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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 47 / 121 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001820 Chr01 NC_080387.1:33136412-33136426promoter 内 3585-3599 bp - 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 33133079-33136010(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr03G001174 Chr03 NC_080389.1:13497343-13497357promoter 内 3569-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 13497775-13500713(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr03G001173 Chr03 NC_080389.1:13487035-13487049promoter 内 3564-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 13487472-13490429(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr03G001172 Chr03 NC_080389.1:13476726-13476740promoter 内 3562-3576 bp + 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 13477165-13480092(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr03G003113 Chr03 NC_080389.1:48257269-48257283promoter 内 3542-3556 bp + 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 48257728-48260814(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr02G000720 Chr02 NC_080388.1:11591666-11591680promoter 内 3530-3544 bp + 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 11592137-11595069(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr03G000642 Chr03 NC_080389.1:7077040-7077054promoter 内 3514-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 7077527-7080412(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr02G003763 Chr02 NC_080388.1:59309819-59309833promoter 内 3511-3525 bp + 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 59310309-59313153(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr02G003201 Chr02 NC_080388.1:53171114-53171128promoter 内 3509-3523 bp - 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 53167782-53170636(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr04G000360 Chr04 NC_080390.1:3563463-3563477promoter 内 3506-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 3563958-3566851(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr01G001664 Chr01 NC_080387.1:30721083-30721097promoter 内 3449-3463 bp + 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 30719296-30720545(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTCACTTC
SmilChr03G000962 Chr03 NC_080389.1:10860726-10860740promoter 内 3377-3391 bp + 610 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 10858831-10860116(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTCACTTC
SmilChr05G001192 Chr05 NC_080391.1:9988915-9988929promoter 内 3377-3391 bp - 610 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 9989539-9992850(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCTCAATGT
SmilChr01G000182 Chr01 NC_080387.1:3133154-3133168promoter 内 3341-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 3133814-3136631(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr01G000183 Chr01 NC_080387.1:3142940-3142954promoter 内 3341-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 3143600-3146417(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr01G001424 Chr01 NC_080387.1:27873389-27873403promoter 内 3130-3144 bp + 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 27874260-27874855(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCGCCCAGATCTGAT
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SmilChr01G006034 Chr01 NC_080387.1:75868311-75868325promoter 内 2644-2658 bp + 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 75864334-75866968(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATAGATCTAGATTC
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SmilChr01G006196 Chr01 NC_080387.1:77619493-77619507promoter 内 2438-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 77615967-77617944(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTGTCGCT
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SmilChr02G000832 Chr02 NC_080388.1:14091984-14091998promoter 内 2117-2131 bp - 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 14093868-14096579(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTCACTTC
SmilChr01G000181 Chr01 NC_080387.1:3133154-3133168promoter 内 2068-2082 bp + 1919 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 3129296-3131235(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTCACTTC
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SmilChr04G002210 Chr04 NC_080390.1:35766773-35766787promoter 内 1817-1831 bp + 2170 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 35768957-35769506(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGAAACAGATCTGAC
SmilChr02G001170 Chr02 NC_080388.1:21513576-21513590promoter 内 1781-1795 bp + 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 21515796-21518855(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAGAGCAGATCTGGA
SmilChr02G001931 Chr02 NC_080388.1:34714566-34714580promoter 内 1621-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 34716946-34717989(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr01G006072 Chr01 NC_080387.1:76161100-76161114promoter 内 1596-1610 bp - 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 76157690-76158709(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
SmilChr04G003706 Chr04 NC_080390.1:53386333-53386347promoter 内 1395-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 53388939-53390608(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGCATTAGATCTGAT
SmilChr03G004331 Chr03 NC_080389.1:61666368-61666382promoter 内 1234-1248 bp - 2753 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 61669135-61676778(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTAGATCTAAATAT
SmilChr01G003345 Chr01 NC_080387.1:52224866-52224880promoter 内 1232-1246 bp - 2755 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 52220336-52222111(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GACGCCAGATCTGCT
SmilChr02G001035 Chr02 NC_080388.1:18398193-18398207promoter 内 1230-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 18393809-18395436(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTGTATGA
SmilChr01G006036 Chr01 NC_080387.1:75868311-75868325promoter 内 1178-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 75871134-75873733(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAATCTAGATCTATT
SmilChr03G001574 Chr03 NC_080389.1:19866330-19866344promoter 内 1066-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 19869265-19870366(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTCACTTC
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SmilChr02G001861 Chr02 NC_080388.1:33842523-33842537promoter 内 869-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 33829141-33839405(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
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SmilChr04G001361 Chr04 NC_080390.1:22089365-22089379promoter 内 506-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 22084731-22085884(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTAGATCTAAATAT
SmilChr03G003452 Chr03 NC_080389.1:52889260-52889274promoter 内 358-372 bp + 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 52875517-52885631(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTAGATCTAAACTT
SmilChr02G001527 Chr02 NC_080388.1:28397168-28397182promoter 内 270-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 28400899-28404000(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTTACAGATCTGAT
SmilChr03G000397 Chr03 NC_080389.1:4329889-4329903promoter 内 202-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 4325001-4326104(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
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SmilChr03G000466 Chr03 NC_080389.1:5004053-5004067promoter 内 97-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 4977151-5000163(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG
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SmilChr04G003372 Chr04 NC_080390.1:50284732-50284746promoter 内 3948-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50284785-50286515(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGCAGATCTAGACGA
SmilChr03G002119 Chr03 NC_080389.1:32936565-32936579promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 32933148-32936521(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAGTGAGATCTGAG