转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 37 / 151 下载 TSV

上一页 37 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001589 Chr01 NC_080387.1:29920800-29920812promoter 内 2465-2477 bp - 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 29915355-29919276(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr02G002234 Chr02 NC_080388.1:39675905-39675917promoter 内 2354-2366 bp + 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 39677552-39681626(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr04G000420 Chr04 NC_080390.1:4459419-4459431promoter 内 2339-2351 bp - 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 4461081-4462226(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr04G000361 Chr04 NC_080390.1:3593292-3593304promoter 内 2314-2326 bp - 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 3594979-3596101(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr02G001931 Chr02 NC_080388.1:34715183-34715195promoter 内 2238-2250 bp - 1751 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 34716946-34717989(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr01G006072 Chr01 NC_080387.1:76160485-76160497promoter 内 2213-2225 bp + 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 76157690-76158709(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr01G002409 Chr01 NC_080387.1:41460250-41460262promoter 内 2142-2154 bp - 1847 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 41462109-41463061(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr02G002024 Chr02 NC_080388.1:36458753-36458765promoter 内 2136-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 36460618-36461580(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr05G001092 Chr05 NC_080391.1:9100530-9100542promoter 内 1930-1942 bp - 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 9097580-9098471(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr05G000081 Chr05 NC_080391.1:442892-442904promoter 内 1673-1685 bp + 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 439459-440576(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr03G003935 Chr03 NC_080389.1:58409707-58409719promoter 内 1469-1481 bp + 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 58412239-58412667(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCACCTACCGCC
SmilChr01G002391 Chr01 NC_080387.1:41173636-41173648promoter 内 1467-1479 bp + 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 41176170-41179598(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr02G000942 Chr02 NC_080388.1:16441746-16441758promoter 内 1398-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 16444349-16445508(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr03G000183 Chr03 NC_080389.1:1959596-1959608promoter 内 962-974 bp - 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 1946613-1956569(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr05G001896 Chr05 NC_080391.1:19257618-19257630promoter 内 915-927 bp + 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 19260704-19267673(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr03G001574 Chr03 NC_080389.1:19865745-19865757promoter 内 481-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 19869265-19870366(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr05G001091 Chr05 NC_080391.1:9100530-9100542promoter 内 360-372 bp - 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 9094467-9096901(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr01G000238 Chr01 NC_080387.1:4465839-4465851promoter 内 14-26 bp - 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 4460922-4461864(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr01G004096 Chr01 NC_080387.1:59415072-59415084promoter 内 3915-3927 bp - 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 59415158-59418135(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGTAAT
SmilChr03G002477 Chr03 NC_080389.1:39289052-39289064promoter 内 3908-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 39289145-39290449(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCAT
SmilChr01G000306 Chr01 NC_080387.1:5968492-5968504promoter 内 3880-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 5966236-5968383(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCAT
SmilChr03G001966 Chr03 NC_080389.1:28245863-28245875promoter 内 3848-3860 bp - 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28246016-28249148(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGTAAT
SmilChr04G002219 Chr04 NC_080390.1:35869366-35869378promoter 内 3554-3566 bp + 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 35868149-35868931(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr01G004095 Chr01 NC_080387.1:59415072-59415084promoter 内 3080-3092 bp - 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 59411201-59414163(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCTTC
SmilChr03G000643 Chr03 NC_080389.1:7131815-7131827promoter 内 3040-3052 bp - 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 7127426-7130866(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr04G001143 Chr04 NC_080390.1:16832876-16832888promoter 内 2959-2971 bp - 1030 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 16833918-16835681(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr02G004770 Chr02 NC_080388.1:69875309-69875321promoter 内 2876-2888 bp + 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 69876434-69879104(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACCTTT
SmilChr01G001664 Chr01 NC_080387.1:30721702-30721714promoter 内 2832-2844 bp - 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 30719296-30720545(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr03G001131 Chr03 NC_080389.1:13059291-13059303promoter 内 2723-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 13060569-13065688(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACCCCC
SmilChr01G002893 Chr01 NC_080387.1:47617447-47617459promoter 内 2674-2686 bp - 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 47615292-47616132(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAACTAG
SmilChr05G001598 Chr05 NC_080391.1:14691669-14691681promoter 内 2615-2627 bp - 1374 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 14693055-14714954(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGTTAGGTAAG
SmilChr02G001097 Chr02 NC_080388.1:19778529-19778541promoter 内 2597-2609 bp - 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 19779933-19782733(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr03G001171 Chr03 NC_080389.1:13467648-13467660promoter 内 2502-2514 bp + 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 13464853-13466161(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr04G000376 Chr04 NC_080390.1:3787207-3787219promoter 内 2437-2449 bp - 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 3788771-3790013(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr01G004301 Chr01 NC_080387.1:61185215-61185227promoter 内 2416-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 61186800-61187971(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr01G004302 Chr01 NC_080387.1:61194956-61194968promoter 内 2416-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 61196541-61197712(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr03G000287 Chr03 NC_080389.1:3261996-3262008promoter 内 2406-2418 bp + 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 3263591-3264484(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCACCTACCGCC
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SmilChr03G001494 Chr03 NC_080389.1:18229337-18229349promoter 内 2263-2275 bp + 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 18231075-18233159(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG
SmilChr03G004175 Chr03 NC_080389.1:60488120-60488132promoter 内 2193-2205 bp - 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 60489928-60492841(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGATTAGGTAAG
SmilChr03G004176 Chr03 NC_080389.1:60488120-60488132promoter 内 2187-2199 bp - 1802 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 60489934-60498314(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGATTAGGTAAG
SmilChr01G003820 Chr01 NC_080387.1:56544777-56544789promoter 内 2158-2170 bp - 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 56546620-56550205(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGAGTAGGTAAA
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SmilChr05G001426 Chr05 NC_080391.1:12968238-12968250promoter 内 1991-2003 bp + 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 12965545-12966240(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTGCA
SmilChr01G001622 Chr01 NC_080387.1:30312401-30312413promoter 内 1893-1905 bp - 2096 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 30308143-30310305(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCTTC
SmilChr03G001965 Chr03 NC_080389.1:28235981-28235993promoter 内 1887-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28238095-28239268(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGTAAT
SmilChr02G004954 Chr02 NC_080388.1:71496262-71496274promoter 内 1487-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 71491638-71493760(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCGGTAGGTGCA
SmilChr01G000181 Chr01 NC_080387.1:3133859-3133871promoter 内 1365-1377 bp - 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 3129296-3131235(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG