转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 26 / 143 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003297 Chr07 NC_080393.1:34787971-34787982promoter 内 835-846 bp - 3155 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 34777694-34784816(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr03G004197 Chr03 NC_080389.1:60616215-60616226promoter 内 789-800 bp - 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 60611047-60613014(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGAA
SmilChr02G001545 Chr02 NC_080388.1:28704110-28704121promoter 内 745-756 bp + 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 28699559-28700865(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAA
SmilChr04G002684 Chr04 NC_080390.1:42291490-42291501promoter 内 662-673 bp + 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 42285729-42288162(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr04G002609 Chr04 NC_080390.1:41499831-41499842promoter 内 641-652 bp - 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 41495415-41496482(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGG
SmilChr01G000774 Chr01 NC_080387.1:16865948-16865959promoter 内 622-633 bp + 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 16859469-16862580(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCCC
SmilChr02G000453 Chr02 NC_080388.1:6035870-6035881promoter 内 594-605 bp + 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 6028130-6032474(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCCC
SmilChr03G003029 Chr03 NC_080389.1:47220911-47220922promoter 内 539-550 bp - 3451 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 47215559-47217460(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGAG
SmilChr05G003082 Chr05 NC_080391.1:38953540-38953551promoter 内 536-547 bp + 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 38957005-38979398(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr08G002711 Chr08 NC_080394.1:26714841-26714852promoter 内 527-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26709513-26711378(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr02G004928 Chr02 NC_080388.1:71289416-71289427promoter 内 506-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 71292911-71295909(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr01G000604 Chr01 NC_080387.1:13155248-13155259promoter 内 441-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 13148705-13151699(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr03G003230 Chr03 NC_080389.1:50019276-50019287promoter 内 437-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 50022840-50025478(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr06G001348 Chr06 NC_080392.1:14038717-14038728promoter 内 386-397 bp + 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 14042332-14044888(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr06G001388 Chr06 NC_080392.1:14514600-14514611promoter 内 380-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 14518221-14518344(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr02G000320 Chr02 NC_080388.1:4004759-4004770promoter 内 369-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 4008391-4009094(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATC
SmilChr03G000870 Chr03 NC_080389.1:9876939-9876950promoter 内 308-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9880632-9885394(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr06G000084 Chr06 NC_080392.1:621591-621602promoter 内 262-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 617296-617863(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTT
SmilChr05G003316 Chr05 NC_080391.1:43427858-43427869promoter 内 226-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 43431633-43434853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr03G002786 Chr03 NC_080389.1:44377648-44377659promoter 内 207-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 44370390-44373865(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGGG
SmilChr05G003647 Chr05 NC_080391.1:48903821-48903832promoter 内 193-204 bp - 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 48907629-48912151(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAA
SmilChr07G002455 Chr07 NC_080393.1:23069639-23069650promoter 内 162-173 bp + 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 23061821-23065811(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr04G003151 Chr04 NC_080390.1:48129822-48129833promoter 内 31-42 bp - 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 48124911-48125863(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGAA
SmilChr08G001561 Chr08 NC_080394.1:12858930-12858941promoter 内 3810-3821 bp - 180 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 12858678-12858750(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGT
SmilChr08G001560 Chr08 NC_080394.1:12858930-12858941promoter 内 2386-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 12855086-12857326(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGT
SmilChr07G002335 Chr07 NC_080393.1:21656885-21656896promoter 内 1629-1640 bp - 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 21652070-21654524(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTA
SmilChr07G000378 Chr07 NC_080393.1:2554770-2554781promoter 内 1117-1128 bp - 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 2557654-2560703(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCCT
SmilChr08G003154 Chr08 NC_080394.1:32048399-32048410promoter 内 322-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 32044022-32044731(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGC
SmilChr07G004520 Chr07 NC_080393.1:57879213-57879224promoter 内 3195-3206 bp - 795 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 57878280-57878418(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTG
SmilChr03G002620 Chr03 NC_080389.1:41595895-41595906promoter 内 3017-3028 bp - 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 41596879-41597391(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCTA
SmilChr01G002493 Chr01 NC_080387.1:42681365-42681376promoter 内 2601-2612 bp + 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 42676562-42679976(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAT
SmilChr01G004477 Chr01 NC_080387.1:62874357-62874368promoter 内 2273-2284 bp + 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 62876085-62878174(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTA
SmilChr04G001461 Chr04 NC_080390.1:24028677-24028688promoter 内 2018-2029 bp + 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 24023750-24026705(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCCC
SmilChr07G004610 Chr07 NC_080393.1:58888751-58888762promoter 内 1784-1795 bp - 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 58884605-58886545(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGGT
SmilChr07G002723 Chr07 NC_080393.1:26717515-26717526promoter 内 1614-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 26719902-26721853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCTA
SmilChr03G004431 Chr03 NC_080389.1:62458466-62458477promoter 内 1609-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 62460858-62462834(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAC
SmilChr05G001739 Chr05 NC_080391.1:16817787-16817798promoter 内 1404-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 16810049-16815201(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCCT
SmilChr01G003323 Chr01 NC_080387.1:51933215-51933226promoter 内 1322-1333 bp + 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 51929249-51930547(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCCA
SmilChr08G002473 Chr08 NC_080394.1:23636436-23636447promoter 内 1252-1263 bp + 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 23631820-23633698(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAT
SmilChr04G001896 Chr04 NC_080390.1:30984266-30984277promoter 内 858-869 bp + 3132 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 30980469-30981134(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCTA
SmilChr06G001167 Chr06 NC_080392.1:11899447-11899458promoter 内 843-854 bp + 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 11892172-11896300(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCCC
SmilChr03G001776 Chr03 NC_080389.1:24220811-24220822promoter 内 208-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 24214085-24217029(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGGG
SmilChr02G004081 Chr02 NC_080388.1:63092310-63092321promoter 内 3939-3950 bp - 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 63092372-63096688(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAC
SmilChr01G004916 Chr01 NC_080387.1:67195354-67195365promoter 内 3752-3763 bp + 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 67193509-67195116(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCTT
SmilChr02G004646 Chr02 NC_080388.1:68896689-68896700promoter 内 3516-3527 bp - 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 68897174-68903776(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAC
SmilChr02G001955 Chr02 NC_080388.1:35285754-35285765promoter 内 3476-3487 bp - 514 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 35286279-35288543(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCAA
SmilChr05G004049 Chr05 NC_080391.1:54480890-54480901promoter 内 3410-3421 bp - 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 54481481-54486420(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCAA
SmilChr05G003332 Chr05 NC_080391.1:43711555-43711566promoter 内 3345-3356 bp - 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 43708546-43710910(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGGG
SmilChr06G002766 Chr06 NC_080392.1:40267416-40267427promoter 内 3268-3279 bp + 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 40261066-40266694(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCTT
SmilChr01G003337 Chr01 NC_080387.1:52113432-52113443promoter 内 3146-3157 bp + 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 52114287-52114425(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTG