转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G002534; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003982-RA_Salv SmilChr02G002534 TCP XP_057797741.1 MP00169 GTTGGGACCACA

可能结合的靶基因

7295 个结合位点 6498 个候选靶基因 第 81 / 130 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G003942 Chr08 NC_080394.1:47174417-47174428promoter 内 1540-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47168078-47171967(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr08G001212 Chr08 NC_080394.1:9796360-9796371promoter 内 1518-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9798843-9800981(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAA
SmilChr02G002170 Chr02 NC_080388.1:38910493-38910504promoter 内 1513-1524 bp - 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 38912981-38915528(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr03G000310 Chr03 NC_080389.1:3545473-3545484promoter 内 1512-1523 bp + 2478 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 3539980-3542995(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCGCTT
SmilChr01G004781 Chr01 NC_080387.1:65999495-65999506promoter 内 1475-1486 bp - 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 66002021-66005290(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr02G001992 Chr02 NC_080388.1:36012497-36012508promoter 内 1462-1473 bp - 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 36008309-36009969(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCCGGGACCAAA
SmilChr02G005471 Chr02 NC_080388.1:74982124-74982135promoter 内 1445-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 74977964-74979579(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCCGGGACCAGT
SmilChr05G001402 Chr05 NC_080391.1:12615051-12615062promoter 内 1429-1440 bp + 2561 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12608100-12612490(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTTGGTCCCGAG
SmilChr07G001952 Chr07 NC_080393.1:16984637-16984648promoter 内 1415-1426 bp - 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16987223-16987303(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr02G002638 Chr02 NC_080388.1:45776715-45776726promoter 内 1396-1407 bp + 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 45779320-45788747(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTCGGGACCAAC
SmilChr04G000268 Chr04 NC_080390.1:2463292-2463303promoter 内 1393-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2460622-2460695(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGCGGGACCAGA
SmilChr04G002475 Chr04 NC_080390.1:39544723-39544734promoter 内 1352-1363 bp + 2638 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39547372-39550843(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGTGGACCACA
SmilChr03G004518 Chr03 NC_080389.1:63226621-63226632promoter 内 1333-1344 bp + 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63229289-63231314(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCAAC
SmilChr04G003607 Chr04 NC_080390.1:52544108-52544119promoter 内 1330-1341 bp + 2660 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52546779-52550752(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGCTGGACCACA
SmilChr02G000257 Chr02 NC_080388.1:3293201-3293212promoter 内 1328-1339 bp + 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 3295874-3297706(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGTGGACCACA
SmilChr04G003049 Chr04 NC_080390.1:47036141-47036152promoter 内 1315-1326 bp + 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47038827-47043832(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTGTGGACCACA
SmilChr06G000916 Chr06 NC_080392.1:8688644-8688655promoter 内 1297-1308 bp + 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8678388-8685951(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr04G003551 Chr04 NC_080390.1:51869460-51869471promoter 内 1275-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51863397-51866745(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCGACT
SmilChr04G001967 Chr04 NC_080390.1:31896208-31896219promoter 内 1232-1243 bp - 2758 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 31892032-31893450(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGGGGGACCATA
SmilChr04G003166 Chr04 NC_080390.1:48275090-48275101promoter 内 1182-1193 bp - 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48267411-48272282(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTGTGGACCACA
SmilChr03G000927 Chr03 NC_080389.1:10607750-10607761promoter 内 1176-1187 bp - 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 10610575-10612075(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAA
SmilChr05G001404 Chr05 NC_080391.1:12615051-12615062promoter 内 1169-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12617883-12617954(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTCGGGACCAAC
SmilChr07G002113 Chr07 NC_080393.1:19249419-19249430promoter 内 1169-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19252251-19253608(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGTGGACCACA
SmilChr06G001014 Chr06 NC_080392.1:10021026-10021037promoter 内 1151-1162 bp + 2839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 10023876-10033683(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGGGGGACCATA
SmilChr05G002356 Chr05 NC_080391.1:25574898-25574909promoter 内 1109-1120 bp - 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 25577790-25578711(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr01G003759 Chr01 NC_080387.1:55976683-55976694promoter 内 1094-1105 bp - 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55979590-55982896(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr07G001709 Chr07 NC_080393.1:14494890-14494901promoter 内 1044-1055 bp - 2946 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 14491351-14491944(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGGGGACCAGA
SmilChr06G001756 Chr06 NC_080392.1:20488269-20488280promoter 内 1007-1018 bp - 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 20491263-20492516(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCGCTT
SmilChr01G002521 Chr01 NC_080387.1:43181583-43181594promoter 内 992-1003 bp - 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 43184592-43186017(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr04G002321 Chr04 NC_080390.1:37503856-37503867promoter 内 974-985 bp + 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37497828-37500840(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr02G001194 Chr02 NC_080388.1:21971940-21971951promoter 内 969-980 bp + 3021 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21966207-21968919(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGTCCCCTC
SmilChr02G005514 Chr02 NC_080388.1:75253899-75253910promoter 内 962-973 bp - 3028 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75249826-75250871(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGGGGACCATC
SmilChr04G002072 Chr04 NC_080390.1:33475824-33475835promoter 内 952-963 bp + 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 33467828-33472786(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAT
SmilChr08G004663 Chr08 NC_080394.1:56119755-56119766promoter 内 936-947 bp + 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56122820-56125423(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGTGGACCACA
SmilChr05G001942 Chr05 NC_080391.1:19782959-19782970promoter 内 926-937 bp + 3064 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19778249-19779895(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACAA
SmilChr03G000708 Chr03 NC_080389.1:7877855-7877866promoter 内 923-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 7870485-7874788(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGTGGACCACA
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