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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 14 / 134 下载 TSV

上一页 14 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003193 Chr02 NC_080388.1:53078777-53078791promoter 内 518-532 bp + 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 53082260-53083416(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGAATAATGATGAT
SmilChr02G003803 Chr02 NC_080388.1:59664847-59664861promoter 内 501-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 59659322-59661361(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGATAATGATTGT
SmilChr03G001873 Chr03 NC_080389.1:25977079-25977093promoter 内 3807-3821 bp - 180 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 25977273-25978713(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTACATCT
SmilChr01G005695 Chr01 NC_080387.1:73231211-73231225promoter 内 3362-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 73223758-73230586(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATGTTT
SmilChr02G003780 Chr02 NC_080388.1:59485199-59485213promoter 内 3212-3226 bp - 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 59483461-59484424(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGATATAATGATGAT
SmilChr01G005696 Chr01 NC_080387.1:73231211-73231225promoter 内 2024-2038 bp + 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 73233188-73241369(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAACATAATGATGAG
SmilChr02G003781 Chr02 NC_080388.1:59485199-59485213promoter 内 1344-1358 bp - 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 59487856-59490837(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATCT
SmilChr03G002643 Chr03 NC_080389.1:42037617-42037631promoter 内 1295-1309 bp + 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 42029806-42034925(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCATA
SmilChr01G003250 Chr01 NC_080387.1:51216482-51216496promoter 内 927-941 bp - 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 51219556-51221377(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATACTT
SmilChr01G005570 Chr01 NC_080387.1:72474233-72474247promoter 内 3042-3056 bp + 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 72475192-72477490(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAATATAATGATGAT
SmilChr02G004220 Chr02 NC_080388.1:64411617-64411631promoter 内 553-567 bp + 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 64415065-64415801(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAATGCAATGATTGT
SmilChr02G005067 Chr02 NC_080388.1:72341982-72341996promoter 内 3753-3767 bp - 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 72336849-72341748(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAATAATGATGAT
SmilChr01G001278 Chr01 NC_080387.1:25578212-25578226promoter 内 3567-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 25577118-25577792(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTATGTAATGATGAT
SmilChr02G004547 Chr02 NC_080388.1:68017666-68017680promoter 内 1953-1967 bp + 2034 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 68019714-68020863(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAATATAATGATGAT
SmilChr01G004898 Chr01 NC_080387.1:67055383-67055397promoter 内 1505-1519 bp + 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 67049549-67052901(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACATAA
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SmilChr02G002714 Chr02 NC_080388.1:46979931-46979945promoter 内 128-142 bp + 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 46983804-46987494(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAATAATGATGAT
SmilChr02G001587 Chr02 NC_080388.1:29615650-29615664promoter 内 3894-3908 bp - 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 29615757-29616318(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTACCTCT
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SmilChr02G005395 Chr02 NC_080388.1:74549697-74549711promoter 内 3520-3534 bp + 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 74547680-74549230(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACATTC
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SmilChr02G002262 Chr02 NC_080388.1:40077669-40077683promoter 内 3021-3035 bp - 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 40078649-40081433(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATCAAA
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SmilChr02G004792 Chr02 NC_080388.1:70117388-70117402promoter 内 2869-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 70114528-70116270(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACTAAA
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SmilChr01G004935 Chr01 NC_080387.1:67423831-67423845promoter 内 1887-1901 bp - 2100 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 67425945-67427198(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTACAAAT
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SmilChr02G002160 Chr02 NC_080388.1:38829692-38829706promoter 内 1215-1229 bp + 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 38819841-38826920(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTATCATA
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SmilChr01G003612 Chr01 NC_080387.1:54668536-54668550promoter 内 161-175 bp + 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 54663828-54664710(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATATGT
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SmilChr03G000453 Chr03 NC_080389.1:4835005-4835019promoter 内 18-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 4838988-4839974(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGGTGATGATTAA
SmilChr02G004906 Chr02 NC_080388.1:71050453-71050467promoter 内 2965-2979 bp - 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 6 71045183-71049431(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAACAATGATTAC
SmilChr01G003071 Chr01 NC_080387.1:49560868-49560882promoter 内 1905-1919 bp - 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 6 49553057-49558786(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACGACAATGATTAC
SmilChr01G003100 Chr01 NC_080387.1:49810961-49810975promoter 内 2307-2321 bp + 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 5 49805545-49809281(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTGTTATA
SmilChr01G002629 Chr01 NC_080387.1:44592791-44592805promoter 内 1566-1580 bp + 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 5 44595226-44600028(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAACAATGATTAC
SmilChr02G004475 Chr02 NC_080388.1:67143447-67143461promoter 内 93-107 bp - 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 5 67139480-67139553(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAACAATGATTAC
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SmilChr01G003238 Chr01 NC_080387.1:51130645-51130659promoter 内 3333-3347 bp - 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 51127601-51129991(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAACAATGATTAC
SmilChr02G001787 Chr02 NC_080388.1:32643381-32643395promoter 内 3189-3203 bp - 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 32640338-32642583(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAACAATGATTAC
SmilChr03G001846 Chr03 NC_080389.1:25381911-25381925promoter 内 3185-3199 bp - 802 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 25376689-25381109(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAACAATGATTAC