1686882(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr06G002910 Chr06 NC_080392.1:41948078-41948088promoter 内 1840-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 41943215-41945927(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr06G000767 Chr06 NC_080392.1:7149820-7149830promoter 内 1748-1758 bp + 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 7146709-7147577(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr04G002119 Chr04 NC_080390.1:34183729-34183739promoter 内 1715-1725 bp - 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 34177739-34181453(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr05G000337 Chr05 NC_080391.1:2515211-2515221promoter 内 1466-1476 bp + 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 2509793-2512686(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr02G004109 Chr02 NC_080388.1:63386005-63386015promoter 内 1439-1449 bp - 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 63388567-63394413(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr04G003464 Chr04 NC_080390.1:51120782-51120792promoter 内 1382-1392 bp + 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 51123401-51126909(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr04G001484 Chr04 NC_080390.1:24268523-24268533promoter 内 1347-1357 bp - 2644 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 24271177-24288406(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr03G000333 Chr03 NC_080389.1:3774812-3774822promoter 内 1312-1322 bp + 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 3777501-3780755(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr01G000572 Chr01 NC_080387.1:11867792-11867802promoter 内 1153-1163 bp + 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 11861723-11864954(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGG
SmilChr02G003497 Chr02 NC_080388.1:56198282-56198292promoter 内 945-955 bp - 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 56201338-56201897(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr03G000352 Chr03 NC_080389.1:3949835-3949845promoter 内 879-889 bp + 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 3943991-3946723(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr05G001852 Chr05 NC_080391.1:18541566-18541576promoter 内 816-826 bp - 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 18544751-18545591(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr05G002168 Chr05 NC_080391.1:22985166-22985176promoter 内 500-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 22988667-22991068(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAT
SmilChr07G000658 Chr07 NC_080393.1:4435442-4435452promoter 内 341-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 4439102-4444012(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGG
SmilChr07G002689 Chr07 NC_080393.1:26250662-26250672promoter 内 316-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 26254347-26256261(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCA
SmilChr03G001776 Chr03 NC_080389.1:24220811-24220821promoter 内 209-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 24214085-24217029(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGG
SmilChr04G000931 Chr04 NC_080390.1:12123432-12123442promoter 内 3830-3840 bp - 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 4 12123603-12124324(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGA
SmilChr06G001920 Chr06 NC_080392.1:23211649-23211659promoter 内 3842-3852 bp + 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 23204893-23211500(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGA
SmilChr06G001921 Chr06 NC_080392.1:23211649-23211659promoter 内 3755-3765 bp + 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 23204970-23211413(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGA
SmilChr07G001320 Chr07 NC_080393.1:10142765-10142775promoter 内 3336-3346 bp - 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 10143430-10143798(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGA
SmilChr06G002034 Chr06 NC_080392.1:26532472-26532482promoter 内 3045-3055 bp + 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 26531420-26531526(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr03G001472 Chr03 NC_080389.1:17563769-17563779promoter 内 2213-2223 bp - 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 17560909-17561991(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr05G000838 Chr05 NC_080391.1:6614792-6614802promoter 内 3864-3874 bp + 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 6614929-6633581(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCT
SmilChr04G001104 Chr04 NC_080390.1:15808907-15808917promoter 内 3751-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 15806728-15808667(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr01G004239 Chr01 NC_080387.1:60711311-60711321promoter 内 3293-3303 bp + 698 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 60712019-60715266(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr01G004237 Chr01 NC_080387.1:60710435-60710445promoter 内 3115-3125 bp + 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 60709018-60709559(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr03G001033 Chr03 NC_080389.1:12030564-12030574promoter 内 3010-3020 bp - 981 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 12031555-12031661(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr04G000815 Chr04 NC_080390.1:10240088-10240098promoter 内 3000-3010 bp - 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 10241089-10241194(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr06G002284 Chr06 NC_080392.1:32860801-32860811promoter 内 2997-3007 bp + 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 32859702-32859807(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr01G004236 Chr01 NC_080387.1:60710435-60710445promoter 内 2661-2671 bp + 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 60708292-60709105(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA