Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000593; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00001545-RA_Salv SmilChr05G000593 MIKC_MADS XP_057764223.1 MP00609 TTTTTTCCATTTTTGGTAA

可能结合的靶基因

9941 个结合位点 7575 个候选靶基因 第 144 / 152 下载 TSV

上一页 144 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr04G003883 Chr04 NC_080390.1:54665749-54665767promoter 内 3355-3373 bp + 628 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54666395-54668033(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TATTTTTCATTTTTGGGAC
SmilChr05G002475 Chr05 NC_080391.1:27253856-27253874promoter 内 3334-3352 bp - 649 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 27249475-27253207(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CATTTTCCATTTTCGTCTG
SmilChr05G000355 Chr05 NC_080391.1:2670670-2670688promoter 内 3290-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 2667742-2669977(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CGACCAAAAAGAGAAGAAG
SmilChr03G001091 Chr03 NC_080389.1:12612054-12612072promoter 内 3256-3274 bp - 727 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 12612799-12615022(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAACCAGAAATGGATGAAA
SmilChr03G002957 Chr03 NC_080389.1:46314963-46314981promoter 内 3253-3271 bp + 730 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 46312661-46314233(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCACCAAAAAAGAAAAGAA
SmilChr01G005085 Chr01 NC_080387.1:68727193-68727211promoter 内 3234-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68724846-68726444(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGGATAAAAATGGTAAGGT
SmilChr06G001214 Chr06 NC_080392.1:12473900-12473918promoter 内 3221-3239 bp - 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 12470395-12473138(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATATATGCTTA
SmilChr02G004475 Chr02 NC_080388.1:67140431-67140449promoter 内 3105-3123 bp - 878 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 67139480-67139553(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATGTTTCCATTTGGAGTTA
SmilChr03G002381 Chr03 NC_080389.1:37588859-37588877promoter 内 3067-3085 bp - 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37589793-37590486(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAAACTAAAATGGAAAATT
SmilChr06G000844 Chr06 NC_080392.1:7975546-7975564promoter 内 3062-3080 bp + 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 7976485-7978117(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TATATGCCATTTTCGGATT
SmilChr01G003077 Chr01 NC_080387.1:49610057-49610075promoter 内 2943-2961 bp + 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49605095-49609017(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GGGACAAAAATAGCAAGGT
SmilChr04G000623 Chr04 NC_080390.1:7082478-7082496promoter 内 2917-2935 bp - 1066 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 7083562-7089291(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATCCCAAAAAAGAAAAATT
SmilChr06G001338 Chr06 NC_080392.1:13920734-13920752promoter 内 2916-2934 bp - 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 13921819-13923194(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGGCCAAAAAAAAAAAGTG
SmilChr01G001338 Chr01 NC_080387.1:26607332-26607350promoter 内 2876-2894 bp + 1107 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 26608457-26614485(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTTTTTCCTCTTCTGTGAG
SmilChr06G000536 Chr06 NC_080392.1:4483823-4483841promoter 内 2859-2877 bp + 1124 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4474124-4482699(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAGCCCTAAATGGATAATC
SmilChr02G000587 Chr02 NC_080388.1:8442928-8442946promoter 内 2798-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8444131-8445285(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCATTTTCGTTCG
SmilChr02G003237 Chr02 NC_080388.1:53646637-53646655promoter 内 2767-2785 bp + 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 53642064-53645421(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATAACAGAAAAAGAAAAAA
SmilChr01G006055 Chr01 NC_080387.1:76027571-76027589promoter 内 2723-2741 bp + 1260 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 76025012-76026311(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGACCAAAACAGGCAGATG
SmilChr05G002147 Chr05 NC_080391.1:22653034-22653052promoter 内 2706-2724 bp - 1277 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 22654329-22655116(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGACCATAAATGGAACTGT
SmilChr01G002492 Chr01 NC_080387.1:42662274-42662292promoter 内 2704-2722 bp - 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42663571-42665645(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GTCCCAAAAATAGTAATTT
SmilChr03G002875 Chr03 NC_080389.1:45424852-45424870promoter 内 2635-2653 bp - 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45426218-45438535(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCCCAAAAAAAAAAAAAA
SmilChr02G001047 Chr02 NC_080388.1:18536930-18536948promoter 内 2626-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 18535094-18535573(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATTTTCTATTTTTGCACA
SmilChr01G005278 Chr01 NC_080387.1:70187640-70187658promoter 内 2607-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 70189034-70190936(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGTCCGAAAATGGACATGC
SmilChr01G002903 Chr01 NC_080387.1:47726751-47726769promoter 内 2604-2622 bp - 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 47728148-47730258(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACACCAAAAATAGAATAGA
SmilChr02G004867 Chr02 NC_080388.1:70781282-70781300promoter 内 2589-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 70782694-70782767(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TATGCAAAAATAGAAATAA
SmilChr03G002809 Chr03 NC_080389.1:44551901-44551919promoter 内 2565-2583 bp + 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 44543472-44550483(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GTCCCAAAAAGGAAAAGGA
SmilChr05G001118 Chr05 NC_080391.1:9329679-9329697promoter 内 2562-2580 bp + 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 9331118-9331811(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTTCTATTTTAGTTTA
SmilChr03G002385 Chr03 NC_080389.1:37774263-37774281promoter 内 2561-2579 bp - 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37770658-37772841(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTTTTCCATTTTTATGCA
SmilChr03G003056 Chr03 NC_080389.1:47453507-47453525promoter 内 2541-2559 bp - 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 47454967-47455613(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TCGCCGGAAATGGAGAAGA
SmilChr04G001218 Chr04 NC_080390.1:19016270-19016288promoter 内 2488-2506 bp + 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 19017783-19019467(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GATTTTCCAGTTCTGCCAA
SmilChr03G004649 Chr03 NC_080389.1:64039699-64039717promoter 内 2397-2415 bp - 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64035093-64038113(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTTCCTTTTAAGTTAT
SmilChr03G003515 Chr03 NC_080389.1:53747157-53747175promoter 内 2393-2411 bp + 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 53748765-53751784(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATTTGCCATTTTGGTCCG
SmilChr05G002081 Chr05 NC_080391.1:21742992-21743010promoter 内 2373-2391 bp + 1610 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 21744620-21746183(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTTTTCCATTTTCATTAA
SmilChr05G001858 Chr05 NC_080391.1:18601759-18601777promoter 内 2360-2378 bp + 1623 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 18603400-18605824(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TATTTTTCATTTTTGGGAC
SmilChr01G004372 Chr01 NC_080387.1:61923834-61923852promoter 内 2302-2320 bp + 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 61925533-61927324(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TCTTTATCACTTTTGGTCA
SmilChr06G000766 Chr06 NC_080392.1:7143577-7143595promoter 内 2236-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 7135218-7141830(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CATCCAAAAATGGTGAGGC
SmilChr02G003506 Chr02 NC_080388.1:56247880-56247898promoter 内 2225-2243 bp - 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 56244107-56246122(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACATTTCTATTTTTGTACA
SmilChr06G000191 Chr06 NC_080392.1:1324915-1324933promoter 内 2224-2242 bp + 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1319084-1323156(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCCCAAAAAAAAAAAAAA
SmilChr02G003314 Chr02 NC_080388.1:54395699-54395717promoter 内 2223-2241 bp - 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54397477-54399615(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCACAGAAGAAGAAAAAA
SmilChr02G000076 Chr02 NC_080388.1:976654-976672promoter 内 2215-2233 bp - 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 972487-974886(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTTTTTTTTTTGGGAA
SmilChr01G003665 Chr01 NC_080387.1:55072182-55072200promoter 内 2180-2198 bp + 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55067997-55070379(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGCACAAAAATAGAAAATC
SmilChr01G004879 Chr01 NC_080387.1:66880231-66880249promoter 内 2159-2177 bp - 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 66882073-66884023(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAGCCAAAAATGGGGATGA
SmilChr03G000848 Chr03 NC_080389.1:9758261-9758279promoter 内 2120-2138 bp + 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 9663105-9756398(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TATCCAAAAAAGGTGAACT
SmilChr01G003404 Chr01 NC_080387.1:52715658-52715676promoter 内 2115-2133 bp + 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 52717544-52721301(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTTTTGCCATTTTGGTTCG
SmilChr05G001251 Chr05 NC_080391.1:10640128-10640146promoter 内 2074-2092 bp + 1909 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 10642055-10645817(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTTCTTTTTTGGTGG
SmilChr06G000566 Chr06 NC_080392.1:4815148-4815166promoter 内 2064-2082 bp - 1919 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4817085-4827917(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGTCCAAAAATAGGCAGAA
SmilChr01G005248 Chr01 NC_080387.1:70009586-70009604promoter 内 2032-2050 bp - 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 70011555-70016026(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GGTACAAAAATAGAAAGAG
SmilChr02G005160 Chr02 NC_080388.1:72944981-72944999promoter 内 2030-2048 bp + 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 72946952-72949072(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATGGGTCCATTTGTGGCAA
SmilChr05G001825 Chr05 NC_080391.1:18253792-18253810promoter 内 2022-2040 bp - 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 18249099-18251831(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACTTTTTTTTTTTTGGTAA
SmilChr04G000468 Chr04 NC_080390.1:5003454-5003472promoter 内 1923-1941 bp - 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5005532-5006849(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TCCACAAAAATGGCAATGT