转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 19 / 134 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003398 Chr02 NC_080388.1:55119861-55119875promoter 内 3501-3515 bp + 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 55120361-55122165(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATCATAATGATTAG
SmilChr03G001964 Chr03 NC_080389.1:28153398-28153412promoter 内 3248-3262 bp + 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 28148309-28152659(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGCAGC
SmilChr02G001775 Chr02 NC_080388.1:32529285-32529299promoter 内 3173-3187 bp + 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 32530113-32535470(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATAATAATGATTGT
SmilChr01G001452 Chr01 NC_080387.1:28212561-28212575promoter 内 3151-3165 bp - 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 28209347-28211725(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTTAGTAATGATGAT
SmilChr01G000726 Chr01 NC_080387.1:16179744-16179758promoter 内 2803-2817 bp - 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 16175692-16178560(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGTAGTGATGATTAT
SmilChr02G000683 Chr02 NC_080388.1:10783244-10783258promoter 内 2528-2542 bp + 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10780977-10781785(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACAAAA
SmilChr01G005131 Chr01 NC_080387.1:69107075-69107089promoter 内 2447-2461 bp - 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 69108629-69110085(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATTCTC
SmilChr02G000543 Chr02 NC_080388.1:7498087-7498101promoter 内 2132-2146 bp - 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 7493156-7496232(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCTGCTAATGATGAC
SmilChr01G004193 Chr01 NC_080387.1:60380948-60380962promoter 内 2011-2025 bp + 1976 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 60382938-60386414(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATCATAATGATTAG
SmilChr02G004434 Chr02 NC_080388.1:66734132-66734146promoter 内 2008-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66729661-66732153(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATAATAATGATGGT
SmilChr01G000047 Chr01 NC_080387.1:745367-745381promoter 内 1965-1979 bp - 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 738650-743345(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATCCTAATGATGAT
SmilChr02G003636 Chr02 NC_080388.1:57736601-57736615promoter 内 1941-1955 bp + 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57730340-57734555(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTGCGTTC
SmilChr01G000042 Chr01 NC_080387.1:679266-679280promoter 内 1803-1817 bp - 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 675412-677082(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATCCTAATGATGAT
SmilChr02G000544 Chr02 NC_080388.1:7498087-7498101promoter 内 1762-1776 bp - 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 7500326-7500844(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGCAGC
SmilChr02G003286 Chr02 NC_080388.1:54154038-54154052promoter 内 1731-1745 bp - 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54149753-54151782(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAAATAATGATGAT
SmilChr01G005983 Chr01 NC_080387.1:75475845-75475859promoter 内 1499-1513 bp + 2488 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75478347-75479513(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAAATAATGATGAA
SmilChr01G001130 Chr01 NC_080387.1:22982022-22982036promoter 内 1425-1439 bp + 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 22978984-22979460(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGCAGC
SmilChr01G004073 Chr01 NC_080387.1:59136977-59136991promoter 内 1150-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 59127187-59134140(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGAGTAATGATGAA
SmilChr03G001442 Chr03 NC_080389.1:17196270-17196284promoter 内 1104-1118 bp + 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17190121-17193387(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATTTAC
SmilChr02G003484 Chr02 NC_080388.1:56108074-56108088promoter 内 1094-1108 bp + 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 56105110-56105181(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATCATCATA
SmilChr02G001178 Chr02 NC_080388.1:21655083-21655097promoter 内 937-951 bp - 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 21648406-21652033(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTATACAATGATTAC
SmilChr01G003771 Chr01 NC_080387.1:56082670-56082684promoter 内 717-731 bp - 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 56076342-56079400(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTAGCAATGATTAT
SmilChr03G001443 Chr03 NC_080389.1:17196270-17196284promoter 内 677-691 bp + 3310 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17199594-17200208(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAAATAATGATTAT
SmilChr02G003483 Chr02 NC_080388.1:56108074-56108088promoter 内 660-674 bp + 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 56096161-56104747(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATCATCATA
SmilChr01G005773 Chr01 NC_080387.1:73811698-73811712promoter 内 483-497 bp - 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 73803823-73808194(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTATAATGATTAC
SmilChr03G000615 Chr03 NC_080389.1:6812687-6812701promoter 内 476-490 bp - 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 6808133-6809176(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATTGT
SmilChr01G005774 Chr01 NC_080387.1:73811698-73811712promoter 内 358-372 bp - 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 73815341-73819678(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTATAAGT
SmilChr02G000270 Chr02 NC_080388.1:3482738-3482752promoter 内 217-231 bp + 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3486522-3489421(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAAATAATGATGAA
SmilChr02G005366 Chr02 NC_080388.1:74360368-74360382promoter 内 214-228 bp - 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74352580-74356595(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CGTGGTAATGATGAA
SmilChr01G005981 Chr01 NC_080387.1:75475845-75475859promoter 内 208-222 bp + 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75468432-75472066(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATTTCC
SmilChr02G002963 Chr02 NC_080388.1:50146909-50146923promoter 内 45-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 50141901-50142967(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGGATC
SmilChr01G000875 Chr01 NC_080387.1:18624590-18624604promoter 内 3352-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 18625239-18626543(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATAT
SmilChr01G005414 Chr01 NC_080387.1:71370196-71370210promoter 内 2562-2576 bp + 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 71366512-71368771(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATTG
SmilChr01G000874 Chr01 NC_080387.1:18624590-18624604promoter 内 1689-1703 bp - 2298 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 18621521-18622292(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATATATAATGATGAT
SmilChr01G000876 Chr01 NC_080387.1:18624590-18624604promoter 内 1577-1591 bp - 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 18627014-18632149(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATAT
SmilChr01G005760 Chr01 NC_080387.1:73702652-73702666promoter 内 3118-3132 bp - 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 73700573-73701783(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAATATAATGATGAT
SmilChr02G003498 Chr02 NC_080388.1:56205037-56205051promoter 内 1806-1820 bp - 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 56202295-56202856(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGCTAATGATGAA
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SmilChr02G000169 Chr02 NC_080388.1:2181262-2181276promoter 内 1520-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 2177866-2178795(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATGATT
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SmilChr02G004509 Chr02 NC_080388.1:67611266-67611280promoter 内 3541-3555 bp + 446 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 67609877-67610820(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCGTT
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