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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 91 / 151 下载 TSV

上一页 91 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001007 Chr01 NC_080387.1:21188255-21188267promoter 内 1296-1308 bp - 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 21190960-21191082(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr05G000664 Chr05 NC_080391.1:5020449-5020461promoter 内 1296-1308 bp + 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 5023154-5025239(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr05G000715 Chr05 NC_080391.1:5441424-5441436promoter 内 1268-1280 bp - 2721 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 5436724-5438703(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr03G002603 Chr03 NC_080389.1:41395362-41395374promoter 内 1218-1230 bp + 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41398145-41401591(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G004346 Chr01 NC_080387.1:61618426-61618438promoter 内 1212-1224 bp + 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 61613125-61615649(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAATTTAGGTAAA
SmilChr01G006066 Chr01 NC_080387.1:76068709-76068721promoter 内 1174-1186 bp - 2815 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 76071536-76075726(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGATTAGGTAAT
SmilChr04G001034 Chr04 NC_080390.1:14691136-14691148promoter 内 1151-1163 bp - 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14687242-14688298(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTAGC
SmilChr01G000842 Chr01 NC_080387.1:18270735-18270747promoter 内 1093-1105 bp + 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18273643-18274242(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G004914 Chr01 NC_080387.1:67173646-67173658promoter 内 1020-1032 bp + 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 67169797-67170677(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr01G004173 Chr01 NC_080387.1:60200742-60200754promoter 内 983-995 bp - 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 60203760-60208887(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr05G000282 Chr05 NC_080391.1:2187861-2187873promoter 内 972-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2182256-2184844(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr02G000482 Chr02 NC_080388.1:6613382-6613394promoter 内 964-976 bp + 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6599753-6610357(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAATTTAGGTAAA
SmilChr02G000138 Chr02 NC_080388.1:1868699-1868711promoter 内 919-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1864280-1865629(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGATTTAGGTAAA
SmilChr01G004331 Chr01 NC_080387.1:61459491-61459503promoter 内 784-796 bp + 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 61454574-61456286(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAATTTAGGTAAA
SmilChr01G000628 Chr01 NC_080387.1:14049044-14049056promoter 内 772-784 bp + 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14052273-14053478(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
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SmilChr01G005926 Chr01 NC_080387.1:75067885-75067897promoter 内 755-767 bp - 3234 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 75063982-75064651(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
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SmilChr03G002347 Chr03 NC_080389.1:37022153-37022165promoter 内 717-729 bp + 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 37015279-37018881(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr01G003978 Chr01 NC_080387.1:58233589-58233601promoter 内 712-724 bp + 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 58236878-58238026(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
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SmilChr02G002272 Chr02 NC_080388.1:40189823-40189835promoter 内 711-723 bp - 3278 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 40185049-40186545(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCGCCTACCTTC
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SmilChr02G002100 Chr02 NC_080388.1:37678025-37678037promoter 内 638-650 bp + 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 37670534-37674674(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr03G001118 Chr03 NC_080389.1:12893011-12893023promoter 内 619-631 bp + 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 12887736-12889641(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAAC
SmilChr04G002741 Chr04 NC_080390.1:43078206-43078218promoter 内 603-615 bp + 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43074041-43074820(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGTTTAGGTAAA
SmilChr01G003473 Chr01 NC_080387.1:53273944-53273956promoter 内 590-602 bp - 3399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 53277355-53281155(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr01G000650 Chr01 NC_080387.1:14496109-14496121promoter 内 556-568 bp - 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14491531-14492676(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G004891 Chr01 NC_080387.1:66982234-66982246promoter 内 550-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 66977992-66978795(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
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SmilChr04G004123 Chr04 NC_080390.1:56081951-56081963promoter 内 543-555 bp - 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56085409-56088068(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAATTAGGTAAT
SmilChr04G004017 Chr04 NC_080390.1:55430794-55430806promoter 内 529-541 bp + 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 55434266-55434417(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATTTT
SmilChr02G004454 Chr02 NC_080388.1:66941551-66941563promoter 内 495-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 66937617-66938057(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAA
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SmilChr01G001739 Chr01 NC_080387.1:32023121-32023133promoter 内 438-450 bp + 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32015658-32019570(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr03G000701 Chr03 NC_080389.1:7834098-7834110promoter 内 422-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7837677-7840036(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr02G003724 Chr02 NC_080388.1:58864091-58864103promoter 内 372-384 bp + 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 58858677-58860474(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr04G002023 Chr04 NC_080390.1:32811052-32811064promoter 内 372-384 bp - 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32805679-32807435(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G001371 Chr01 NC_080387.1:27051393-27051405promoter 内 314-326 bp - 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 27055080-27057634(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr03G002533 Chr03 NC_080389.1:40396846-40396858promoter 内 309-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 40387035-40393166(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr01G000843 Chr01 NC_080387.1:18270735-18270747promoter 内 301-313 bp + 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18274435-18279623(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr04G002061 Chr04 NC_080390.1:33361456-33361468promoter 内 292-304 bp - 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 33354733-33357759(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G005026 Chr01 NC_080387.1:68230590-68230602promoter 内 240-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 68217077-68226841(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACTATG
SmilChr02G003677 Chr02 NC_080388.1:58146711-58146723promoter 内 173-185 bp + 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 58142824-58142895(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
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SmilChr04G000291 Chr04 NC_080390.1:2722707-2722719promoter 内 72-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2716039-2718790(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr02G002114 Chr02 NC_080388.1:37828574-37828586promoter 内 59-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 37814648-37824644(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT