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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 94 / 139 下载 TSV

上一页 94 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002611 Chr06 NC_080392.1:37542795-37542808promoter 内 543-556 bp - 3445 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 37546253-37547565(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCTT
SmilChr07G000054 Chr07 NC_080393.1:242587-242600promoter 内 522-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 236810-239121(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCTT
SmilChr01G001178 Chr01 NC_080387.1:23833016-23833029promoter 内 486-499 bp + 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 23827198-23829514(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTCCACCGCCAAC
SmilChr06G001472 Chr06 NC_080392.1:15634274-15634287promoter 内 467-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15628100-15630753(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGACGGTGGGAG
SmilChr07G000346 Chr07 NC_080393.1:2346685-2346698promoter 内 465-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 2341671-2343162(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGACGGTGGGAG
SmilChr01G000429 Chr01 NC_080387.1:8585552-8585565promoter 内 453-466 bp + 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 8589100-8590420(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GACGACGGTGGCGA
SmilChr02G001258 Chr02 NC_080388.1:23086207-23086220promoter 内 419-432 bp + 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 23079644-23082638(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTTTCGCCGTCCAA
SmilChr05G000122 Chr05 NC_080391.1:946704-946717promoter 内 385-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 950320-959083(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AAGGACGGTGAAGT
SmilChr06G000507 Chr06 NC_080392.1:4185907-4185920promoter 内 377-390 bp - 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4189531-4199209(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCTT
SmilChr01G003576 Chr01 NC_080387.1:54348596-54348609promoter 内 364-377 bp - 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 54352233-54354691(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCTT
SmilChr05G003300 Chr05 NC_080391.1:43186418-43186431promoter 内 217-230 bp + 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 43190202-43190307(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGAGACGGTGGCGG
SmilChr01G001020 Chr01 NC_080387.1:21372378-21372391promoter 内 189-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 21376190-21379024(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCGGCACCGTCAAA
SmilChr01G005032 Chr01 NC_080387.1:68284418-68284431promoter 内 178-191 bp + 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 68278485-68280608(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCTT
SmilChr01G005031 Chr01 NC_080387.1:68278915-68278928promoter 内 171-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 68272982-68275098(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCTT
SmilChr01G004136 Chr01 NC_080387.1:59880104-59880117promoter 内 168-181 bp - 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 59875231-59876284(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGAGTCGGTGGAGG
SmilChr06G001304 Chr06 NC_080392.1:13570706-13570719promoter 内 109-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 13562726-13566827(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGGCGAC
SmilChr05G000374 Chr05 NC_080391.1:2809450-2809463promoter 内 87-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 2802627-2805549(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AAGGACGGTGAAGT
SmilChr04G003927 Chr04 NC_080390.1:54942743-54942756promoter 内 76-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 54938105-54938831(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCTT
SmilChr06G002572 Chr06 NC_080392.1:36932143-36932156promoter 内 46-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 36925615-36928201(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTTTCGCCGTCCAA
SmilChr04G001163 Chr04 NC_080390.1:17296934-17296947promoter 内 27-40 bp + 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17290385-17292973(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTTTCGCCGTCCAA
SmilChr04G002978 Chr04 NC_080390.1:46254961-46254974promoter 内 25-38 bp - 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 46174008-46250998(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTGACGGTGCCGG
SmilChr01G000748 Chr01 NC_080387.1:16561525-16561538promoter 内 3095-3108 bp + 893 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 16556310-16560632(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTCCCTCCGTCCAC
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SmilChr01G002099 Chr01 NC_080387.1:37031516-37031529promoter 内 3257-3270 bp - 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 37029265-37030785(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCACCGG
SmilChr02G004139 Chr02 NC_080388.1:63670081-63670094promoter 内 3230-3243 bp + 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 63668533-63669323(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTCCCTCCGTCCAC
SmilChr04G001981 Chr04 NC_080390.1:32088156-32088169promoter 内 3133-3146 bp + 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 32089024-32090649(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGGACGGCGAACG
SmilChr03G004394 Chr03 NC_080389.1:62124610-62124623promoter 内 2973-2986 bp + 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 62125638-62138340(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGGAA
SmilChr04G004177 Chr04 NC_080390.1:56370326-56370339promoter 内 2623-2636 bp - 1365 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 56366051-56368961(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGAGACGGTGGCGC
SmilChr01G000705 Chr01 NC_080387.1:15835227-15835240promoter 内 1105-1118 bp + 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 15830954-15832344(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCACCACCGTCAGC
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SmilChr03G003943 Chr03 NC_080389.1:58506746-58506759promoter 内 3955-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 58503066-58506713(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGCCTT
SmilChr04G003133 Chr04 NC_080390.1:47919295-47919308promoter 内 3900-3913 bp - 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47919396-47920450(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTCGCACCGTCCAT
SmilChr01G005416 Chr01 NC_080387.1:71376290-71376303promoter 内 3898-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 71373066-71376200(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGGAA
SmilChr02G000062 Chr02 NC_080388.1:776187-776200promoter 内 3719-3732 bp + 269 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 776469-779675(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGGAA
SmilChr04G000733 Chr04 NC_080390.1:8733076-8733089promoter 内 3708-3721 bp + 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 8728890-8732796(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTCCCTCCGTCCAC
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SmilChr01G002017 Chr01 NC_080387.1:35746766-35746779promoter 内 3446-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 35745559-35746224(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGTGACGGTGGCAG
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SmilChr06G002855 Chr06 NC_080392.1:41314972-41314985promoter 内 3312-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 41307536-41314296(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCACCGG
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SmilChr07G001153 Chr07 NC_080393.1:8645997-8646010promoter 内 3224-3237 bp - 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 8643883-8645233(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGGAA
SmilChr03G000086 Chr03 NC_080389.1:991487-991500promoter 内 3172-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 989522-990671(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGACGGTGAGGG