转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 60 / 149 下载 TSV

上一页 60 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005330 Chr01 NC_080387.1:70501745-70501755promoter 内 141-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 70505605-70506920(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTT
SmilChr05G002433 Chr05 NC_080391.1:26829837-26829847promoter 内 140-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26822825-26825986(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTT
SmilChr07G001816 Chr07 NC_080393.1:15579440-15579450promoter 内 112-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15573438-15575561(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G001748 Chr02 NC_080388.1:32077896-32077906promoter 内 104-114 bp - 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32072280-32074009(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G000575 Chr01 NC_080387.1:11924078-11924088promoter 内 101-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 11927978-11931142(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr02G001380 Chr02 NC_080388.1:26124484-26124494promoter 内 101-111 bp + 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26117462-26120594(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr06G002238 Chr06 NC_080392.1:31696513-31696523promoter 内 101-111 bp + 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31689491-31692623(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr01G001654 Chr01 NC_080387.1:30608998-30609008promoter 内 77-87 bp - 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 30601165-30605084(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr02G000981 Chr02 NC_080388.1:17259860-17259870promoter 内 67-77 bp + 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17263794-17268668(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr02G005142 Chr02 NC_080388.1:72836227-72836237promoter 内 54-64 bp - 3937 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72830020-72832290(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr05G004040 Chr05 NC_080391.1:54372998-54373008promoter 内 43-53 bp - 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54376956-54384086(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGC
SmilChr02G000784 Chr02 NC_080388.1:12889596-12889606promoter 内 33-43 bp + 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 12884119-12885638(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr02G004396 Chr02 NC_080388.1:66297826-66297836promoter 内 20-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 66301807-66304825(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr05G002902 Chr05 NC_080391.1:34867948-34867958promoter 内 16-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 34871933-34875574(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr02G000020 Chr02 NC_080388.1:163927-163937promoter 内 2441-2451 bp - 1550 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 161505-162377(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr06G002410 Chr06 NC_080392.1:34846857-34846867promoter 内 3854-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 34845670-34846720(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCC
SmilChr05G004123 Chr05 NC_080391.1:55120029-55120039promoter 内 3221-3231 bp - 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 55120809-55132007(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr01G005016 Chr01 NC_080387.1:68167701-68167711promoter 内 2418-2428 bp + 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 68161119-68166128(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr01G000195 Chr01 NC_080387.1:3370936-3370946promoter 内 2213-2223 bp - 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 3372724-3373659(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr02G005335 Chr02 NC_080388.1:74196185-74196195promoter 内 1197-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 74191286-74193391(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr07G002994 Chr07 NC_080393.1:30652984-30652994promoter 内 985-995 bp - 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 30656000-30657102(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr05G003112 Chr05 NC_080391.1:39649111-39649121promoter 内 210-220 bp - 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 39652902-39655262(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGTA
SmilChr06G000774 Chr06 NC_080392.1:7263195-7263205promoter 内 3973-3983 bp - 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 7263223-7265863(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr06G000776 Chr06 NC_080392.1:7271733-7271743promoter 内 3973-3983 bp - 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 7271761-7274401(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr01G002404 Chr01 NC_080387.1:41395711-41395721promoter 内 3805-3815 bp - 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 41395907-41396679(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr07G001404 Chr07 NC_080393.1:10924089-10924099promoter 内 3783-3793 bp - 208 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 10924307-10926416(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr07G002683 Chr07 NC_080393.1:26238405-26238415promoter 内 3621-3631 bp + 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 26237298-26238035(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr02G004215 Chr02 NC_080388.1:64392132-64392142promoter 内 3486-3496 bp + 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 64388940-64391627(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr03G000775 Chr03 NC_080389.1:8837798-8837808promoter 内 3340-3350 bp - 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 8835718-8837147(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCC
SmilChr01G005121 Chr01 NC_080387.1:69016773-69016783promoter 内 3156-3166 bp + 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 69017618-69022027(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr04G002466 Chr04 NC_080390.1:39487003-39487013promoter 内 3129-3139 bp + 862 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 39487875-39498206(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCT
SmilChr02G002923 Chr02 NC_080388.1:49631472-49631482promoter 内 2977-2987 bp + 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 49629524-49630458(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGT
SmilChr01G005813 Chr01 NC_080387.1:74137848-74137858promoter 内 2948-2958 bp - 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 74130223-74136805(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCC
SmilChr01G006066 Chr01 NC_080387.1:76070467-76070477promoter 内 2932-2942 bp - 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 76071536-76075726(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr01G005553 Chr01 NC_080387.1:72364242-72364252promoter 内 2830-2840 bp + 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 72359681-72363081(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr02G001515 Chr02 NC_080388.1:28263856-28263866promoter 内 2817-2827 bp + 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 28260562-28262682(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr01G005814 Chr01 NC_080387.1:74137848-74137858promoter 内 2631-2641 bp - 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 74139218-74141307(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGTA
SmilChr02G001026 Chr02 NC_080388.1:18189172-18189182promoter 内 2600-2610 bp - 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 18186984-18187781(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr06G002251 Chr06 NC_080392.1:31933508-31933518promoter 内 2456-2466 bp - 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 31929138-31931973(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr01G000196 Chr01 NC_080387.1:3380337-3380347promoter 内 2213-2223 bp - 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 3382125-3383060(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr07G002984 Chr07 NC_080393.1:30408789-30408799promoter 内 2197-2207 bp - 1794 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 30403529-30406995(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCC
SmilChr04G001213 Chr04 NC_080390.1:18884497-18884507promoter 内 2109-2119 bp - 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 18879732-18882615(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr03G003263 Chr03 NC_080389.1:50544635-50544645promoter 内 2095-2105 bp + 1896 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 50546541-50558684(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr01G001048 Chr01 NC_080387.1:21770596-21770606promoter 内 2075-2085 bp + 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 21772522-21840439(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr06G000121 Chr06 NC_080392.1:850930-850940promoter 内 2003-2013 bp - 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 852928-859830(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr05G002325 Chr05 NC_080391.1:25082134-25082144promoter 内 1977-1987 bp + 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 25073887-25080120(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr06G002763 Chr06 NC_080392.1:40235519-40235529promoter 内 1952-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 40232458-40233480(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr02G003071 Chr02 NC_080388.1:51567828-51567838promoter 内 1849-1859 bp + 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 51561803-51565686(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGTA
SmilChr07G000291 Chr07 NC_080393.1:1881648-1881658promoter 内 1732-1742 bp + 2259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 1883917-1884622(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr02G002487 Chr02 NC_080388.1:43301642-43301652promoter 内 1688-1698 bp - 2303 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 43295034-43299339(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCC