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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001365; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010780-RA_Salv SmilChr06G001365 SBP XP_057768799.1 MP00307 ATTGTACGGAT

可能结合的靶基因

9755 个结合位点 6893 个候选靶基因 第 39 / 138 下载 TSV

上一页 39 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003927 Chr02 NC_080388.1:61344855-61344865promoter 内 2751-2761 bp + 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 61346105-61348946(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGGA
SmilChr03G002599 Chr03 NC_080389.1:41283081-41283091promoter 内 2597-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 41284485-41287215(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACACC
SmilChr01G003665 Chr01 NC_080387.1:55071952-55071962promoter 内 2418-2428 bp + 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 55067997-55070379(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACACC
SmilChr03G000587 Chr03 NC_080389.1:6534339-6534349promoter 内 2417-2427 bp + 1574 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 6527470-6532765(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTCCGTACGAC
SmilChr02G005240 Chr02 NC_080388.1:73577247-73577257promoter 内 2314-2324 bp - 1677 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 73572201-73575570(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGTAT
SmilChr03G000233 Chr03 NC_080389.1:2765374-2765384promoter 内 2123-2133 bp - 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 2767252-2771555(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TCCCGTACAAT
SmilChr01G002493 Chr01 NC_080387.1:42681869-42681879promoter 内 2098-2108 bp + 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 42676562-42679976(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAC
SmilChr02G000385 Chr02 NC_080388.1:4797892-4797902promoter 内 2086-2096 bp + 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 4799807-4804233(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GGTGTACGGTA
SmilChr01G003845 Chr01 NC_080387.1:56773429-56773439promoter 内 2024-2034 bp - 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 56767810-56771462(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GATGTACGGGT
SmilChr01G003387 Chr01 NC_080387.1:52544012-52544022promoter 内 1718-1728 bp - 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 52546295-52547011(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAC
SmilChr02G005272 Chr02 NC_080388.1:73804829-73804839promoter 内 1691-1701 bp + 2300 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 73807139-73810785(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TATGTACGGAT
SmilChr02G003501 Chr02 NC_080388.1:56218172-56218182promoter 内 1597-1607 bp + 2394 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 56215152-56215778(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AACCGTACAGA
SmilChr02G003867 Chr02 NC_080388.1:60640584-60640594promoter 内 1571-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 60643014-60644448(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAC
SmilChr03G001973 Chr03 NC_080389.1:28455096-28455106promoter 内 1416-1426 bp + 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 28457681-28461400(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TATGTACGGCC
SmilChr01G004692 Chr01 NC_080387.1:64982520-64982530promoter 内 1222-1232 bp + 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 64979087-64979751(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACACC
SmilChr02G000161 Chr02 NC_080388.1:2113299-2113309promoter 内 1035-1045 bp + 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 2107167-2110343(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACCCGTACATC
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SmilChr02G000637 Chr02 NC_080388.1:9626348-9626358promoter 内 787-797 bp + 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 9629562-9631322(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGGA
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SmilChr02G002951 Chr02 NC_080388.1:50060082-50060092promoter 内 737-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 50052333-50056828(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTCCGTACATC
SmilChr02G005032 Chr02 NC_080388.1:72045432-72045442promoter 内 729-739 bp - 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 72038169-72042170(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AGTGTACGGTG
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SmilChr01G002852 Chr01 NC_080387.1:47108468-47108478promoter 内 615-625 bp + 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 47111854-47114130(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GGTGTACGGTA
SmilChr02G003051 Chr02 NC_080388.1:51294862-51294872promoter 内 589-599 bp + 3402 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 51298274-51299990(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGGA
SmilChr03G002369 Chr03 NC_080389.1:37312441-37312451promoter 内 472-482 bp + 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 37315970-37317665(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGGA
SmilChr03G000819 Chr03 NC_080389.1:9393275-9393285promoter 内 385-395 bp - 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 9386835-9389669(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGGA
SmilChr01G001394 Chr01 NC_080387.1:27438421-27438431promoter 内 319-329 bp + 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 27433553-27434749(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CGCCGTACAGC
SmilChr01G005897 Chr01 NC_080387.1:74889270-74889280promoter 内 312-322 bp + 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 74881056-74885591(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CACCGTACACT
SmilChr01G001074 Chr01 NC_080387.1:22163382-22163392promoter 内 266-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 22157957-22159657(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACACC
SmilChr03G000162 Chr03 NC_080389.1:1781238-1781248promoter 内 252-262 bp + 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 1784987-1786606(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGTAT
SmilChr03G000145 Chr03 NC_080389.1:1583294-1583304promoter 内 250-260 bp + 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 1587045-1589941(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGGA
SmilChr02G000727 Chr02 NC_080388.1:11817585-11817595promoter 内 227-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 11821359-11822787(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AGTGTACGGTG
SmilChr02G003404 Chr02 NC_080388.1:55215285-55215295promoter 内 3989-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 55212150-55215283(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GATGTACGGAG
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SmilChr03G002731 Chr03 NC_080389.1:43372981-43372991promoter 内 3903-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 43368980-43372893(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACATG
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SmilChr01G001837 Chr01 NC_080387.1:33314047-33314057promoter 内 3869-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 33314179-33315891(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GGTGTACGGTA
SmilChr02G003690 Chr02 NC_080388.1:58306389-58306399promoter 内 3823-3833 bp + 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 58303033-58306221(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAC
SmilChr01G004009 Chr01 NC_080387.1:58507720-58507730promoter 内 3774-3784 bp + 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 58507947-58510160(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TCTGTACGGTT
SmilChr03G003612 Chr03 NC_080389.1:54779636-54779646promoter 内 3698-3708 bp + 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 54777917-54779343(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAC
SmilChr03G003590 Chr03 NC_080389.1:54555809-54555819promoter 内 3661-3671 bp - 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 54556149-54564451(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TCCCGTACAAT
SmilChr03G003050 Chr03 NC_080389.1:47398566-47398576promoter 内 3448-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 47393487-47398023(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGTAT
SmilChr02G001843 Chr02 NC_080388.1:33644570-33644580promoter 内 3444-3454 bp + 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 33641703-33644023(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CACCGTACACT
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SmilChr03G002224 Chr03 NC_080389.1:35061512-35061522promoter 内 3380-3390 bp - 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 35062133-35067198(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTCCGTACATC
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SmilChr03G000952 Chr03 NC_080389.1:10774245-10774255promoter 内 3154-3164 bp - 837 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 10775092-10776276(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTCCGTACATC