转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 52 / 143 下载 TSV

上一页 52 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003741 Chr05 NC_080391.1:50505724-50505735promoter 内 1218-1229 bp + 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 50498959-50502952(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGT
SmilChr07G000845 Chr07 NC_080393.1:6016056-6016067promoter 内 1113-1124 bp + 2877 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 6018944-6025920(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAG
SmilChr07G002889 Chr07 NC_080393.1:29186990-29187001promoter 内 1107-1118 bp + 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 29178772-29184107(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCCC
SmilChr02G004087 Chr02 NC_080388.1:63146438-63146449promoter 内 1106-1117 bp + 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 63149333-63150023(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr01G001832 Chr01 NC_080387.1:33272756-33272767promoter 内 1046-1057 bp - 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 33275711-33280501(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCGT
SmilChr04G001990 Chr04 NC_080390.1:32205992-32206003promoter 内 985-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32209008-32211377(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAT
SmilChr07G004021 Chr07 NC_080393.1:51293022-51293033promoter 内 981-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 51296042-51300006(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr01G005131 Chr01 NC_080387.1:69105604-69105615promoter 内 976-987 bp + 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 69108629-69110085(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr02G005049 Chr02 NC_080388.1:72219655-72219666promoter 内 959-970 bp - 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72222697-72225713(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr07G003499 Chr07 NC_080393.1:39779784-39779795promoter 内 948-959 bp - 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39775994-39776742(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr02G004305 Chr02 NC_080388.1:65428301-65428312promoter 内 937-948 bp + 3053 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 65431365-65443597(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAG
SmilChr03G002731 Chr03 NC_080389.1:43375994-43376005promoter 内 889-900 bp - 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43368980-43372893(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr04G001924 Chr04 NC_080390.1:31346980-31346991promoter 内 861-872 bp + 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31343198-31343851(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAA
SmilChr07G000402 Chr07 NC_080393.1:2770637-2770648promoter 内 844-855 bp - 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 2773794-2775039(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAT
SmilChr07G004706 Chr07 NC_080393.1:59939346-59939357promoter 内 810-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 59934084-59936166(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAC
SmilChr08G003380 Chr08 NC_080394.1:35441203-35441214promoter 内 770-781 bp + 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 35444434-35454844(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGAT
SmilChr07G002692 Chr07 NC_080393.1:26256034-26256045promoter 内 612-623 bp + 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26259423-26264419(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTC
SmilChr03G004201 Chr03 NC_080389.1:60632672-60632683promoter 内 552-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 60636121-60638293(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAA
SmilChr01G002667 Chr01 NC_080387.1:44898448-44898459promoter 内 512-523 bp + 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44886469-44894970(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr05G003998 Chr05 NC_080391.1:53873811-53873822promoter 内 486-497 bp - 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 53869692-53870307(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAG
SmilChr05G001832 Chr05 NC_080391.1:18361390-18361401promoter 内 463-474 bp - 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 18364928-18367167(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCGT
SmilChr04G004125 Chr04 NC_080390.1:56095377-56095388promoter 内 417-428 bp + 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 56098961-56100930(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr01G003185 Chr01 NC_080387.1:50604640-50604651promoter 内 369-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 50608272-50610918(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr04G002412 Chr04 NC_080390.1:38742874-38742885promoter 内 353-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 38746522-38749691(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
SmilChr07G001974 Chr07 NC_080393.1:17309963-17309974promoter 内 204-215 bp - 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17303669-17306177(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr01G002736 Chr01 NC_080387.1:45692211-45692222promoter 内 169-180 bp + 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 45696043-45696201(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAT
SmilChr03G001739 Chr03 NC_080389.1:23479209-23479220promoter 内 87-98 bp - 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23483123-23487206(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr05G001384 Chr05 NC_080391.1:12404379-12404390promoter 内 16-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 12408364-12409517(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr04G003870 Chr04 NC_080390.1:54595409-54595420promoter 内 12-23 bp + 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54599398-54602966(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAC
SmilChr04G003306 Chr04 NC_080390.1:49794724-49794735promoter 内 2-13 bp - 3988 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49789894-49790736(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr03G001391 Chr03 NC_080389.1:16505031-16505042promoter 内 415-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 5 16499300-16501456(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGA
SmilChr05G002376 Chr05 NC_080391.1:26046677-26046688promoter 内 2259-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 26042943-26044946(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr05G002033 Chr05 NC_080391.1:21159428-21159439promoter 内 2039-2050 bp - 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 21152731-21157477(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr03G000281 Chr03 NC_080389.1:3208956-3208967promoter 内 3410-3421 bp - 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 3206167-3208376(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr04G002072 Chr04 NC_080390.1:33473618-33473629promoter 内 3158-3169 bp + 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 33467828-33472786(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAAT
SmilChr02G003140 Chr02 NC_080388.1:52401771-52401782promoter 内 3150-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 52395274-52400931(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr04G003821 Chr04 NC_080390.1:54343980-54343991promoter 内 2495-2506 bp + 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 54342415-54342485(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTC
SmilChr04G003820 Chr04 NC_080390.1:54343980-54343991promoter 内 2418-2429 bp + 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 54342321-54342408(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTC
SmilChr01G005676 Chr01 NC_080387.1:73043493-73043504promoter 内 2011-2022 bp + 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 73045483-73045929(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr04G001289 Chr04 NC_080390.1:20564429-20564440promoter 内 1954-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 20566476-20567639(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGT
SmilChr06G002612 Chr06 NC_080392.1:37568774-37568785promoter 内 1822-1833 bp - 2168 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 37565396-37566606(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr06G001317 Chr06 NC_080392.1:13685832-13685843promoter 内 1681-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 13688152-13689550(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr08G003589 Chr08 NC_080394.1:38694055-38694066promoter 内 1267-1278 bp + 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 38691226-38691332(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G000093 Chr01 NC_080387.1:1667565-1667576promoter 内 921-932 bp - 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 1661439-1664496(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr05G003748 Chr05 NC_080391.1:50613942-50613953promoter 内 3987-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 50613956-50617805(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGGA
SmilChr05G004038 Chr05 NC_080391.1:54351525-54351536promoter 内 3979-3990 bp + 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 54348999-54351514(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGA
SmilChr06G001032 Chr06 NC_080392.1:10252084-10252095promoter 内 3957-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 10252128-10252563(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGA
SmilChr06G001521 Chr06 NC_080392.1:16389961-16389972promoter 内 3922-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 16389787-16389893(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAGC
SmilChr06G002410 Chr06 NC_080392.1:34846856-34846867promoter 内 3854-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 34845670-34846720(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCCA
SmilChr08G001752 Chr08 NC_080394.1:14731594-14731605promoter 内 3827-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 14731768-14733744(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT