转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 35 / 126 下载 TSV

上一页 35 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001537 Chr06 NC_080392.1:16631142-16631156promoter 内 820-834 bp - 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 16625597-16627975(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAATATGACGTGGCA
SmilChr01G006125 Chr01 NC_080387.1:76758694-76758708promoter 内 361-375 bp - 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 76762334-76763963(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCTGCAAT
SmilChr04G003903 Chr04 NC_080390.1:54801805-54801819promoter 内 3945-3959 bp - 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54801861-54808607(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCAGCAAT
SmilChr03G003251 Chr03 NC_080389.1:50391792-50391806promoter 内 3931-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50387876-50391736(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTACACACGTGGCA
SmilChr02G003955 Chr02 NC_080388.1:61709933-61709947promoter 内 3923-3937 bp - 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 61704822-61709869(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAAGTGACGTGGCG
SmilChr01G004043 Chr01 NC_080387.1:58842198-58842212promoter 内 3866-3880 bp - 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 58842333-58846746(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTTACA
SmilChr03G001283 Chr03 NC_080389.1:15014428-15014442promoter 内 3846-3860 bp + 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15014583-15017645(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGTAAAGACGTGGCA
SmilChr02G004555 Chr02 NC_080388.1:68082101-68082115promoter 内 3818-3832 bp + 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 68078785-68081932(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCGGGC
SmilChr05G001098 Chr05 NC_080391.1:9145233-9145247promoter 内 3759-3773 bp - 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 9145475-9147912(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTGTTTT
SmilChr02G003312 Chr02 NC_080388.1:54363582-54363596promoter 内 3722-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54362925-54363317(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATAAAGACGTGGCA
SmilChr01G001709 Chr01 NC_080387.1:31558779-31558793promoter 内 3572-3586 bp - 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31559208-31560709(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCTCACAA
SmilChr08G003182 Chr08 NC_080394.1:32552222-32552236promoter 内 3567-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 32552656-32561997(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATATTT
SmilChr08G003005 Chr08 NC_080394.1:30122106-30122120promoter 内 3559-3573 bp - 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 30122548-30127311(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTAAGT
SmilChr03G003252 Chr03 NC_080389.1:50391792-50391806promoter 内 3321-3335 bp - 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50392472-50396682(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTGTAAT
SmilChr08G001706 Chr08 NC_080394.1:14274412-14274426promoter 内 3272-3286 bp + 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 14275141-14276903(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGAGCGACGTGGCG
SmilChr06G000941 Chr06 NC_080392.1:9035126-9035140promoter 内 2955-2969 bp - 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 9032293-9034094(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCGTCACACGTGGCA
SmilChr06G002091 Chr06 NC_080392.1:27692594-27692608promoter 内 2770-2784 bp + 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 27686960-27691377(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCGCTCCT
SmilChr01G003372 Chr01 NC_080387.1:52442235-52442249promoter 内 2500-2514 bp + 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 52436918-52440748(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCGCCATA
SmilChr03G000174 Chr03 NC_080389.1:1903528-1903542promoter 内 2225-2239 bp - 1762 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1901080-1901766(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGACACACGTGGCA
SmilChr08G002506 Chr08 NC_080394.1:24118095-24118109promoter 内 2168-2182 bp + 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 24114131-24116276(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTACCAC
SmilChr06G000679 Chr06 NC_080392.1:6002230-6002244promoter 内 1963-1977 bp - 2024 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6004268-6009556(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTTCTGC
SmilChr03G003755 Chr03 NC_080389.1:56663597-56663611promoter 内 1821-1835 bp + 2166 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56660572-56661431(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCACCGCC
SmilChr07G004324 Chr07 NC_080393.1:55798528-55798542promoter 内 1577-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 55795193-55796118(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGTATC
SmilChr04G003425 Chr04 NC_080390.1:50845531-50845545promoter 内 1522-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50848010-50851163(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTGTCAC
SmilChr03G003756 Chr03 NC_080389.1:56663597-56663611promoter 内 1467-1481 bp + 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56666131-56670986(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGGTGACGTGGCT
SmilChr08G003522 Chr08 NC_080394.1:37822101-37822115promoter 内 1437-1451 bp + 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37824665-37825477(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGGCGCGACGTGGCA
SmilChr08G003471 Chr08 NC_080394.1:37334094-37334108promoter 内 1377-1391 bp + 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37328225-37331484(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCAGGA
SmilChr04G001810 Chr04 NC_080390.1:29595613-29595627promoter 内 1168-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 29583579-29592794(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATATTT
SmilChr01G002168 Chr01 NC_080387.1:37768000-37768014promoter 内 1090-1104 bp + 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37763587-37765103(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTTACA
SmilChr04G000009 Chr04 NC_080390.1:146255-146269promoter 内 819-833 bp - 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 149437-150968(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGGACTC
SmilChr02G005289 Chr02 NC_080388.1:73900688-73900702promoter 内 787-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 73895707-73897488(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCGGCGCC
SmilChr01G005481 Chr01 NC_080387.1:71789381-71789395promoter 内 765-779 bp + 3222 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 71780374-71786159(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTGGTCTTT
SmilChr04G003263 Chr04 NC_080390.1:49363215-49363229promoter 内 579-593 bp + 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 49359417-49359807(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCAGGA
SmilChr03G000295 Chr03 NC_080389.1:3395227-3395241promoter 内 526-540 bp + 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 3388576-3391766(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGATCAAG
SmilChr01G002030 Chr01 NC_080387.1:35873433-35873447promoter 内 475-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 35869139-35869921(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTGTTTT
SmilChr02G005324 Chr02 NC_080388.1:74112389-74112403promoter 内 433-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 74115957-74117456(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTGTGCACC
SmilChr01G005483 Chr01 NC_080387.1:71789381-71789395promoter 内 429-443 bp + 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 71792953-71796786(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAGACCACGTGGCC
SmilChr01G002191 Chr01 NC_080387.1:38057809-38057823promoter 内 344-358 bp + 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 38061466-38062409(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCCTGACACGTGGCA
SmilChr08G004499 Chr08 NC_080394.1:54611076-54611090promoter 内 84-98 bp + 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54614993-54615295(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCGAACACGTGGCG
SmilChr06G001227 Chr06 NC_080392.1:12662601-12662615promoter 内 50-64 bp - 3937 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 12666552-12667605(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCACCGCC
SmilChr01G001537 Chr01 NC_080387.1:29398585-29398599promoter 内 1380-1394 bp - 2607 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 29394965-29395978(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAAATGACGTGGCA
SmilChr01G006039 Chr01 NC_080387.1:75890304-75890318promoter 内 3942-3956 bp + 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 75886241-75890259(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCACCC
SmilChr01G000273 Chr01 NC_080387.1:5442986-5443000promoter 内 3929-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 5443058-5444817(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAACGACACGTGTCA
SmilChr01G005065 Chr01 NC_080387.1:68547117-68547131promoter 内 3916-3930 bp + 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 68543297-68547046(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCACCC
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SmilChr02G005384 Chr02 NC_080388.1:74496203-74496217promoter 内 3794-3808 bp + 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 74494794-74496010(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGCCA
SmilChr08G004491 Chr08 NC_080394.1:54537828-54537842promoter 内 3693-3707 bp - 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 54538136-54540667(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGACTCA
SmilChr04G000449 Chr04 NC_080390.1:4761736-4761750promoter 内 3287-3301 bp + 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 4759286-4761036(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTTTTT
SmilChr06G003218 Chr06 NC_080392.1:44949250-44949264promoter 内 3222-3236 bp - 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 44950029-44952565(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTTTTT