转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 28 / 136 下载 TSV

上一页 28 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002395 Chr01 NC_080387.1:41265120-41265130promoter 内 333-343 bp - 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 41268788-41269814(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG
SmilChr06G000199 Chr06 NC_080392.1:1368701-1368711promoter 内 323-333 bp + 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1372379-1373058(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCG
SmilChr02G001914 Chr02 NC_080388.1:34449144-34449154promoter 内 98-108 bp - 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 34443481-34445251(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGA
SmilChr02G000727 Chr02 NC_080388.1:11817424-11817434promoter 内 66-76 bp - 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 11821359-11822787(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGCA
SmilChr02G001121 Chr02 NC_080388.1:20212882-20212892promoter 内 9-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 20206755-20208900(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTG
SmilChr07G003436 Chr07 NC_080393.1:37848308-37848318promoter 内 4-14 bp - 3987 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37852305-37852411(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCG
SmilChr05G004281 Chr05 NC_080391.1:56603913-56603923promoter 内 1228-1238 bp + 2763 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 56606686-56609506(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr08G003812 Chr08 NC_080394.1:44287886-44287896promoter 内 3872-3882 bp - 119 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 44288015-44290880(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGT
SmilChr07G002708 Chr07 NC_080393.1:26475781-26475791promoter 内 3656-3666 bp - 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 26466911-26475446(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr07G003529 Chr07 NC_080393.1:40575041-40575051promoter 内 3287-3297 bp - 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 40571596-40574337(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr03G002556 Chr03 NC_080389.1:40737567-40737577promoter 内 3068-3078 bp - 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 40738500-40741310(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCG
SmilChr04G000060 Chr04 NC_080390.1:553044-553054promoter 内 2500-2510 bp - 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 548468-551553(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCCCAGCGCG
SmilChr01G004273 Chr01 NC_080387.1:60968976-60968986promoter 内 2010-2020 bp - 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 60970967-60974633(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr05G003000 Chr05 NC_080391.1:37091625-37091635promoter 内 1966-1976 bp + 2025 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 37093660-37096214(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCCCAGCGCG
SmilChr08G000209 Chr08 NC_080394.1:1432033-1432043promoter 内 1936-1946 bp - 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 1420574-1429978(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr08G001124 Chr08 NC_080394.1:8747618-8747628promoter 内 853-863 bp + 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 8741409-8744480(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr04G000892 Chr04 NC_080390.1:11468537-11468547promoter 内 834-844 bp + 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 11462368-11465380(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr01G001129 Chr01 NC_080387.1:22957892-22957902promoter 内 802-812 bp - 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 22961091-22964830(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGT
SmilChr07G003695 Chr07 NC_080393.1:44475605-44475615promoter 内 789-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 44478817-44481870(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr03G001592 Chr03 NC_080389.1:20179044-20179054promoter 内 742-752 bp - 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 20182303-20184509(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr06G002528 Chr06 NC_080392.1:36290377-36290387promoter 内 335-345 bp + 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 36294043-36297046(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr06G001026 Chr06 NC_080392.1:10183055-10183065promoter 内 3982-3992 bp - 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10176814-10183046(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr06G003020 Chr06 NC_080392.1:43063171-43063181promoter 内 3860-3870 bp - 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43058578-43063040(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCCCAGCGCG
SmilChr01G000882 Chr01 NC_080387.1:18765876-18765886promoter 内 3831-3841 bp - 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 18762721-18765716(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr02G003341 Chr02 NC_080388.1:54624714-54624724promoter 内 3807-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54624908-54629749(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr07G003569 Chr07 NC_080393.1:41668755-41668765promoter 内 3755-3765 bp - 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 41667665-41668519(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCT
SmilChr06G000382 Chr06 NC_080392.1:3020328-3020338promoter 内 3745-3755 bp - 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3020584-3022799(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr07G001286 Chr07 NC_080393.1:9901073-9901083promoter 内 3723-3733 bp - 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9899737-9900805(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCT
SmilChr01G000641 Chr01 NC_080387.1:14411603-14411613promoter 内 3712-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 14411218-14411324(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr07G002438 Chr07 NC_080393.1:22804312-22804322promoter 内 3712-3722 bp + 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 22804601-22804707(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr02G001634 Chr02 NC_080388.1:30293123-30293133promoter 内 3635-3645 bp + 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30293489-30297610(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr03G001106 Chr03 NC_080389.1:12748094-12748104promoter 内 3635-3645 bp + 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 12748460-12752581(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr05G002238 Chr05 NC_080391.1:24017831-24017841promoter 内 3605-3615 bp - 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 24018227-24020200(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCG
SmilChr04G002154 Chr04 NC_080390.1:34593334-34593344promoter 内 3564-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 34590655-34592907(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGT
SmilChr05G002054 Chr05 NC_080391.1:21408164-21408174promoter 内 3480-3490 bp + 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 21405442-21407653(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr06G001027 Chr06 NC_080392.1:10183055-10183065promoter 内 3463-3473 bp - 528 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10183593-10190866(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr02G001654 Chr02 NC_080388.1:30694097-30694107promoter 内 3373-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30689682-30693479(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr07G003530 Chr07 NC_080393.1:40575041-40575051promoter 内 3352-3362 bp - 639 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 40575690-40576590(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCT
SmilChr07G002136 Chr07 NC_080393.1:19509184-19509194promoter 内 3283-3293 bp + 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 19509902-19513320(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGT
SmilChr05G002434 Chr05 NC_080391.1:26825297-26825307promoter 内 3243-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26826055-26831192(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGT
SmilChr06G002527 Chr06 NC_080392.1:36290377-36290387promoter 内 3237-3247 bp + 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 36291141-36294293(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr02G004952 Chr02 NC_080388.1:71482376-71482386promoter 内 3134-3144 bp - 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 71483243-71487460(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr04G003605 Chr04 NC_080390.1:52517548-52517558promoter 内 3002-3012 bp - 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 52515660-52516559(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr04G000566 Chr04 NC_080390.1:6308126-6308136promoter 内 2707-2717 bp - 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 6309420-6313037(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr05G000439 Chr05 NC_080391.1:3318726-3318736promoter 内 2649-2659 bp - 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3320078-3323383(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr02G005141 Chr02 NC_080388.1:72827769-72827779promoter 内 2636-2646 bp - 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 72829134-72829556(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCG
SmilChr06G002208 Chr06 NC_080392.1:30758275-30758285promoter 内 2595-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30756286-30756879(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCT
SmilChr07G001285 Chr07 NC_080393.1:9901073-9901083promoter 内 2538-2548 bp - 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9897965-9899620(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCT
SmilChr03G001132 Chr03 NC_080389.1:13064916-13064926promoter 内 2504-2514 bp - 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 13066413-13071497(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCT
SmilChr08G002869 Chr08 NC_080394.1:28558594-28558604promoter 内 2224-2234 bp - 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 28560371-28568847(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT