转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 35 / 164 下载 TSV

上一页 35 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004807 Chr01 NC_080387.1:66263379-66263393promoter 内 783-797 bp + 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 66266597-66270367(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGCAGGTAGGTGTG
SmilChr02G000222 Chr02 NC_080388.1:2886652-2886666promoter 内 752-766 bp + 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 2882983-2883417(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTCTCC
SmilChr01G005047 Chr01 NC_080387.1:68408037-68408051promoter 内 712-726 bp + 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 68401320-68404762(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCTACCTACTG
SmilChr03G000209 Chr03 NC_080389.1:2400156-2400170promoter 内 678-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 2403479-2406045(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCTGCTC
SmilChr03G004426 Chr03 NC_080389.1:62415142-62415156promoter 内 556-570 bp + 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 62407789-62411711(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACTAAATT
SmilChr06G002253 Chr06 NC_080392.1:31973320-31973334promoter 内 525-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31968864-31969858(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGGAGAGTAGGTGGG
SmilChr03G004569 Chr03 NC_080389.1:63607506-63607520promoter 内 361-375 bp - 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 63602340-63603880(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTTTGGTAGTTGGG
SmilChr05G002206 Chr05 NC_080391.1:23519700-23519714promoter 内 359-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23523342-23525067(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAATTGGTAGGTTGG
SmilChr03G004185 Chr03 NC_080389.1:60549909-60549923promoter 内 345-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 60553565-60555593(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATGTGGGTAGGTGGT
SmilChr01G003589 Chr01 NC_080387.1:54430648-54430662promoter 内 306-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54434343-54437470(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTAAGCA
SmilChr02G003814 Chr02 NC_080388.1:59765242-59765256promoter 内 277-291 bp + 3710 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 59759174-59761532(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCTACCAAAAA
SmilChr02G003786 Chr02 NC_080388.1:59524491-59524505promoter 内 233-247 bp + 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 59518475-59520737(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCTACCAAAAA
SmilChr07G002771 Chr07 NC_080393.1:27577374-27577388promoter 内 229-243 bp + 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 27570522-27573616(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTTACCTACCTAAAC
SmilChr04G000537 Chr04 NC_080390.1:5961908-5961922promoter 内 215-229 bp + 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 5965694-5971619(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTGTTGGTAGGTGTC
SmilChr03G004131 Chr03 NC_080389.1:60141146-60141160promoter 内 154-168 bp - 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 60144993-60155269(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCTACCTATCT
SmilChr02G003285 Chr02 NC_080388.1:54141975-54141989promoter 内 51-65 bp + 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54145925-54149459(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGTTGGTTGGTGTA
SmilChr03G004464 Chr03 NC_080389.1:62734407-62734421promoter 内 3747-3761 bp + 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 62714551-62734167(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCTAATG
SmilChr01G002584 Chr01 NC_080387.1:43971480-43971494promoter 内 3446-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 43970859-43970939(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTTACCTACCCATCT
SmilChr04G000855 Chr04 NC_080390.1:10818790-10818804promoter 内 3385-3399 bp - 602 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 10817802-10818188(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGAAGGTAGGTGCA
SmilChr01G002702 Chr01 NC_080387.1:45290522-45290536promoter 内 315-329 bp - 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 45294208-45295405(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTCCCTT
SmilChr02G002117 Chr02 NC_080388.1:37916209-37916223promoter 内 3946-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 37914969-37916168(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr05G003429 Chr05 NC_080391.1:45527119-45527133promoter 内 3939-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 45524163-45527071(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCATTA
SmilChr08G001986 Chr08 NC_080394.1:17578223-17578237promoter 内 3898-3912 bp + 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 17575282-17578134(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCCTAA
SmilChr06G002629 Chr06 NC_080392.1:37858833-37858847promoter 内 3886-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 37858948-37861803(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCATTA
SmilChr06G002336 Chr06 NC_080392.1:33900017-33900031promoter 内 3255-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 33900763-33916362(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCAGAGGTAGGTGGC
SmilChr02G001377 Chr02 NC_080388.1:26053577-26053591promoter 内 2866-2880 bp + 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 26054712-26057441(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGCTTGGTAGGTGCA
SmilChr03G004471 Chr03 NC_080389.1:62802750-62802764promoter 内 2848-2862 bp - 1139 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 62800487-62801611(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CATTAGGTAGGTAGG
SmilChr01G001271 Chr01 NC_080387.1:25409462-25409476promoter 内 2779-2793 bp + 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 25402670-25408254(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCAAACC
SmilChr03G004626 Chr03 NC_080389.1:63924615-63924629promoter 内 2761-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 63919830-63923389(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCAACCAACTT
SmilChr03G003016 Chr03 NC_080389.1:47076038-47076052promoter 内 2625-2639 bp - 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 47067788-47074676(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGTTGGTTGGTTGG
SmilChr03G000301 Chr03 NC_080389.1:3434074-3434088promoter 内 2041-2055 bp - 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 3436034-3437409(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCCGTTC
SmilChr08G001843 Chr08 NC_080394.1:15804975-15804989promoter 内 1452-1466 bp + 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 15807524-15814605(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TATATGGTAGGTAAG
SmilChr01G005017 Chr01 NC_080387.1:68172743-68172757promoter 内 1112-1126 bp + 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 68167299-68169868(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCCATAA
SmilChr03G004467 Chr03 NC_080389.1:62734407-62734421promoter 内 854-868 bp + 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 62726166-62731274(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCTAATG
SmilChr06G002628 Chr06 NC_080392.1:37858833-37858847promoter 内 463-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 37851251-37855309(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAATGGGTAGGTAGG
SmilChr03G000750 Chr03 NC_080389.1:8580868-8580882promoter 内 435-449 bp - 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 8584434-8585764(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCTAATG
SmilChr02G003451 Chr02 NC_080388.1:55805555-55805569promoter 内 315-329 bp + 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 55800901-55801883(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTCCCTT
SmilChr02G003541 Chr02 NC_080388.1:56583014-56583028promoter 内 183-197 bp - 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 56575517-56579210(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGTGGGTAGGTGAT
SmilChr02G001562 Chr02 NC_080388.1:28889111-28889125promoter 内 79-93 bp - 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 28893033-28895362(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCTAACG
SmilChr06G001805 Chr06 NC_080392.1:21231556-21231570promoter 内 3982-3996 bp + 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 21228644-21231551(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr06G001804 Chr06 NC_080392.1:21221997-21222011promoter 内 3981-3995 bp + 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 21219085-21221991(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr03G003674 Chr03 NC_080389.1:55574672-55574686promoter 内 3977-3991 bp + 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55571864-55574662(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr03G003673 Chr03 NC_080389.1:55565287-55565301promoter 内 3969-3983 bp + 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55562474-55565269(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr08G001985 Chr08 NC_080394.1:17568473-17568487promoter 内 3964-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 17565532-17568450(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCCTAA
SmilChr02G002118 Chr02 NC_080388.1:37919960-37919974promoter 内 3956-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 37918720-37919929(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr08G000931 Chr08 NC_080394.1:6906367-6906381promoter 内 3941-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6894271-6906321(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr05G003428 Chr05 NC_080391.1:45517389-45517403promoter 内 3939-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 45514433-45517341(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCATTA
SmilChr07G001041 Chr07 NC_080393.1:7624339-7624353promoter 内 3931-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 7621263-7624283(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr07G001043 Chr07 NC_080393.1:7634021-7634035promoter 内 3931-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 7630945-7633965(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCCATC
SmilChr07G004162 Chr07 NC_080393.1:53498156-53498170promoter 内 3928-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 53498229-53499318(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCATTA