转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G004480; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00029285-RA_Salv SmilChr07G004480 WRKY XP_057776222.1 MP00531 CTTTGACTTTTTT

可能结合的靶基因

9784 个结合位点 6663 个候选靶基因 第 12 / 134 下载 TSV

上一页 12 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003126 Chr02 NC_080388.1:52291477-52291489promoter 内 3616-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 52291862-52296540(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCGAAAGTCAACG
SmilChr02G001641 Chr02 NC_080388.1:30491856-30491868promoter 内 3596-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 30492261-30495190(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr02G001842 Chr02 NC_080388.1:33619131-33619143promoter 内 3568-3580 bp - 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 33615806-33618710(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr01G001409 Chr01 NC_080387.1:27679684-27679696promoter 内 3567-3579 bp + 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 27680118-27683052(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr02G001822 Chr02 NC_080388.1:33108022-33108034promoter 内 3557-3569 bp - 432 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 33104793-33107590(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr02G001794 Chr02 NC_080388.1:32718184-32718196promoter 内 3556-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 32714814-32717751(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr03G000964 Chr03 NC_080389.1:10870511-10870523promoter 内 3553-3565 bp + 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 10870959-10873841(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr03G000963 Chr03 NC_080389.1:10860763-10860775promoter 内 3552-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 10861212-10863975(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr01G000497 Chr01 NC_080387.1:10135098-10135110promoter 内 3527-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 10131296-10134636(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr02G000825 Chr02 NC_080388.1:13951360-13951372promoter 内 3519-3531 bp - 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 13948074-13950890(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr03G000965 Chr03 NC_080389.1:10880259-10880271promoter 内 3514-3526 bp + 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 10880746-10883586(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr02G003615 Chr02 NC_080388.1:57408834-57408846promoter 内 3456-3468 bp + 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 57409379-57422409(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr01G001664 Chr01 NC_080387.1:30721120-30721132promoter 内 3414-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 30719296-30720545(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAAAAAGTCAAAA
SmilChr01G004523 Chr01 NC_080387.1:63367764-63367776promoter 内 3049-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 63363596-63366824(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAAGG
SmilChr03G001494 Chr03 NC_080389.1:18230005-18230017promoter 内 2931-2943 bp - 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 18231075-18233159(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAAAAAGTCAAAA
SmilChr02G004930 Chr02 NC_080388.1:71308277-71308289promoter 内 2861-2873 bp + 1128 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 71303865-71307149(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAAGG
SmilChr03G000284 Chr03 NC_080389.1:3244757-3244769promoter 内 2792-2804 bp - 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 3241316-3243560(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CGTTGACTTTCGG
SmilChr01G001031 Chr01 NC_080387.1:21475954-21475966promoter 内 2778-2790 bp - 1211 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 21469046-21474743(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr02G001811 Chr02 NC_080388.1:32932237-32932249promoter 内 2475-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 32925959-32930723(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TGTTGACTTTTGA
SmilChr03G001541 Chr03 NC_080389.1:19314285-19314297promoter 内 2457-2469 bp + 1532 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 19308598-19312753(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 AAGAAAGTCAAAG
SmilChr01G003486 Chr01 NC_080387.1:53419754-53419766promoter 内 2364-2376 bp + 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 53416969-53418129(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAAGG
SmilChr01G004227 Chr01 NC_080387.1:60647220-60647232promoter 内 2335-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 60643350-60645566(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAAAAAGTCAAAA
SmilChr01G004066 Chr01 NC_080387.1:59073656-59073668promoter 内 2272-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 59070817-59071939(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CGTTGACTTTCGG
SmilChr02G002242 Chr02 NC_080388.1:39802774-39802786promoter 内 2170-2182 bp - 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 39798509-39800955(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCTTGACTTTTGT
SmilChr01G000181 Chr01 NC_080387.1:3133191-3133203promoter 内 2033-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 3129296-3131235(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAAAAAGTCAAAA
SmilChr01G002239 Chr01 NC_080387.1:38940984-38940996promoter 内 1344-1356 bp - 2645 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 38935535-38938339(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTTG
SmilChr01G000983 Chr01 NC_080387.1:20839154-20839166promoter 内 1200-1212 bp - 2789 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 20841955-20843842(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAAAAAGTCAAAA
SmilChr01G003620 Chr01 NC_080387.1:54749205-54749217promoter 内 1036-1048 bp + 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 54752170-54757040(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCTTGACTTTTGT
SmilChr01G000740 Chr01 NC_080387.1:16396294-16396306promoter 内 921-933 bp - 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 16399374-16400258(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAAGG
SmilChr02G000058 Chr02 NC_080388.1:747216-747228promoter 内 675-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 750542-752749(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAAGG
SmilChr02G003111 Chr02 NC_080388.1:52089880-52089892promoter 内 647-659 bp + 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 52085105-52086538(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TCAAAAGTCAACA
SmilChr01G001662 Chr01 NC_080387.1:30721120-30721132promoter 内 550-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 30713131-30717681(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAAAAAGTCAAAA
SmilChr01G003891 Chr01 NC_080387.1:57218338-57218350promoter 内 505-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 57213067-57214854(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCTTGACTTTTTA
SmilChr01G001053 Chr01 NC_080387.1:21870662-21870674promoter 内 499-511 bp - 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 21874164-21877195(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAAGG
SmilChr02G004287 Chr02 NC_080388.1:65184412-65184424promoter 内 235-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 65174032-65180658(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CGTTGACTTTCGG
SmilChr02G001795 Chr02 NC_080388.1:32718184-32718196promoter 内 193-205 bp - 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 32721992-32722846(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAAAAAGTCAAAA
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