转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 11 / 128 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003531 Chr02 NC_080388.1:56469372-56469383promoter 内 354-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 56460525-56465736(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGC
SmilChr02G000954 Chr02 NC_080388.1:16574007-16574018promoter 内 335-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 16569435-16570352(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGC
SmilChr01G000633 Chr01 NC_080387.1:14220261-14220272promoter 内 198-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 14213891-14216469(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTTCT
SmilChr01G002287 Chr01 NC_080387.1:39666794-39666805promoter 内 97-108 bp + 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 39670698-39674128(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGCA
SmilChr02G004100 Chr02 NC_080388.1:63324846-63324857promoter 内 85-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 63328762-63333191(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAGCAGAGCA
SmilChr03G000836 Chr03 NC_080389.1:9577467-9577478promoter 内 2906-2917 bp + 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 5 9578562-9582344(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr03G000096 Chr03 NC_080389.1:1064502-1064513promoter 内 1817-1828 bp + 2173 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 5 1066686-1072914(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr02G003205 Chr02 NC_080388.1:53182158-53182169promoter 内 1722-1733 bp - 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 5 53184437-53187017(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr02G003203 Chr02 NC_080388.1:53182158-53182169promoter 内 536-547 bp - 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 5 53172772-53178704(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr02G005493 Chr02 NC_080388.1:75087894-75087905promoter 内 2960-2971 bp + 1030 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 75088935-75096699(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr01G005589 Chr01 NC_080387.1:72562330-72562341promoter 内 1270-1281 bp + 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 72558686-72559610(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTA
SmilChr02G005492 Chr02 NC_080388.1:75087894-75087905promoter 内 374-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 75083585-75084278(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G005590 Chr01 NC_080387.1:72562330-72562341promoter 内 3964-3975 bp + 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 72558686-72562304(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTA
SmilChr02G004495 Chr02 NC_080388.1:67448449-67448460promoter 内 3031-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 67449419-67455324(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G004237 Chr02 NC_080388.1:64551676-64551687promoter 内 2901-2912 bp - 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 64552776-64556602(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr02G004054 Chr02 NC_080388.1:62860610-62860621promoter 内 1940-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 62862671-62864748(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGCA
SmilChr01G001681 Chr01 NC_080387.1:31012350-31012361promoter 内 1083-1094 bp - 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 31008781-31009443(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G002975 Chr02 NC_080388.1:50273993-50274004promoter 内 3678-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 50274316-50276218(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G002885 Chr02 NC_080388.1:49161684-49161695promoter 内 3664-3675 bp - 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 49159389-49161358(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr01G001682 Chr01 NC_080387.1:31012350-31012361promoter 内 3060-3071 bp - 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 31013291-31016406(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr02G001931 Chr02 NC_080388.1:34715981-34715992promoter 内 3036-3047 bp + 954 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 34716946-34717989(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G001070 Chr02 NC_080388.1:19058492-19058503promoter 内 3018-3029 bp - 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 19059475-19059868(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTA
SmilChr01G005584 Chr01 NC_080387.1:72527098-72527109promoter 内 2554-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 72528545-72529494(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGCA
SmilChr02G004292 Chr02 NC_080388.1:65272272-65272283promoter 内 2549-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 65269765-65270831(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G002559 Chr02 NC_080388.1:44522335-44522346promoter 内 2424-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 44523912-44525140(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr02G004337 Chr02 NC_080388.1:65616926-65616937promoter 内 2272-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 65618655-65619728(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr03G000389 Chr03 NC_080389.1:4300255-4300266promoter 内 2271-2282 bp + 1719 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 4297428-4298536(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr01G005553 Chr01 NC_080387.1:72364976-72364987promoter 内 2095-2106 bp - 1895 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 72359681-72363081(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCT
SmilChr02G002247 Chr02 NC_080388.1:39906880-39906891promoter 内 2028-2039 bp - 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 39908853-39912236(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G001997 Chr01 NC_080387.1:35431130-35431141promoter 内 2025-2036 bp - 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 35433106-35441187(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTTTG
SmilChr02G000341 Chr02 NC_080388.1:4438541-4438552promoter 内 1827-1838 bp - 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 4440715-4441287(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr02G000301 Chr02 NC_080388.1:3803623-3803634promoter 内 1825-1836 bp + 2165 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 3800886-3801458(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr03G000833 Chr03 NC_080389.1:9560702-9560713promoter 内 1745-1756 bp + 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 9556772-9558457(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTTTG
SmilChr01G004495 Chr01 NC_080387.1:63075000-63075011promoter 内 1605-1616 bp + 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 63069932-63072615(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr02G003336 Chr02 NC_080388.1:54602924-54602935promoter 内 1404-1415 bp - 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 54599667-54600338(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGCA
SmilChr01G003003 Chr01 NC_080387.1:49026870-49026881promoter 内 1392-1403 bp + 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 49021629-49024272(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr01G003045 Chr01 NC_080387.1:49433580-49433591promoter 内 1101-1112 bp + 2889 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 49429575-49430691(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTTTG
SmilChr02G000334 Chr02 NC_080388.1:4220356-4220367promoter 内 1092-1103 bp + 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 4215622-4217458(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr02G002973 Chr02 NC_080388.1:50273993-50274004promoter 内 756-767 bp + 3234 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 50267587-50270759(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G003179 Chr01 NC_080387.1:50564916-50564927promoter 内 713-724 bp - 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 50568204-50568805(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr01G000645 Chr01 NC_080387.1:14436200-14436211promoter 内 262-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 14439939-14443084(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTA
SmilChr01G005267 Chr01 NC_080387.1:70116696-70116707promoter 内 164-175 bp + 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 70120533-70121264(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCT
SmilChr03G000183 Chr03 NC_080389.1:1960395-1960406promoter 内 164-175 bp + 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 1946613-1956569(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G002791 Chr01 NC_080387.1:46408429-46408440promoter 内 14-25 bp - 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 46403662-46404453(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGCC
SmilChr01G004310 Chr01 NC_080387.1:61277828-61277839promoter 内 3639-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 61278190-61287644(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr03G001545 Chr03 NC_080389.1:19385593-19385604promoter 内 3599-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 19383634-19385202(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr03G000650 Chr03 NC_080389.1:7238802-7238813promoter 内 3532-3543 bp - 458 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 7237817-7238344(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGCC
SmilChr02G003447 Chr02 NC_080388.1:55721049-55721060promoter 内 3492-3503 bp - 498 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 55721558-55722746(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr03G001171 Chr03 NC_080389.1:13466851-13466862promoter 内 3300-3311 bp - 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 13464853-13466161(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr01G004301 Chr01 NC_080387.1:61186013-61186024promoter 内 3214-3225 bp + 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 61186800-61187971(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA