转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 21 / 164 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G004320 Chr05 NC_080391.1:56860636-56860650promoter 内 2637-2651 bp + 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 56856445-56859286(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTTACCTACCACACT
SmilChr03G001968 Chr03 NC_080389.1:28370173-28370187promoter 内 2623-2637 bp + 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 28367274-28368809(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCAATT
SmilChr03G003034 Chr03 NC_080389.1:47249079-47249093promoter 内 2579-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 47244691-47247671(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACGTT
SmilChr07G003990 Chr07 NC_080393.1:50963958-50963972promoter 内 2535-2549 bp - 1452 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 50956390-50962506(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTATGGTAGGTGGA
SmilChr01G003195 Chr01 NC_080387.1:50709275-50709289promoter 内 2507-2521 bp - 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 50705893-50707795(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAAGTGGTAGGTGAA
SmilChr04G000942 Chr04 NC_080390.1:12477774-12477788promoter 内 2473-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 12479302-12480618(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCAATT
SmilChr04G000943 Chr04 NC_080390.1:12487118-12487132promoter 内 2473-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 12488646-12489962(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCAATT
SmilChr07G002611 Chr07 NC_080393.1:25136005-25136019promoter 内 2003-2017 bp - 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25138003-25138950(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCAACCAACTT
SmilChr04G001204 Chr04 NC_080390.1:18594737-18594751promoter 内 1620-1634 bp - 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 18589429-18592370(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTAGGGGTAGGTGGA
SmilChr03G003894 Chr03 NC_080389.1:58044472-58044486promoter 内 1586-1600 bp - 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 58046887-58050554(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCTTAAT
SmilChr07G002627 Chr07 NC_080393.1:25346439-25346453promoter 内 1560-1574 bp - 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25340173-25344012(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAATTGGTAGGTAGG
SmilChr06G001765 Chr06 NC_080392.1:20629214-20629228promoter 内 1418-1432 bp - 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20622925-20626645(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGTTGGTTGGTGAA
SmilChr02G000344 Chr02 NC_080388.1:4498188-4498202promoter 内 748-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 4492434-4494949(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATGGCGGTAGGTGGG
SmilChr07G000585 Chr07 NC_080393.1:3996873-3996887promoter 内 703-717 bp - 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 4000171-4002213(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCAACTG
SmilChr05G001966 Chr05 NC_080391.1:20230021-20230035promoter 内 466-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20224348-20226500(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTTGTGGTAGGTGGC
SmilChr05G001721 Chr05 NC_080391.1:16490957-16490971promoter 内 456-470 bp - 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 16485265-16487426(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAAAAGGTAGGTGAG
SmilChr01G003198 Chr01 NC_080387.1:50748842-50748856promoter 内 286-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 50752557-50757349(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCTCCC
SmilChr07G001688 Chr07 NC_080393.1:14296041-14296055promoter 内 2090-2104 bp - 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 5 14297952-14298932(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr01G000114 Chr01 NC_080387.1:1965016-1965030promoter 内 3941-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 1965076-1968156(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTT
SmilChr08G001683 Chr08 NC_080394.1:14051270-14051284promoter 内 3924-3938 bp - 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 14051347-14053811(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr01G003498 Chr01 NC_080387.1:53583289-53583303promoter 内 3906-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 53580587-53583208(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr01G003497 Chr01 NC_080387.1:53573106-53573120promoter 内 3892-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 53570372-53573011(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr07G001687 Chr07 NC_080393.1:14286545-14286559promoter 内 2089-2103 bp - 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 14288457-14289437(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr01G003496 Chr01 NC_080387.1:53573106-53573120promoter 内 365-379 bp + 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 53566328-53569484(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr05G002623 Chr05 NC_080391.1:29559929-29559943promoter 内 3949-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 29557008-29559891(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr01G000115 Chr01 NC_080387.1:1974641-1974655promoter 内 3941-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 1974701-1977781(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTT
SmilChr03G004138 Chr03 NC_080389.1:60223114-60223128promoter 内 3108-3122 bp + 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 60224007-60233480(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGGAAGTAGGTGGG
SmilChr04G000492 Chr04 NC_080390.1:5368278-5368292promoter 内 1410-1424 bp + 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 5364503-5365701(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr05G000240 Chr05 NC_080391.1:1838061-1838075promoter 内 3960-3974 bp - 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 1838102-1840714(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACCACCAT
SmilChr05G002621 Chr05 NC_080391.1:29535127-29535141promoter 内 3949-3963 bp - 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 29535179-29538062(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr07G003733 Chr07 NC_080393.1:45384618-45384632promoter 内 3915-3929 bp - 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 45384704-45387551(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr07G002910 Chr07 NC_080393.1:29494370-29494384promoter 内 3762-3776 bp + 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 29494609-29495284(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAATTGGTAGGTAGG
SmilChr01G001740 Chr01 NC_080387.1:32041028-32041042promoter 内 3089-3103 bp - 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 32041940-32046946(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCCCACT
SmilChr03G002358 Chr03 NC_080389.1:37188950-37188964promoter 内 3073-3087 bp + 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 37186934-37188036(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCCCC
SmilChr04G002356 Chr04 NC_080390.1:38043540-38043554promoter 内 2358-2372 bp - 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 38045183-38046468(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCTC
SmilChr02G002163 Chr02 NC_080388.1:38861540-38861554promoter 内 2101-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 38852543-38859654(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGGAAGTAGGTGGG
SmilChr03G003129 Chr03 NC_080389.1:48456628-48456642promoter 内 908-922 bp - 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 48459721-48465168(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCAATTT
SmilChr03G004190 Chr03 NC_080389.1:60576938-60576952promoter 内 3975-3989 bp + 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 60573544-60576926(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCTCAA
SmilChr05G000661 Chr05 NC_080391.1:4982767-4982781promoter 内 3971-3985 bp - 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 4982797-4992411(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCACAAT
SmilChr04G003726 Chr04 NC_080390.1:53594465-53594479promoter 内 3953-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 53590583-53594431(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCAAAC
SmilChr07G002655 Chr07 NC_080393.1:25735218-25735232promoter 内 3705-3719 bp + 282 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 25729871-25734936(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCAAATC
SmilChr07G001993 Chr07 NC_080393.1:17566812-17566826promoter 内 3683-3697 bp + 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 17567130-17569894(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATGAGGTAGGTGAA
SmilChr03G002357 Chr03 NC_080389.1:37185500-37185514promoter 内 3429-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 37183503-37184942(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCCCC
SmilChr07G001595 Chr07 NC_080393.1:13260609-13260623promoter 内 2922-2936 bp - 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 13255764-13259544(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGGGGTAGGTGAA
SmilChr03G001815 Chr03 NC_080389.1:24820319-24820333promoter 内 2920-2934 bp + 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 24821400-24833993(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCTTGGTAGGTGGA
SmilChr02G000846 Chr02 NC_080388.1:14371446-14371460promoter 内 2722-2736 bp + 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 14366159-14370181(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAACCTACCAACTT
SmilChr02G001516 Chr02 NC_080388.1:28276797-28276811promoter 内 2471-2485 bp - 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 28275200-28275281(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGGGGTAGGTGAA
SmilChr07G002283 Chr07 NC_080393.1:21108297-21108311promoter 内 2384-2398 bp - 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 21109914-21113782(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACCAACTC
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SmilChr03G002801 Chr03 NC_080389.1:44491495-44491509promoter 内 1774-1788 bp + 2213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 44493722-44496954(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGGAAGTAGGTGGG