转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 16 / 143 下载 TSV

上一页 16 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000767 Chr06 NC_080392.1:7149820-7149831promoter 内 1747-1758 bp - 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 7146709-7147577(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr02G005392 Chr02 NC_080388.1:74537663-74537674promoter 内 1398-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 74532819-74535071(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAC
SmilChr04G001484 Chr04 NC_080390.1:24268522-24268533promoter 内 1346-1357 bp + 2644 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 24271177-24288406(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr01G005718 Chr01 NC_080387.1:73371689-73371700promoter 内 1340-1351 bp - 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 73374350-73376322(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCAG
SmilChr03G000333 Chr03 NC_080389.1:3774812-3774823promoter 内 1312-1323 bp - 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3777501-3780755(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAT
SmilChr08G001207 Chr08 NC_080394.1:9749159-9749170promoter 内 1241-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 9745361-9746410(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr03G004583 Chr03 NC_080389.1:63685406-63685417promoter 内 1131-1142 bp - 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 63688276-63694295(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCGG
SmilChr02G003497 Chr02 NC_080388.1:56198281-56198292promoter 内 944-955 bp + 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 56201338-56201897(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr03G000352 Chr03 NC_080389.1:3949835-3949846promoter 内 878-889 bp - 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3943991-3946723(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr05G002168 Chr05 NC_080391.1:22985165-22985176promoter 内 499-510 bp + 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 22988667-22991068(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr03G004584 Chr03 NC_080389.1:63685406-63685417promoter 内 132-143 bp - 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 63689275-63692718(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCGG
SmilChr04G003777 Chr04 NC_080390.1:53976897-53976908promoter 内 3466-3477 bp - 524 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 53967675-53976373(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCCAGCTGTA
SmilChr08G002026 Chr08 NC_080394.1:18075097-18075108promoter 内 3559-3570 bp + 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 18075539-18079658(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCCAGCTGTA
SmilChr04G003131 Chr04 NC_080390.1:47907583-47907594promoter 内 1786-1797 bp + 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 47903741-47905379(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTT
SmilChr03G004613 Chr03 NC_080389.1:63852398-63852409promoter 内 1215-1226 bp + 2775 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 63845222-63849623(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTT
SmilChr03G004612 Chr03 NC_080389.1:63852398-63852409promoter 内 1189-1200 bp + 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 63839534-63849597(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTT
SmilChr05G002728 Chr05 NC_080391.1:31406664-31406675promoter 内 587-598 bp - 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 31400301-31403261(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCCAGCTGTA
SmilChr04G001950 Chr04 NC_080390.1:31636623-31636634promoter 内 314-325 bp + 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 31630659-31632947(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCTC
SmilChr06G002322 Chr06 NC_080392.1:33495347-33495358promoter 内 222-233 bp + 3768 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 33489291-33491579(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCTC
SmilChr04G002277 Chr04 NC_080390.1:36996167-36996178promoter 内 51-62 bp - 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 37000117-37006529(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCTC
SmilChr08G003586 Chr08 NC_080394.1:38632276-38632287promoter 内 2663-2674 bp + 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 38633614-38649024(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr02G003167 Chr02 NC_080388.1:52704864-52704875promoter 内 1579-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 52701137-52702453(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCA
SmilChr02G003169 Chr02 NC_080388.1:52704864-52704875promoter 内 252-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 52708613-52716242(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr03G001945 Chr03 NC_080389.1:27726084-27726095promoter 内 2793-2804 bp + 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 27727292-27730928(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGCCAGCTGTT
SmilChr08G003584 Chr08 NC_080394.1:38617122-38617133promoter 内 2663-2674 bp + 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 38618460-38631207(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr02G001467 Chr02 NC_080388.1:27408995-27409006promoter 内 2015-2026 bp + 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 27403928-27407020(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAA
SmilChr01G004186 Chr01 NC_080387.1:60287817-60287828promoter 内 1676-1687 bp + 2314 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 60290142-60296371(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr03G001152 Chr03 NC_080389.1:13309829-13309840promoter 内 1622-1633 bp + 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 13305279-13307461(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCA
SmilChr02G001510 Chr02 NC_080388.1:28111235-28111246promoter 内 1579-1590 bp - 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 28113657-28117648(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCA
SmilChr04G003794 Chr04 NC_080390.1:54129832-54129843promoter 内 1494-1505 bp - 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 54125337-54127336(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGTC
SmilChr05G003724 Chr05 NC_080391.1:50342198-50342209promoter 内 888-899 bp + 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 50345311-50346372(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr04G001094 Chr04 NC_080390.1:15651076-15651087promoter 内 836-847 bp - 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 15654241-15656138(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAA
SmilChr02G001572 Chr02 NC_080388.1:29145020-29145031promoter 内 636-647 bp - 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 29148385-29153062(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCA
SmilChr01G005057 Chr01 NC_080387.1:68488114-68488125promoter 内 274-285 bp + 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 68491841-68495297(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr07G002135 Chr07 NC_080393.1:19498089-19498100promoter 内 254-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 19501836-19506665(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr01G001370 Chr01 NC_080387.1:27042391-27042402promoter 内 152-163 bp + 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 27046240-27050291(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTA
SmilChr08G001689 Chr08 NC_080394.1:14100166-14100177promoter 内 3809-3820 bp + 181 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 14100358-14102411(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTC
SmilChr08G000347 Chr08 NC_080394.1:2405135-2405146promoter 内 3496-3507 bp - 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 2402369-2404641(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTC
SmilChr01G003652 Chr01 NC_080387.1:54981396-54981407promoter 内 3015-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 54982382-54989938(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTC
SmilChr06G000206 Chr06 NC_080392.1:1404812-1404823promoter 内 2638-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 1401045-1403460(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCGC
SmilChr01G004202 Chr01 NC_080387.1:60486474-60486485promoter 内 1950-1961 bp - 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 60483973-60484434(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTC
SmilChr04G002667 Chr04 NC_080390.1:42066479-42066490promoter 内 1770-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 42064188-42064259(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAA
SmilChr04G002623 Chr04 NC_080390.1:41641199-41641210promoter 内 1744-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 41638882-41638953(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAA
SmilChr01G000127 Chr01 NC_080387.1:2137502-2137513promoter 内 1362-1373 bp + 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 2140141-2140734(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTC
SmilChr04G002622 Chr04 NC_080390.1:41641199-41641210promoter 内 948-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 41636145-41638157(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAA
SmilChr03G001158 Chr03 NC_080389.1:13352619-13352630promoter 内 922-933 bp + 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 13355698-13357162(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCGC
SmilChr04G002666 Chr04 NC_080390.1:42066479-42066490promoter 内 802-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 42061272-42063291(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAA
SmilChr05G001250 Chr05 NC_080391.1:10629636-10629647promoter 内 654-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 10632983-10635994(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCTC
SmilChr08G000346 Chr08 NC_080394.1:2405135-2405146promoter 内 523-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 2400007-2401668(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTC
SmilChr01G005084 Chr01 NC_080387.1:68720920-68720931promoter 内 3921-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 68721000-68722304(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGCCAGCTGTA