转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G001791; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007112-RA_Salv SmilChr02G001791 TCP XP_057795933.1 MP00062 GGGACCAC

可能结合的靶基因

7249 个结合位点 6454 个候选靶基因 第 81 / 130 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G002880 Chr08 NC_080394.1:28708118-28708125promoter 内 2373-2380 bp - 1621 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 28701973-28706497(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr07G004215 Chr07 NC_080393.1:54346725-54346732promoter 内 2372-2379 bp + 1622 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 54342933-54345103(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr02G003537 Chr02 NC_080388.1:56516303-56516310promoter 内 2370-2377 bp - 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 56517934-56519916(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr03G002495 Chr03 NC_080389.1:39742484-39742491promoter 内 2368-2375 bp - 1626 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 39744117-39747305(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr02G000914 Chr02 NC_080388.1:15870317-15870324promoter 内 2367-2374 bp + 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 15850486-15868690(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr04G003746 Chr04 NC_080390.1:53749979-53749986promoter 内 2367-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 53751613-53755949(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr04G001767 Chr04 NC_080390.1:29075212-29075219promoter 内 2365-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 29076848-29082118(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr02G000904 Chr02 NC_080388.1:15601134-15601141promoter 内 2363-2370 bp + 1631 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 15591795-15599503(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr03G001686 Chr03 NC_080389.1:22234333-22234340promoter 内 2362-2369 bp + 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 22235972-22236892(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr01G003435 Chr01 NC_080387.1:52973662-52973669promoter 内 2360-2367 bp - 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 52975303-52976891(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr01G005955 Chr01 NC_080387.1:75239833-75239840promoter 内 2360-2367 bp + 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 75241474-75243017(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr05G001242 Chr05 NC_080391.1:10523644-10523651promoter 内 2358-2365 bp + 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 10525287-10525772(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr06G000591 Chr06 NC_080392.1:5101130-5101137promoter 内 2356-2363 bp - 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 5102775-5106294(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr04G001493 Chr04 NC_080390.1:24490900-24490907promoter 内 2354-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 24492547-24493209(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr08G002787 Chr08 NC_080394.1:27569797-27569804promoter 内 2353-2360 bp + 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 27565486-27568156(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr02G004406 Chr02 NC_080388.1:66389310-66389317promoter 内 2352-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 66385204-66387668(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr07G003019 Chr07 NC_080393.1:31234545-31234552promoter 内 2352-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 31236194-31238241(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr08G004640 Chr08 NC_080394.1:55932255-55932262promoter 内 2352-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 55928438-55930613(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr03G001739 Chr03 NC_080389.1:23481473-23481480promoter 内 2351-2358 bp + 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 23483123-23487206(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr02G002191 Chr02 NC_080388.1:39141488-39141495promoter 内 2350-2357 bp + 1644 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 39136070-39139844(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr01G000990 Chr01 NC_080387.1:20900331-20900338promoter 内 2349-2356 bp - 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 20894555-20898686(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr05G000267 Chr05 NC_080391.1:2029131-2029138promoter 内 2349-2356 bp - 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 2030783-2033065(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr02G000915 Chr02 NC_080388.1:15870317-15870324promoter 内 2348-2355 bp + 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 15852719-15868671(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr01G000048 Chr01 NC_080387.1:764315-764322promoter 内 2346-2353 bp + 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 761036-762667(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr01G003165 Chr01 NC_080387.1:50460416-50460423promoter 内 2346-2353 bp - 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 50455202-50458768(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr06G003158 Chr06 NC_080392.1:44557429-44557436promoter 内 2346-2353 bp - 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 44559084-44560064(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr08G001011 Chr08 NC_080394.1:7594423-7594430promoter 内 2346-2353 bp - 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7596078-7602105(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr01G001964 Chr01 NC_080387.1:34972947-34972954promoter 内 2344-2351 bp + 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 34969412-34971297(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr02G003895 Chr02 NC_080388.1:61044414-61044421promoter 内 2344-2351 bp + 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 61046071-61049536(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr01G005810 Chr01 NC_080387.1:74125564-74125571promoter 内 2343-2350 bp + 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 74123288-74123913(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr02G000589 Chr02 NC_080388.1:8444954-8444961promoter 内 2343-2350 bp - 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 8446612-8447289(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr08G004681 Chr08 NC_080394.1:56287895-56287902promoter 内 2341-2348 bp - 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 56289555-56291105(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr07G000517 Chr07 NC_080393.1:3635753-3635760promoter 内 2340-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3631170-3634099(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr08G004140 Chr08 NC_080394.1:50412788-50412795promoter 内 2340-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 50414449-50420087(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr01G002328 Chr01 NC_080387.1:40439094-40439101promoter 内 2339-2346 bp + 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 40440756-40444375(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr08G000645 Chr08 NC_080394.1:4802912-4802919promoter 内 2339-2346 bp - 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 4804574-4807646(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
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