转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 110 / 139 下载 TSV

上一页 110 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002240 Chr01 NC_080387.1:38945830-38945841promoter 内 518-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38949313-38953240(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TAAAGACGTGGC
SmilChr01G003919 Chr01 NC_080387.1:57449046-57449057promoter 内 509-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 57452538-57452733(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCATGACGTGAG
SmilChr03G003256 Chr03 NC_080389.1:50454963-50454974promoter 内 493-504 bp - 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 50448036-50451466(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAATGACGTGTC
SmilChr02G001326 Chr02 NC_080388.1:24732149-24732160promoter 内 489-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24735661-24738173(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GATCGACGTGGA
SmilChr03G004714 Chr03 NC_080389.1:64386956-64386967promoter 内 485-496 bp + 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 64390472-64393314(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTTCGACGTGGA
SmilChr01G001961 Chr01 NC_080387.1:34881056-34881067promoter 内 450-461 bp - 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 34884607-34891469(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTGT
SmilChr02G005072 Chr02 NC_080388.1:72374901-72374912promoter 内 431-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 72378471-72381964(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGCAT
SmilChr02G004677 Chr02 NC_080388.1:69118490-69118501promoter 内 411-422 bp + 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 69112116-69114911(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCACAG
SmilChr01G003241 Chr01 NC_080387.1:51151667-51151678promoter 内 348-359 bp - 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 51144429-51148025(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr02G003659 Chr02 NC_080388.1:57961383-57961394promoter 内 344-355 bp - 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 57965040-57967019(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGAAA
SmilChr04G000813 Chr04 NC_080390.1:10206297-10206308promoter 内 342-353 bp - 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 10194500-10202649(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATGACGTGAG
SmilChr02G000086 Chr02 NC_080388.1:1134236-1134247promoter 内 255-266 bp - 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1128275-1130501(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr03G000177 Chr03 NC_080389.1:1911374-1911385promoter 内 235-246 bp + 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1915140-1916637(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTTTGACGTGTC
SmilChr01G003202 Chr01 NC_080387.1:50801082-50801093promoter 内 214-225 bp - 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 50795387-50797306(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr02G002278 Chr02 NC_080388.1:40264676-40264687promoter 内 210-221 bp + 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 40268467-40269588(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTTCCACGTGGC
SmilChr01G005662 Chr01 NC_080387.1:72953329-72953340promoter 内 151-162 bp + 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 72957179-72960135(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACATGACGTGTC
SmilChr02G001946 Chr02 NC_080388.1:35086381-35086392promoter 内 151-162 bp - 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 35080855-35082542(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTTCGACGTGGA
SmilChr01G004418 Chr01 NC_080387.1:62308054-62308065promoter 内 138-149 bp - 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 62311917-62313519(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCACGA
SmilChr03G003654 Chr03 NC_080389.1:55373888-55373899promoter 内 138-149 bp - 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55368761-55370036(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTTCCACGTGGC
SmilChr01G002668 Chr01 NC_080387.1:44901216-44901227promoter 内 127-138 bp - 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 44896410-44897353(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATGACGTGAG
SmilChr02G001012 Chr02 NC_080388.1:17881131-17881142promoter 内 120-131 bp - 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 17873514-17877261(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTTTGACGTGTC
SmilChr03G000908 Chr03 NC_080389.1:10401955-10401966promoter 内 78-89 bp - 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 10405878-10409933(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGAAG
SmilChr02G004036 Chr02 NC_080388.1:62655140-62655151promoter 内 18-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 62659123-62662197(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACTCGACGTGGT
SmilChr03G001776 Chr03 NC_080389.1:24217686-24217697promoter 内 3333-3344 bp - 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 3 24214085-24217029(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G005906 Chr01 NC_080387.1:74923057-74923068promoter 内 3804-3815 bp + 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 74923254-74924003(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGTGACGTGCG
SmilChr03G001573 Chr03 NC_080389.1:19866559-19866570promoter 内 3594-3605 bp - 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 19863081-19866163(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G001160 Chr04 NC_080390.1:17165219-17165230promoter 内 3529-3540 bp - 461 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 17161589-17164758(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr02G000127 Chr02 NC_080388.1:1737093-1737104promoter 内 3396-3407 bp - 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 1733520-1736499(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G001901 Chr04 NC_080390.1:31056403-31056414promoter 内 3373-3384 bp + 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 31057031-31060003(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G000354 Chr04 NC_080390.1:3371449-3371460promoter 内 3338-3349 bp - 652 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 3367829-3370797(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G001336 Chr04 NC_080390.1:21582608-21582619promoter 内 3331-3342 bp + 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 21583278-21586202(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G001589 Chr01 NC_080387.1:29919958-29919969promoter 内 3308-3319 bp + 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 29915355-29919276(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr01G000602 Chr01 NC_080387.1:13103343-13103354promoter 内 3307-3318 bp + 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 13104037-13106969(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G001686 Chr04 NC_080390.1:27887068-27887079promoter 内 3307-3318 bp + 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 27887762-27890697(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr05G000337 Chr05 NC_080391.1:2513369-2513380promoter 内 3307-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 2509793-2512686(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G001159 Chr04 NC_080390.1:17155463-17155474promoter 内 3284-3295 bp - 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 17151835-17154757(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G000360 Chr04 NC_080390.1:3563240-3563251promoter 内 3283-3294 bp + 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 3563958-3566851(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G001590 Chr01 NC_080387.1:29919958-29919969promoter 内 3266-3277 bp + 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 29920693-29923607(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G004987 Chr01 NC_080387.1:67913242-67913253promoter 内 3024-3035 bp - 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 67914219-67916717(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCATCA
SmilChr02G001309 Chr02 NC_080388.1:24337664-24337675promoter 内 1917-1928 bp + 2073 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 24321846-24335591(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCACCT
SmilChr01G000960 Chr01 NC_080387.1:20313972-20313983promoter 内 1726-1737 bp - 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 20316247-20317386(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCACAG
SmilChr03G001171 Chr03 NC_080389.1:13468500-13468511promoter 内 1651-1662 bp - 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 13464853-13466161(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G002322 Chr04 NC_080390.1:37526816-37526827promoter 内 1496-1507 bp + 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 37529321-37533750(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCTGACGTCCC
SmilChr03G001574 Chr03 NC_080389.1:19866559-19866570promoter 内 1295-1306 bp - 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 19869265-19870366(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr01G004830 Chr01 NC_080387.1:66433128-66433139promoter 内 924-935 bp - 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 66436205-66438902(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAAGA
SmilChr04G002196 Chr04 NC_080390.1:35535955-35535966promoter 内 528-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 35531323-35532493(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGTT
SmilChr05G000338 Chr05 NC_080391.1:2513369-2513380promoter 内 230-241 bp - 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 2517140-2530900(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr03G000643 Chr03 NC_080389.1:7130885-7130896promoter 内 3971-3982 bp + 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 7127426-7130866(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr03G001542 Chr03 NC_080389.1:19351897-19351908promoter 内 3967-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19349623-19351874(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr01G002492 Chr01 NC_080387.1:42663504-42663515promoter 内 3934-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 42663571-42665645(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCACGC