转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 30 / 139 下载 TSV

上一页 30 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005589 Chr01 NC_080387.1:72562036-72562047promoter 内 1564-1575 bp + 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72558686-72559610(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr01G001165 Chr01 NC_080387.1:23671067-23671078promoter 内 1520-1531 bp + 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 23673548-23687383(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGT
SmilChr01G001744 Chr01 NC_080387.1:32130246-32130257promoter 内 1504-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 32127392-32127760(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAACG
SmilChr01G005179 Chr01 NC_080387.1:69515700-69515711promoter 内 1504-1515 bp - 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 69518197-69522787(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCC
SmilChr02G000569 Chr02 NC_080388.1:8036387-8036398promoter 内 1442-1453 bp + 2548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 8038946-8040914(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGGT
SmilChr03G001531 Chr03 NC_080389.1:19119972-19119983promoter 内 1418-1429 bp + 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 19116541-19117400(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCG
SmilChr01G005568 Chr01 NC_080387.1:72470839-72470850promoter 内 1415-1426 bp + 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72465758-72468264(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr01G005574 Chr01 NC_080387.1:72485894-72485905promoter 内 1397-1408 bp - 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72488498-72489364(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr04G003066 Chr04 NC_080390.1:47204964-47204975promoter 内 1354-1365 bp - 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 47202256-47202328(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGGG
SmilChr01G005582 Chr01 NC_080387.1:72526805-72526816promoter 内 1280-1291 bp + 2710 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72523486-72524095(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr01G000617 Chr01 NC_080387.1:13608775-13608786promoter 内 1242-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 13611534-13614649(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr01G005563 Chr01 NC_080387.1:72430802-72430813promoter 内 1188-1199 bp + 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72433615-72435844(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr01G005562 Chr01 NC_080387.1:72433876-72433887promoter 内 1147-1158 bp - 2843 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72428708-72431033(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr05G000216 Chr05 NC_080391.1:1701559-1701570promoter 内 1132-1143 bp + 2858 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1695699-1698701(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCG
SmilChr04G000422 Chr04 NC_080390.1:4491096-4491107promoter 内 884-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 4481287-4487990(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGT
SmilChr03G000025 Chr03 NC_080389.1:372040-372051promoter 内 879-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 368414-368929(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTTGACGTGGA
SmilChr04G001039 Chr04 NC_080390.1:14749367-14749378promoter 内 786-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 14752582-14753629(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCC
SmilChr01G000164 Chr01 NC_080387.1:2727922-2727933promoter 内 771-782 bp - 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 2731152-2731907(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr03G000029 Chr03 NC_080389.1:372040-372051promoter 内 766-777 bp - 3224 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 375275-377717(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACC
SmilChr01G005531 Chr01 NC_080387.1:72168993-72169004promoter 内 726-737 bp - 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72162633-72165729(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr02G001899 Chr02 NC_080388.1:34276861-34276872promoter 内 715-726 bp - 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 34280147-34282700(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCG
SmilChr01G005566 Chr01 NC_080387.1:72460506-72460517promoter 内 675-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72451656-72457191(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr04G002038 Chr04 NC_080390.1:33100467-33100478promoter 内 644-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 33096335-33097121(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACC
SmilChr02G003160 Chr02 NC_080388.1:52647449-52647460promoter 内 637-648 bp - 3353 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 52650813-52654043(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCC
SmilChr02G002309 Chr02 NC_080388.1:40714495-40714506promoter 内 609-620 bp + 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 40702226-40711114(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACG
SmilChr04G001788 Chr04 NC_080390.1:29329270-29329281promoter 内 548-559 bp + 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 29324042-29325828(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACC
SmilChr01G005022 Chr01 NC_080387.1:68204433-68204444promoter 内 516-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 68197204-68200959(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGGG
SmilChr02G004955 Chr02 NC_080388.1:71506088-71506099promoter 内 515-526 bp + 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 71495321-71502613(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCG
SmilChr01G005461 Chr01 NC_080387.1:71627159-71627170promoter 内 342-353 bp + 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 71618637-71623511(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAA
SmilChr03G001477 Chr03 NC_080389.1:17769715-17769726promoter 内 290-301 bp - 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 17773426-17774232(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAA
SmilChr04G003126 Chr04 NC_080390.1:47879508-47879519promoter 内 248-259 bp - 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 47874381-47875766(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGGG
SmilChr01G006199 Chr01 NC_080387.1:77681379-77681390promoter 内 227-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 77685153-77690418(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACCT
SmilChr01G005564 Chr01 NC_080387.1:72446031-72446042promoter 内 81-92 bp - 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72440327-72442122(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr04G003102 Chr04 NC_080390.1:47610542-47610553promoter 内 67-78 bp - 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 47606548-47606619(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr03G001530 Chr03 NC_080389.1:19116693-19116704promoter 内 62-73 bp - 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 19111906-19112765(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGAC
SmilChr02G005598 Chr02 NC_080388.1:75713583-75713594promoter 内 52-63 bp - 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 75708951-75709645(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGGA
SmilChr04G001941 Chr04 NC_080390.1:31523859-31523870promoter 内 32-43 bp + 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31527828-31531785(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr04G000107 Chr04 NC_080390.1:948370-948381promoter 内 3696-3707 bp + 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 10 948675-952430(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGGCGACGTGGT
SmilChr02G004844 Chr02 NC_080388.1:70570635-70570646promoter 内 3972-3983 bp + 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 70570664-70571957(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGCCACGTGGC
SmilChr01G000567 Chr01 NC_080387.1:11743489-11743500promoter 内 2957-2968 bp + 1033 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 11739553-11742456(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGCCG
SmilChr03G003630 Chr03 NC_080389.1:54971481-54971492promoter 内 2644-2655 bp + 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 54972838-54974617(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGCC
SmilChr03G000859 Chr03 NC_080389.1:9821096-9821107promoter 内 2331-2342 bp + 1659 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 9813814-9819437(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTCCA
SmilChr03G000967 Chr03 NC_080389.1:10938189-10938200promoter 内 1689-1700 bp + 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 10940501-10942103(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGAGACGTGGC
SmilChr04G000074 Chr04 NC_080390.1:691815-691826promoter 内 3944-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 691872-693812(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGACG
SmilChr02G001455 Chr02 NC_080388.1:27222666-27222677promoter 内 3679-3690 bp - 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 27222988-27224878(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGCCT
SmilChr02G001055 Chr02 NC_080388.1:18819491-18819502promoter 内 3650-3661 bp + 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 18819842-18819997(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGCGACGTGGG
SmilChr02G001058 Chr02 NC_080388.1:18827553-18827564promoter 内 3650-3661 bp + 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 18827904-18828059(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGCGACGTGGG
SmilChr02G000138 Chr02 NC_080388.1:1865994-1866005promoter 内 3625-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 1864280-1865629(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGGCGACGTGGT
SmilChr04G002818 Chr04 NC_080390.1:44230387-44230398promoter 内 3342-3353 bp - 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 44231046-44233744(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGCCC
SmilChr02G001056 Chr02 NC_080388.1:18819491-18819502promoter 内 3266-3277 bp + 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 18820226-18823614(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGCGACGTGGG