转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 29 / 139 下载 TSV

上一页 29 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004472 Chr01 NC_080387.1:62818258-62818269promoter 内 419-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 62821840-62825865(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr02G001921 Chr02 NC_080388.1:34611357-34611368promoter 内 265-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 34615093-34616120(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCAGCG
SmilChr01G000725 Chr01 NC_080387.1:16167726-16167737promoter 内 85-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 16171642-16173010(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCG
SmilChr04G003369 Chr04 NC_080390.1:50267501-50267512promoter 内 3959-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50259961-50267470(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATGA
SmilChr01G001167 Chr01 NC_080387.1:23704846-23704857promoter 内 3950-3961 bp + 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 23704897-23715789(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr01G005178 Chr01 NC_080387.1:69515700-69515711promoter 内 3949-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 69512361-69515659(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGGT
SmilChr01G001209 Chr01 NC_080387.1:24312125-24312136promoter 内 3945-3956 bp + 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 24312181-24321725(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr04G000917 Chr04 NC_080390.1:11923693-11923704promoter 内 3941-3952 bp - 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 11921453-11923644(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGAC
SmilChr04G004131 Chr04 NC_080390.1:56133564-56133575promoter 内 3818-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56133747-56135357(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr03G002130 Chr03 NC_080389.1:33144407-33144418promoter 内 3775-3786 bp - 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 33144633-33146677(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCAGCC
SmilChr04G000797 Chr04 NC_080390.1:9849941-9849952promoter 内 3731-3742 bp - 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 9846531-9849682(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr04G002701 Chr04 NC_080390.1:42515298-42515309promoter 内 3716-3727 bp + 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 42515583-42517194(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TAGTGACGTGGC
SmilChr01G004164 Chr01 NC_080387.1:60132750-60132761promoter 内 3683-3694 bp - 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 60133068-60134915(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCG
SmilChr03G000943 Chr03 NC_080389.1:10708696-10708707promoter 内 3644-3655 bp + 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 10707604-10708350(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTA
SmilChr03G000946 Chr03 NC_080389.1:10740607-10740618promoter 内 3644-3655 bp + 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 10739515-10740261(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTA
SmilChr04G003753 Chr04 NC_080390.1:53801341-53801352promoter 内 3630-3641 bp - 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 53801712-53804937(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACC
SmilChr01G005934 Chr01 NC_080387.1:75104349-75104360promoter 内 3594-3605 bp - 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 75099219-75103953(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGGC
SmilChr02G004027 Chr02 NC_080388.1:62546859-62546870promoter 内 3552-3563 bp + 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 62542073-62546421(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGCA
SmilChr02G002633 Chr02 NC_080388.1:45703065-45703076promoter 内 3227-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 45702231-45702302(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr03G003585 Chr03 NC_080389.1:54489650-54489661promoter 内 3163-3174 bp - 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54486704-54488823(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGGG
SmilChr03G000028 Chr03 NC_080389.1:372040-372051promoter 内 3161-3172 bp - 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 372880-373925(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACC
SmilChr01G000333 Chr01 NC_080387.1:6778745-6778756promoter 内 3160-3171 bp - 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6779586-6783573(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr02G000526 Chr02 NC_080388.1:7240757-7240768promoter 内 2950-2961 bp - 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 7241808-7243071(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr04G002351 Chr04 NC_080390.1:37949101-37949112promoter 内 2908-2919 bp + 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37946001-37948019(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACG
SmilChr01G001562 Chr01 NC_080387.1:29639133-29639144promoter 内 2904-2915 bp - 1086 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 29635032-29638047(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr01G000308 Chr01 NC_080387.1:5999166-5999177promoter 内 2874-2885 bp - 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6000293-6003053(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr02G001075 Chr02 NC_080388.1:19159918-19159929promoter 内 2815-2826 bp - 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 19161104-19164105(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCC
SmilChr01G001102 Chr01 NC_080387.1:22548257-22548268promoter 内 2801-2812 bp + 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 22549457-22555678(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr01G003072 Chr01 NC_080387.1:49567945-49567956promoter 内 2792-2803 bp - 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 49569154-49572987(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCG
SmilChr03G001773 Chr03 NC_080389.1:24184333-24184344promoter 内 2790-2801 bp + 1200 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 24180198-24183133(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCC
SmilChr01G005008 Chr01 NC_080387.1:68118479-68118490promoter 内 2766-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 68114845-68117255(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCATGACGTGGC
SmilChr02G000898 Chr02 NC_080388.1:15416580-15416591promoter 内 2749-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15417832-15420844(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCC
SmilChr02G003835 Chr02 NC_080388.1:60042765-60042776promoter 内 2723-2734 bp + 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 60033926-60041498(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCAGCG
SmilChr01G001449 Chr01 NC_080387.1:28202375-28202386promoter 内 2563-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 28196534-28200948(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAACT
SmilChr01G001650 Chr01 NC_080387.1:30560485-30560496promoter 内 2563-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 30553005-30559058(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr04G000728 Chr04 NC_080390.1:8585277-8585288promoter 内 2467-2478 bp - 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 8582907-8583754(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGGT
SmilChr02G001898 Chr02 NC_080388.1:34276861-34276872promoter 内 2386-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 34271505-34275257(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGT
SmilChr04G003370 Chr04 NC_080390.1:50267501-50267512promoter 内 2370-2381 bp + 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50269132-50270825(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCATGACGTGGC
SmilChr02G000733 Chr02 NC_080388.1:11900281-11900292promoter 内 2355-2366 bp + 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 11901927-11905414(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGAC
SmilChr01G005584 Chr01 NC_080387.1:72526805-72526816promoter 内 2261-2272 bp + 1729 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72528545-72529494(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr04G003176 Chr04 NC_080390.1:48442533-48442544promoter 内 2213-2224 bp + 1777 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 48437990-48440756(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACC
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SmilChr03G003860 Chr03 NC_080389.1:57689143-57689154promoter 内 2119-2130 bp + 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 57682363-57687272(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAAGA
SmilChr04G002780 Chr04 NC_080390.1:43602265-43602276promoter 内 2080-2091 bp + 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 43598453-43600355(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr02G002045 Chr02 NC_080388.1:36832779-36832790promoter 内 1833-1844 bp + 2157 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 36829845-36830622(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAAGA
SmilChr04G001868 Chr04 NC_080390.1:30477245-30477256promoter 内 1830-1841 bp - 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 30472475-30475085(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGGT
SmilChr01G004978 Chr01 NC_080387.1:67836154-67836165promoter 内 1756-1767 bp - 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 67838399-67842346(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAACC
SmilChr01G004398 Chr01 NC_080387.1:62116618-62116629promoter 内 1682-1693 bp + 2308 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 62118937-62120651(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGCGACGTGGG
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SmilChr01G005995 Chr01 NC_080387.1:75549064-75549075promoter 内 1567-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 75543753-75546641(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATGA