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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 7 / 123 下载 TSV

上一页 7 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002645 Chr01 NC_080387.1:44754956-44754970promoter 内 1214-1228 bp + 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 44757743-44763466(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGGGTTGTCGGTGGC
SmilChr08G000737 Chr08 NC_080394.1:5468040-5468054promoter 内 859-873 bp + 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 5458776-5464912(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCCCGC
SmilChr07G000036 Chr07 NC_080393.1:165109-165123promoter 内 282-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 160705-161404(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACGACTCC
SmilChr03G002120 Chr03 NC_080389.1:32942049-32942063promoter 内 227-241 bp - 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 32945823-32946908(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACAAAGGG
SmilChr08G004216 Chr08 NC_080394.1:51549668-51549682promoter 内 1970-1984 bp + 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 51544308-51547651(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCACCGACACAATC
SmilChr05G000936 Chr05 NC_080391.1:7509021-7509035promoter 内 2748-2762 bp - 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 7505021-7507782(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGCTGTCGGTGGT
SmilChr06G003017 Chr06 NC_080392.1:43029379-43029393promoter 内 2232-2246 bp - 1755 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 43025343-43027624(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGCTGTCGGTGGT
SmilChr02G004139 Chr02 NC_080388.1:63672631-63672645promoter 内 679-693 bp + 3308 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 63668533-63669323(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACAATCGC
SmilChr01G000988 Chr01 NC_080387.1:20887243-20887257promoter 内 3895-3909 bp - 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 20879571-20887151(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CACAGTGTCGGTGGA
SmilChr06G000453 Chr06 NC_080392.1:3672971-3672985promoter 内 3398-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3673574-3675178(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACACGAAC
SmilChr04G002636 Chr04 NC_080390.1:41758509-41758523promoter 内 3183-3197 bp + 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 41759327-41761402(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTTGGTGTCGGTGGT
SmilChr05G000758 Chr05 NC_080391.1:5868932-5868946promoter 内 2367-2381 bp - 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 5870566-5871524(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACAAAACT
SmilChr03G002334 Chr03 NC_080389.1:36821093-36821107promoter 内 2183-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 36817041-36819289(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGCTGTCGGTGGT
SmilChr03G002413 Chr03 NC_080389.1:38376261-38376275promoter 内 1482-1496 bp + 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 38372638-38373756(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACACCAAG
SmilChr03G002415 Chr03 NC_080389.1:38382553-38382567promoter 内 1482-1496 bp + 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 38378930-38380048(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACACCAAG
SmilChr06G000454 Chr06 NC_080392.1:3672971-3672985promoter 内 1383-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3675589-3676510(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACACGAAC
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SmilChr02G002517 Chr02 NC_080388.1:43670633-43670647promoter 内 1054-1068 bp - 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 43661535-43667700(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCGTCGTCGGTGGG
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SmilChr08G004061 Chr08 NC_080394.1:49231796-49231810promoter 内 486-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 49227633-49228295(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTTTGCGTCGGTGGC
SmilChr07G004545 Chr07 NC_080393.1:58167007-58167021promoter 内 197-211 bp + 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 58160398-58163217(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACACTCCC
SmilChr03G002539 Chr03 NC_080389.1:40545353-40545367promoter 内 134-148 bp + 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 40549220-40551276(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCTTCGTCGGTGGT
SmilChr08G004196 Chr08 NC_080394.1:51362145-51362159promoter 内 105-119 bp + 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51366041-51367970(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCTGCGTCGGTGGC
SmilChr07G000630 Chr07 NC_080393.1:4256886-4256900promoter 内 1859-1873 bp - 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 4251956-4254758(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr06G002752 Chr06 NC_080392.1:40070752-40070766promoter 内 98-112 bp - 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 40074655-40075776(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGGATCC
SmilChr01G001984 Chr01 NC_080387.1:35220426-35220440promoter 内 2579-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 35221848-35224928(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr08G003663 Chr08 NC_080394.1:40409631-40409645promoter 内 2560-2574 bp - 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 40406508-40408204(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr04G001220 Chr04 NC_080390.1:19058582-19058596promoter 内 2252-2266 bp + 1735 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 19060331-19063083(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr01G001807 Chr01 NC_080387.1:33004991-33005005promoter 内 2206-2220 bp + 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 32999788-33003210(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGGATCC
SmilChr04G000285 Chr04 NC_080390.1:2636239-2636253promoter 内 2106-2120 bp - 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 2631563-2634358(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr03G000432 Chr03 NC_080389.1:4680321-4680335promoter 内 1905-1919 bp + 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 4682417-4684700(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr07G003511 Chr07 NC_080393.1:40026819-40026833promoter 内 1770-1784 bp - 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 40021803-40024602(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr06G000820 Chr06 NC_080392.1:7727760-7727774promoter 内 1347-1361 bp - 2640 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 7722643-7725120(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
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SmilChr01G005668 Chr01 NC_080387.1:72978459-72978473promoter 内 3399-3413 bp - 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 72973582-72977871(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr01G000809 Chr01 NC_080387.1:17475504-17475518promoter 内 3316-3330 bp - 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 17474079-17474833(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
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SmilChr01G001942 Chr01 NC_080387.1:34590582-34590596promoter 内 2734-2748 bp + 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 34591849-34595261(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr02G000284 Chr02 NC_080388.1:3638185-3638199promoter 内 2576-2590 bp - 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 3635326-3636774(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr07G004128 Chr07 NC_080393.1:52961421-52961435promoter 内 2573-2587 bp + 1414 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 52962849-52963940(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
SmilChr08G003023 Chr08 NC_080394.1:30364523-30364537promoter 内 2557-2571 bp - 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 30362317-30363093(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC
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SmilChr07G002865 Chr07 NC_080393.1:28827776-28827790promoter 内 2409-2423 bp - 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 28825578-28826198(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGATCCGTCGGTGGC