转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 17 / 143 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000684 Chr04 NC_080390.1:7982294-7982305promoter 内 2245-2256 bp + 1745 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 7979145-7980549(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCCA
SmilChr07G003723 Chr07 NC_080393.1:45220628-45220639promoter 内 3827-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 45217620-45220465(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCCA
SmilChr05G001813 Chr05 NC_080391.1:18095409-18095420promoter 内 2965-2976 bp + 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 18089460-18094384(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCCA
SmilChr02G003708 Chr02 NC_080388.1:58638025-58638036promoter 内 2675-2686 bp - 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 58634544-58636710(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGGA
SmilChr08G003198 Chr08 NC_080394.1:32804759-32804770promoter 内 2536-2547 bp - 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 32801308-32803305(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGGA
SmilChr01G005973 Chr01 NC_080387.1:75405383-75405394promoter 内 2156-2167 bp + 1834 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 75400437-75403549(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCT
SmilChr01G001466 Chr01 NC_080387.1:28451154-28451165promoter 内 2146-2157 bp - 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 28453009-28456605(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCCC
SmilChr03G000307 Chr03 NC_080389.1:3498626-3498637promoter 内 1523-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 3493752-3496159(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAT
SmilChr05G000890 Chr05 NC_080391.1:7056051-7056062promoter 内 1490-1501 bp + 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 7051521-7053551(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAT
SmilChr03G001964 Chr03 NC_080389.1:28155585-28155596promoter 内 1064-1075 bp + 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 28148309-28152659(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCCA
SmilChr02G002221 Chr02 NC_080388.1:39484792-39484803promoter 内 269-280 bp - 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 39488524-39489384(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCT
SmilChr01G005677 Chr01 NC_080387.1:73050293-73050304promoter 内 3837-3848 bp + 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 73050457-73051714(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAC
SmilChr01G005673 Chr01 NC_080387.1:73002688-73002699promoter 内 3833-3844 bp + 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 73002856-73004410(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAC
SmilChr06G001941 Chr06 NC_080392.1:23835318-23835329promoter 内 3365-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 23831066-23834693(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAT
SmilChr04G000039 Chr04 NC_080390.1:366941-366952promoter 内 3294-3305 bp + 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 367648-369326(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGCCAGCTGTG
SmilChr01G005667 Chr01 NC_080387.1:72968929-72968940promoter 内 2975-2986 bp + 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 72969955-72972116(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAC
SmilChr05G003823 Chr05 NC_080391.1:51622018-51622029promoter 内 2622-2633 bp - 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 51623397-51631720(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAT
SmilChr06G002492 Chr06 NC_080392.1:35803314-35803325promoter 内 2587-2598 bp + 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 35804728-35810919(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGCCAGCTGTG
SmilChr06G002952 Chr06 NC_080392.1:42326374-42326385promoter 内 2428-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 42327947-42330031(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTC
SmilChr08G003502 Chr08 NC_080394.1:37576362-37576373promoter 内 1848-1859 bp - 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 37578515-37580132(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAT
SmilChr05G000892 Chr05 NC_080391.1:7056051-7056062promoter 内 1834-1845 bp + 2156 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7058218-7062033(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTC
SmilChr03G003904 Chr03 NC_080389.1:58139525-58139536promoter 内 1767-1778 bp - 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 58141759-58142458(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCTA
SmilChr04G000217 Chr04 NC_080390.1:1907760-1907771promoter 内 1554-1565 bp - 2436 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 1903660-1905324(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTC
SmilChr02G001364 Chr02 NC_080388.1:25623637-25623648promoter 内 1479-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 25615077-25621126(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAT
SmilChr07G004700 Chr07 NC_080393.1:59903009-59903020promoter 内 1050-1061 bp - 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 59898530-59900069(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTC
SmilChr01G004740 Chr01 NC_080387.1:65596887-65596898promoter 内 470-481 bp + 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 65592655-65593367(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCGA
SmilChr08G002210 Chr08 NC_080394.1:20072519-20072530promoter 内 364-375 bp + 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 20076156-20079410(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGCCAGCTGTG
SmilChr07G001689 Chr07 NC_080393.1:14303901-14303912promoter 内 175-186 bp + 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 14307727-14315705(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTC
SmilChr07G000307 Chr07 NC_080393.1:2024617-2024628promoter 内 154-165 bp + 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 2019820-2020781(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAT
SmilChr03G001751 Chr03 NC_080389.1:23741039-23741050promoter 内 3938-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 23741102-23741413(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGTA
SmilChr03G004281 Chr03 NC_080389.1:61235728-61235739promoter 内 3738-3749 bp - 252 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 61235991-61239443(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGAAA
SmilChr06G001636 Chr06 NC_080392.1:18379339-18379350promoter 内 3580-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 18379760-18387948(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTC
SmilChr02G002623 Chr02 NC_080388.1:45527438-45527449promoter 内 3454-3465 bp + 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 45527985-45529888(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCGA
SmilChr04G002288 Chr04 NC_080390.1:37169211-37169222promoter 内 3276-3287 bp + 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 37169936-37171128(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGGA
SmilChr06G000246 Chr06 NC_080392.1:1640489-1640500promoter 内 3132-3143 bp + 858 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 1641358-1643323(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGAC
SmilChr03G001750 Chr03 NC_080389.1:23741039-23741050promoter 内 2457-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 23736896-23739506(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCGG
SmilChr05G002333 Chr05 NC_080391.1:25227293-25227304promoter 内 2333-2344 bp + 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 25228961-25230122(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGTA
SmilChr04G000140 Chr04 NC_080390.1:1194074-1194085promoter 内 2098-2109 bp - 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 1195977-1204618(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCGG
SmilChr04G002289 Chr04 NC_080390.1:37169211-37169222promoter 内 1963-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 37171249-37172985(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGGA
SmilChr07G003558 Chr07 NC_080393.1:41447149-41447160promoter 内 1492-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 41449658-41450638(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGAAA
SmilChr08G001865 Chr08 NC_080394.1:16004278-16004289promoter 内 1401-1412 bp - 2589 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 16006878-16009898(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCTA
SmilChr04G000806 Chr04 NC_080390.1:9970484-9970495promoter 内 911-922 bp - 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 9964424-9967405(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGCCAGCTGTT
SmilChr03G001121 Chr03 NC_080389.1:12921304-12921315promoter 内 533-544 bp - 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 12913771-12917847(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTC
SmilChr08G003570 Chr08 NC_080394.1:38452673-38452684promoter 内 3393-3404 bp + 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 38450533-38452076(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCCA
SmilChr02G004985 Chr02 NC_080388.1:71732480-71732491promoter 内 2326-2337 bp + 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 71734155-71737705(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCCAGCTGTG
SmilChr08G003569 Chr08 NC_080394.1:38452673-38452684promoter 内 1800-1811 bp + 2190 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 38445441-38450483(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCCA
SmilChr02G001485 Chr02 NC_080388.1:27837169-27837180promoter 内 1318-1329 bp - 2672 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 27833629-27834497(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCGA
SmilChr02G001062 Chr02 NC_080388.1:18928705-18928716promoter 内 1265-1276 bp + 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 18924230-18925980(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCAC
SmilChr01G001204 Chr01 NC_080387.1:24265657-24265668promoter 内 889-900 bp + 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 24255738-24262556(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCAC
SmilChr01G002691 Chr01 NC_080387.1:45143424-45143435promoter 内 797-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 45146628-45150823(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGCCAGCTGTT