转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 76 / 143 下载 TSV

上一页 76 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G004285 Chr05 NC_080391.1:56644557-56644568promoter 内 1432-1443 bp + 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56638403-56641999(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGA
SmilChr03G000973 Chr03 NC_080389.1:11021092-11021103promoter 内 1356-1367 bp - 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11023737-11029542(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCTT
SmilChr05G002171 Chr05 NC_080391.1:23072406-23072417promoter 内 1355-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 23067936-23069771(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCCT
SmilChr04G003452 Chr04 NC_080390.1:51012360-51012371promoter 内 1334-1345 bp - 2656 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51005042-51009704(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCGG
SmilChr01G005240 Chr01 NC_080387.1:69950932-69950943promoter 内 1219-1230 bp - 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 69953714-69954297(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr05G003653 Chr05 NC_080391.1:49145756-49145767promoter 内 1107-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49140235-49142873(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCAG
SmilChr03G000971 Chr03 NC_080389.1:11021092-11021103promoter 内 1002-1013 bp - 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11017998-11018104(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATC
SmilChr06G001981 Chr06 NC_080392.1:25198012-25198023promoter 内 998-1009 bp + 2992 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25201015-25206921(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAC
SmilChr07G002051 Chr07 NC_080393.1:18620110-18620121promoter 内 916-927 bp - 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18623195-18627578(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr03G001404 Chr03 NC_080389.1:16626732-16626743promoter 内 893-904 bp + 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16621352-16623635(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTT
SmilChr01G005726 Chr01 NC_080387.1:73405963-73405974promoter 内 841-852 bp - 3149 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 73409123-73409703(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCT
SmilChr07G002170 Chr07 NC_080393.1:19876980-19876991promoter 内 789-800 bp - 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 19870751-19873779(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTC
SmilChr06G003258 Chr06 NC_080392.1:45244209-45244220promoter 内 650-661 bp + 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45238160-45240869(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA
SmilChr04G000869 Chr04 NC_080390.1:11197034-11197045promoter 内 644-655 bp - 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10980515-11193688(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTAGA
SmilChr06G002398 Chr06 NC_080392.1:34759099-34759110promoter 内 608-619 bp + 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 34754965-34755717(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA
SmilChr07G001266 Chr07 NC_080393.1:9738433-9738444promoter 内 551-562 bp - 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9741883-9743875(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATA
SmilChr03G004269 Chr03 NC_080389.1:61173930-61173941promoter 内 517-528 bp + 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 61165887-61170457(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr02G005181 Chr02 NC_080388.1:73110693-73110704promoter 内 483-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 73097487-73107186(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTT
SmilChr03G004560 Chr03 NC_080389.1:63551400-63551411promoter 内 388-399 bp - 3602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63555013-63557126(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCCT
SmilChr05G000623 Chr05 NC_080391.1:4702648-4702659promoter 内 370-381 bp - 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4706279-4715947(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGA
SmilChr05G002123 Chr05 NC_080391.1:22302227-22302238promoter 内 349-360 bp - 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22305879-22311853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr04G000234 Chr04 NC_080390.1:2083560-2083571promoter 内 322-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2074561-2079892(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTC
SmilChr07G000455 Chr07 NC_080393.1:3217566-3217577promoter 内 289-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3221278-3225546(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr04G000749 Chr04 NC_080390.1:9176397-9176408promoter 内 263-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9180135-9181345(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA
SmilChr05G002704 Chr05 NC_080391.1:31100309-31100320promoter 内 240-251 bp - 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 31096126-31096559(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTG
SmilChr02G004975 Chr02 NC_080388.1:71642095-71642106promoter 内 224-235 bp + 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71632567-71638329(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr07G002049 Chr07 NC_080393.1:18620110-18620121promoter 内 178-189 bp - 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18615423-18616298(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTT
SmilChr05G003862 Chr05 NC_080391.1:52176542-52176553promoter 内 126-137 bp - 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 52180417-52182652(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr07G000735 Chr07 NC_080393.1:5121954-5121965promoter 内 31-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5115072-5117995(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCCT
SmilChr02G001478 Chr02 NC_080388.1:27646330-27646341promoter 内 9-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27639069-27642349(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr02G000965 Chr02 NC_080388.1:16876200-16876211promoter 内 1030-1041 bp - 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 16870304-16873240(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCTT
SmilChr06G000718 Chr06 NC_080392.1:6541010-6541021promoter 内 3829-3840 bp + 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 6540075-6540849(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCT
SmilChr06G003257 Chr06 NC_080392.1:45237492-45237503promoter 内 3628-3639 bp + 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 45228062-45237130(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr05G001115 Chr05 NC_080391.1:9300585-9300596promoter 内 902-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 9291872-9297497(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr05G002861 Chr05 NC_080391.1:34099620-34099631promoter 内 3912-3923 bp + 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 34097042-34099542(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCCT
SmilChr05G000123 Chr05 NC_080391.1:986941-986952promoter 内 3355-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 987587-988033(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr05G003752 Chr05 NC_080391.1:50649873-50649884promoter 内 3296-3307 bp - 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 50650578-50653803(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr08G000131 Chr08 NC_080394.1:818574-818585promoter 内 3258-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 816269-817842(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr01G003969 Chr01 NC_080387.1:58138823-58138834promoter 内 3163-3174 bp + 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 58134832-58137996(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr02G003372 Chr02 NC_080388.1:54850964-54850975promoter 内 3129-3140 bp + 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 54851836-54853897(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTATA
SmilChr03G000893 Chr03 NC_080389.1:10225856-10225867promoter 内 2999-3010 bp + 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 10221382-10224865(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGACC
SmilChr04G000071 Chr04 NC_080390.1:667617-667628promoter 内 2753-2764 bp + 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 662723-666380(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr08G001509 Chr08 NC_080394.1:12238167-12238178promoter 内 2299-2310 bp - 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 12239869-12243892(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr01G000168 Chr01 NC_080387.1:2740933-2740944promoter 内 2238-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 2738603-2739181(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTC
SmilChr08G003472 Chr08 NC_080394.1:37348572-37348583promoter 内 2164-2175 bp + 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 37344001-37346746(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr03G001060 Chr03 NC_080389.1:12296242-12296253promoter 内 1898-1909 bp - 2092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 12298345-12300900(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr05G002780 Chr05 NC_080391.1:32479777-32479788promoter 内 1664-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 32476456-32477451(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr04G000072 Chr04 NC_080390.1:667617-667628promoter 内 1566-1577 bp + 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 670052-670942(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGG
SmilChr08G002962 Chr08 NC_080394.1:29641932-29641943promoter 内 1530-1541 bp - 2460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 29644403-29648138(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr04G000662 Chr04 NC_080390.1:7486367-7486378promoter 内 1490-1501 bp - 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 7481036-7483867(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTACCAGCTGTA