转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003441; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014538-RA_Salv SmilChr07G003441 NAC XP_057773618.1 MP00108 TTAAGTAAT

可能结合的靶基因

9810 个结合位点 6458 个候选靶基因 第 115 / 130 下载 TSV

上一页 115 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003086 Chr01 NC_080387.1:49693867-49693875promoter 内 1316-1324 bp + 2677 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49696552-49699537(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G002743 Chr01 NC_080387.1:45729777-45729785promoter 内 1314-1322 bp + 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45732464-45733904(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G001732 Chr02 NC_080388.1:31813933-31813941promoter 内 1313-1321 bp - 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 31804658-31811253(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr02G001802 Chr02 NC_080388.1:32874066-32874074promoter 内 1311-1319 bp + 2682 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 32876756-32879335(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G001617 Chr01 NC_080387.1:30289592-30289600promoter 内 1310-1318 bp + 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30283607-30286909(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr01G000635 Chr01 NC_080387.1:14274536-14274544promoter 内 1308-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 14277229-14280357(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr02G000505 Chr02 NC_080388.1:6962932-6962940promoter 内 1308-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 6957928-6960247(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G005546 Chr02 NC_080388.1:75458611-75458619promoter 内 1307-1315 bp - 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 75453517-75455925(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAGT
SmilChr01G001615 Chr01 NC_080387.1:30273415-30273423promoter 内 1306-1314 bp - 2687 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30276110-30278142(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G002485 Chr02 NC_080388.1:43246763-43246771promoter 内 1304-1312 bp + 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 43241794-43244074(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr02G000275 Chr02 NC_080388.1:3526598-3526606promoter 内 1301-1309 bp - 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 3519795-3523906(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TGAAGTAAT
SmilChr02G003335 Chr02 NC_080388.1:54591284-54591292promoter 内 1300-1308 bp + 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54593985-54596290(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAGT
SmilChr02G005568 Chr02 NC_080388.1:75580519-75580527promoter 内 1300-1308 bp + 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 75583220-75584946(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G005930 Chr01 NC_080387.1:75085040-75085048promoter 内 1299-1307 bp - 2694 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 75081009-75082346(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G004614 Chr01 NC_080387.1:64096468-64096476promoter 内 1298-1306 bp + 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64089102-64093773(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr01G005055 Chr01 NC_080387.1:68477889-68477897promoter 内 1298-1306 bp - 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68480592-68486417(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr02G002915 Chr02 NC_080388.1:49470024-49470032promoter 内 1297-1305 bp + 2696 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49464290-49467328(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr01G002169 Chr01 NC_080387.1:37796008-37796016promoter 内 1296-1304 bp + 2697 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37793240-37793311(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr02G005074 Chr02 NC_080388.1:72382139-72382147promoter 内 1296-1304 bp - 2697 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 72384844-72390199(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G001968 Chr02 NC_080388.1:35609852-35609860promoter 内 1294-1302 bp - 2699 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35612559-35613464(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 AGTACTTAA
SmilChr03G000009 Chr03 NC_080389.1:96399-96407promoter 内 1292-1300 bp + 2701 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 99108-101875(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr02G000507 Chr02 NC_080388.1:6979157-6979165promoter 内 1291-1299 bp - 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 6975700-6976455(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G005856 Chr01 NC_080387.1:74488954-74488962promoter 内 1289-1297 bp - 2704 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 74491666-74497993(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr01G003947 Chr01 NC_080387.1:57823485-57823493promoter 内 1288-1296 bp + 2705 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 57826198-57829765(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr02G004786 Chr02 NC_080388.1:70019303-70019311promoter 内 1287-1295 bp + 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 70022017-70025989(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr02G000587 Chr02 NC_080388.1:8441416-8441424promoter 内 1286-1294 bp - 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8444131-8445285(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr01G000807 Chr01 NC_080387.1:17453749-17453757promoter 内 1285-1293 bp + 2708 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 17446147-17451041(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr03G000131 Chr03 NC_080389.1:1444626-1444634promoter 内 1284-1292 bp + 2709 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1447343-1448228(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr02G004554 Chr02 NC_080388.1:68061443-68061451promoter 内 1279-1287 bp + 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68055111-68058729(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr01G004796 Chr01 NC_080387.1:66191150-66191158promoter 内 1278-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 66186585-66188435(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr01G005730 Chr01 NC_080387.1:73437762-73437770promoter 内 1278-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 73440485-73444604(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G004282 Chr01 NC_080387.1:61044759-61044767promoter 内 1277-1285 bp + 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 61047483-61049109(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr02G003636 Chr02 NC_080388.1:57737277-57737285promoter 内 1271-1279 bp - 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 57730340-57734555(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G000064 Chr02 NC_080388.1:847131-847139promoter 内 1270-1278 bp + 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 843092-844408(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G004047 Chr01 NC_080387.1:58899611-58899619promoter 内 1269-1277 bp + 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 58902343-58908090(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTACT
SmilChr02G003855 Chr02 NC_080388.1:60317201-60317209promoter 内 1268-1276 bp - 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60305438-60314476(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G004656 Chr01 NC_080387.1:64659789-64659797promoter 内 1265-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64662525-64663003(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TGAAGTAAT
SmilChr01G004757 Chr01 NC_080387.1:65769535-65769543promoter 内 1265-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 65772271-65776936(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr02G001594 Chr02 NC_080388.1:29707646-29707654promoter 内 1265-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 29710382-29711865(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G001417 Chr02 NC_080388.1:26805762-26805770promoter 内 1263-1271 bp + 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 26799343-26803032(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr02G003368 Chr02 NC_080388.1:54812909-54812917promoter 内 1262-1270 bp - 2731 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54804853-54810178(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTACT
SmilChr01G004244 Chr01 NC_080387.1:60745256-60745264promoter 内 1258-1266 bp + 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60741336-60742521(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr01G004083 Chr01 NC_080387.1:59251562-59251570promoter 内 1257-1265 bp - 2736 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 59254306-59257098(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr02G001114 Chr02 NC_080388.1:20111587-20111595promoter 内 1254-1262 bp + 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 20105086-20108848(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr02G003945 Chr02 NC_080388.1:61597609-61597617promoter 内 1254-1262 bp - 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 61591200-61594870(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr02G003220 Chr02 NC_080388.1:53427200-53427208promoter 内 1252-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 53422811-53424459(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr02G003309 Chr02 NC_080388.1:54350470-54350478promoter 内 1252-1260 bp - 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54345754-54347729(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G001015 Chr01 NC_080387.1:21316360-21316368promoter 内 1251-1259 bp + 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 21319110-21321772(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G002218 Chr01 NC_080387.1:38505017-38505025promoter 内 1251-1259 bp + 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 38501470-38502275(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr01G005097 Chr01 NC_080387.1:68797522-68797530promoter 内 1251-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68800272-68802269(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA