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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 121 / 135 下载 TSV

上一页 121 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002877 Chr01 NC_080387.1:47354341-47354355promoter 内 1555-1569 bp + 2432 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 47356787-47358080(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGTCCCCTTATCTAT
SmilChr01G005878 Chr01 NC_080387.1:74726732-74726746promoter 内 1503-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 74721717-74724248(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCAAGTGTTATCCTT
SmilChr02G004426 Chr02 NC_080388.1:66595743-66595757promoter 内 1360-1374 bp - 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 66590778-66593116(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACGCTTATTATCCTC
SmilChr02G000554 Chr02 NC_080388.1:7776511-7776525promoter 内 1220-1234 bp + 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 7773397-7773744(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATGATAAGGTTCCA
SmilChr02G001282 Chr02 NC_080388.1:23648735-23648749promoter 内 1057-1071 bp - 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 23644815-23645805(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACTGCCTTATCATT
SmilChr03G001968 Chr03 NC_080389.1:28371770-28371784promoter 内 1026-1040 bp - 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 28367274-28368809(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGAAACTTATCCTT
SmilChr01G000030 Chr01 NC_080387.1:548917-548931promoter 内 980-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 544795-545910(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAACAACATC
SmilChr02G005369 Chr02 NC_080388.1:74376855-74376869promoter 内 872-886 bp + 3115 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 74372779-74373740(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTGATAAGGCAATA
SmilChr02G004859 Chr02 NC_080388.1:70726400-70726414promoter 内 840-854 bp - 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 70720193-70723253(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CGCTGTCTTATCCCT
SmilChr03G000590 Chr03 NC_080389.1:6564004-6564018promoter 内 761-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 6567244-6570284(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTCAGTATTATCCTT
SmilChr02G004760 Chr02 NC_080388.1:69788808-69788822promoter 内 730-744 bp - 3257 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 69792079-69794247(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGTTGTTT
SmilChr03G002669 Chr03 NC_080389.1:42370454-42370468promoter 内 662-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 42373793-42374845(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTGATAAGGTATGT
SmilChr02G002173 Chr02 NC_080388.1:38959901-38959915promoter 内 647-661 bp + 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 38956013-38956561(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGGATAAGTATGAC
SmilChr02G000598 Chr02 NC_080388.1:8642201-8642215promoter 内 633-647 bp - 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 8634748-8638847(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTACACCTTATCTGG
SmilChr03G002090 Chr03 NC_080389.1:32190054-32190068promoter 内 622-636 bp + 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 32184231-32186689(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTGATAAGGCGGAT
SmilChr02G001258 Chr02 NC_080388.1:23086109-23086123promoter 内 516-530 bp + 3471 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 23079644-23082638(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAGGATAAGAACCAA
SmilChr02G002615 Chr02 NC_080388.1:45312470-45312484promoter 内 486-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 45315985-45319676(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAACACAATT
SmilChr01G005030 Chr01 NC_080387.1:68256653-68256667promoter 内 483-497 bp - 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 68252373-68253149(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACCCCCTTATCCAG
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SmilChr01G003752 Chr01 NC_080387.1:55897740-55897754promoter 内 282-296 bp - 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 55901459-55906911(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAATCTTAAT
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SmilChr03G000581 Chr03 NC_080389.1:6455621-6455635promoter 内 137-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 6459485-6466487(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATGATAAGGAAATA
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SmilChr01G000272 Chr01 NC_080387.1:5412498-5412512promoter 内 2292-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 3 5414207-5415073(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCACGTCTTATCCGT
SmilChr03G002912 Chr03 NC_080389.1:45868179-45868193promoter 内 2952-2966 bp - 1035 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 45866385-45867144(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAATATATTATCCTT
SmilChr01G004847 Chr01 NC_080387.1:66620378-66620392promoter 内 2829-2843 bp + 1158 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 66621550-66625582(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAATATATTATCCTT
SmilChr02G002038 Chr02 NC_080388.1:36683573-36683587promoter 内 2614-2628 bp - 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 36679066-36682200(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCTCTGATTATCCTC
SmilChr01G000169 Chr01 NC_080387.1:2758144-2758158promoter 内 2613-2627 bp - 1374 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 2759532-2759636(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGTAAGGG
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SmilChr02G002752 Chr02 NC_080388.1:47548254-47548268promoter 内 750-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 47542130-47545017(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CACATCGATATCCTC
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SmilChr02G002613 Chr02 NC_080388.1:45307141-45307155promoter 内 3944-3958 bp - 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 45307198-45309376(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCGGATAAGAAAAGA
SmilChr03G001035 Chr03 NC_080389.1:12054027-12054041promoter 内 3925-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 12050264-12053965(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAAAAACTTATCCCC
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SmilChr01G002952 Chr01 NC_080387.1:48396657-48396671promoter 内 3874-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 48396784-48401513(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGAGATAAGGGGTGC
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SmilChr03G002640 Chr03 NC_080389.1:41972094-41972108promoter 内 3813-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 41969327-41971920(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGGATAAGGGCCCA
SmilChr01G000262 Chr01 NC_080387.1:5083878-5083892promoter 内 3679-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 5059298-5083570(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAATATATTT
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SmilChr01G005850 Chr01 NC_080387.1:74440591-74440605promoter 内 3483-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 74438105-74440087(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGAAGCTTATCCCT
SmilChr01G002509 Chr01 NC_080387.1:42985276-42985290promoter 内 3478-3492 bp - 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 42985799-42988442(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGGATAAGCGTTTG