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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 118 / 138 下载 TSV

上一页 118 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005210 Chr01 NC_080387.1:69730741-69730753promoter 内 823-835 bp - 3166 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 69733919-69734530(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGGAGTCAACAGA
SmilChr03G003757 Chr03 NC_080389.1:56687953-56687965promoter 内 815-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56682950-56684779(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGAGTCAACTTC
SmilChr01G000999 Chr01 NC_080387.1:21052912-21052924promoter 内 653-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21056260-21059172(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCTAGTCAAAATT
SmilChr03G004302 Chr03 NC_080389.1:61394563-61394575promoter 内 612-624 bp + 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 61397952-61398257(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGTTTGACTAAT
SmilChr01G001042 Chr01 NC_080387.1:21652788-21652800promoter 内 566-578 bp + 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21649024-21649365(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAATA
SmilChr01G003733 Chr01 NC_080387.1:55629299-55629311promoter 内 564-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55618087-55625874(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAATA
SmilChr02G002438 Chr02 NC_080388.1:42580756-42580768promoter 内 503-515 bp + 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 42584254-42587485(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGTTTGACTAAT
SmilChr02G003274 Chr02 NC_080388.1:54024749-54024761promoter 内 494-506 bp - 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54018944-54021254(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTAGA
SmilChr02G004834 Chr02 NC_080388.1:70455872-70455884promoter 内 447-459 bp - 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 70459426-70471260(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAAGTCAACTCG
SmilChr02G003582 Chr02 NC_080388.1:56985148-56985160promoter 内 411-423 bp - 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56980141-56981570(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATTTTGACTATT
SmilChr02G005243 Chr02 NC_080388.1:73604230-73604242promoter 内 405-417 bp - 3584 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 73599124-73600646(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAATTTGACTATG
SmilChr01G002438 Chr01 NC_080387.1:41971015-41971027promoter 内 284-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 41963510-41967310(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGAGTCAACATT
SmilChr02G004643 Chr02 NC_080388.1:68874939-68874951promoter 内 259-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 68869654-68871209(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAACAAG
SmilChr01G005219 Chr01 NC_080387.1:69759846-69759858promoter 内 253-265 bp - 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 69763594-69764332(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGGAGTCAACAGA
SmilChr02G005147 Chr02 NC_080388.1:72874901-72874913promoter 内 240-252 bp + 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 72865368-72871152(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGAGTCAACACA
SmilChr03G000559 Chr03 NC_080389.1:6065619-6065631promoter 内 205-217 bp + 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 6058931-6061835(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACTAA
SmilChr01G004924 Chr01 NC_080387.1:67302871-67302883promoter 内 143-155 bp + 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 67306729-67311568(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTTTTGACTAAT
SmilChr03G001949 Chr03 NC_080389.1:27814279-27814291promoter 内 8-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 27818272-27819267(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAATA
SmilChr02G003943 Chr02 NC_080388.1:61574990-61575002promoter 内 2218-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 3 61576773-61582490(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAAAATT
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SmilChr01G003053 Chr01 NC_080387.1:49471420-49471432promoter 内 3591-3603 bp - 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 49470939-49471022(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCATTTGACTAGG
SmilChr01G003478 Chr01 NC_080387.1:53339058-53339070promoter 内 3554-3566 bp + 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 53339505-53343594(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGTTTGACTAAG
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SmilChr02G005144 Chr02 NC_080388.1:72843332-72843344promoter 内 3120-3132 bp + 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 72840117-72842463(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCTAGTCAAACAA
SmilChr02G001893 Chr02 NC_080388.1:34234492-34234504promoter 内 2698-2710 bp - 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 34235795-34239338(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAACTTG
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SmilChr03G002381 Chr03 NC_080389.1:37586905-37586917promoter 内 1113-1125 bp + 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 37589793-37590486(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTAAG
SmilChr03G003299 Chr03 NC_080389.1:51096678-51096690promoter 内 1083-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 51099596-51100814(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTCGA
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SmilChr02G004038 Chr02 NC_080388.1:62703477-62703489promoter 内 3982-3994 bp + 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62698756-62703470(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTAGTCAACTAT
SmilChr02G002227 Chr02 NC_080388.1:39620640-39620652promoter 内 3964-3976 bp + 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 39619583-39620615(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAATGAT
SmilChr01G005505 Chr01 NC_080387.1:71908506-71908518promoter 内 3957-3969 bp + 32 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 71906613-71908474(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAGAGTCAACTGA
SmilChr02G004156 Chr02 NC_080388.1:63883804-63883816promoter 内 3882-3894 bp - 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63883923-63886493(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAAAATT
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SmilChr01G004592 Chr01 NC_080387.1:63921307-63921319promoter 内 3873-3885 bp - 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63921435-63922453(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAAACAT
SmilChr03G004325 Chr03 NC_080389.1:61615119-61615131promoter 内 3822-3834 bp + 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 61614255-61614952(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAATCA
SmilChr01G003194 Chr01 NC_080387.1:50688499-50688511promoter 内 3819-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 50687862-50688329(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGGAGTCAACCTT
SmilChr01G005842 Chr01 NC_080387.1:74415780-74415792promoter 内 3779-3791 bp + 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 74411756-74415570(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAAACGG
SmilChr01G004818 Chr01 NC_080387.1:66353995-66354007promoter 内 3771-3783 bp + 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 66354225-66356865(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGATTTGACTATG
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SmilChr01G001880 Chr01 NC_080387.1:33823493-33823505promoter 内 3660-3672 bp + 329 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33820325-33823164(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAATTC