转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 45 / 130 下载 TSV

上一页 45 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002834 Chr02 NC_080388.1:48491729-48491741promoter 内 863-875 bp - 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48485441-48488603(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAAGAATATTCA
SmilChr02G003313 Chr02 NC_080388.1:54387544-54387556promoter 内 782-794 bp + 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54390763-54392598(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGCGAATATTTT
SmilChr01G005602 Chr01 NC_080387.1:72600191-72600203promoter 内 752-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72596794-72596954(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATTTT
SmilChr01G003989 Chr01 NC_080387.1:58310943-58310955promoter 内 737-749 bp - 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 58314207-58315187(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTCCA
SmilChr02G002037 Chr02 NC_080388.1:36662734-36662746promoter 内 687-699 bp - 3302 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 36666048-36673497(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGCATATTCTTTG
SmilChr01G005446 Chr01 NC_080387.1:71553934-71553946promoter 内 635-647 bp - 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71546333-71550580(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAAGAATATTCA
SmilChr01G005563 Chr01 NC_080387.1:72430162-72430174promoter 内 548-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72433615-72435844(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAAGAATATGCG
SmilChr01G004088 Chr01 NC_080387.1:59284229-59284241promoter 内 515-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59287715-59289915(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGCGAATATTTT
SmilChr02G002025 Chr02 NC_080388.1:36479898-36479910promoter 内 497-509 bp + 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 36467687-36476406(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGCATATTCTTTG
SmilChr02G000139 Chr02 NC_080388.1:1864758-1864770promoter 内 432-444 bp + 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1868327-1870030(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAAGAATATTCA
SmilChr02G003633 Chr02 NC_080388.1:57679485-57679497promoter 内 431-443 bp - 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57672451-57675927(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAGGAATATTTG
SmilChr02G001382 Chr02 NC_080388.1:26145213-26145225promoter 内 338-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 26148876-26151562(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCGCTT
SmilChr01G003848 Chr01 NC_080387.1:56790270-56790282promoter 内 305-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56780260-56786586(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTCTT
SmilChr02G003820 Chr02 NC_080388.1:59814672-59814684promoter 内 166-178 bp + 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59818507-59821088(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATAGAATATTCA
SmilChr03G000767 Chr03 NC_080389.1:8785331-8785343promoter 内 155-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8779824-8781497(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCCTAT
SmilChr01G002820 Chr01 NC_080387.1:46756467-46756479promoter 内 95-107 bp + 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46760373-46763928(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AACAGAATATTTG
SmilChr02G002217 Chr02 NC_080388.1:39411014-39411026promoter 内 43-55 bp + 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 39414972-39421699(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATTTT
SmilChr01G004964 Chr01 NC_080387.1:67718437-67718449promoter 内 26-38 bp + 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 67709037-67714474(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCCATA
SmilChr01G004881 Chr01 NC_080387.1:66888656-66888668promoter 内 3254-3266 bp + 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 4 66889403-66893203(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGGGAATATTTT
SmilChr02G001774 Chr02 NC_080388.1:32512486-32512498promoter 内 2804-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 4 32508661-32511301(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGCATATTCTAAT
SmilChr02G003710 Chr02 NC_080388.1:58691927-58691939promoter 内 1425-1437 bp - 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 4 58688629-58689363(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTAAGAATATACT
SmilChr02G002908 Chr02 NC_080388.1:49385739-49385751promoter 内 3081-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 49386659-49392101(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCATT
SmilChr02G005509 Chr02 NC_080388.1:75202397-75202409promoter 内 2926-2938 bp - 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 75203472-75204737(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCGTCA
SmilChr02G003144 Chr02 NC_080388.1:52448623-52448635promoter 内 2669-2681 bp - 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 52444223-52447303(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGGGAATATTTT
SmilChr03G000876 Chr03 NC_080389.1:9950082-9950094promoter 内 2258-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 9944069-9948351(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CATAGAATATCCT
SmilChr01G004013 Chr01 NC_080387.1:58548015-58548027promoter 内 820-832 bp + 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 58544466-58544846(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCATT
SmilChr01G001795 Chr01 NC_080387.1:32820881-32820893promoter 内 3870-3882 bp - 119 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 32821012-32823779(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCTGTT
SmilChr02G000719 Chr02 NC_080388.1:11554905-11554917promoter 内 3780-3792 bp - 209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 11542462-11554696(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATGGAATATTTG
SmilChr01G004880 Chr01 NC_080387.1:66888656-66888668promoter 内 3721-3733 bp + 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 66884000-66888388(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCCTC
SmilChr02G002713 Chr02 NC_080388.1:46977444-46977456promoter 内 3673-3685 bp + 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 46975061-46977128(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCTTCT
SmilChr02G003721 Chr02 NC_080388.1:58834008-58834020promoter 内 3655-3667 bp - 334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 58834354-58834426(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCATT
SmilChr01G001073 Chr01 NC_080387.1:22152106-22152118promoter 内 3625-3637 bp + 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 22152482-22152823(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCAGAATATTTC
SmilChr02G001485 Chr02 NC_080388.1:27834970-27834982promoter 内 3516-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 27833629-27834497(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCGTC
SmilChr01G004565 Chr01 NC_080387.1:63723526-63723538promoter 内 3312-3324 bp - 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 63722107-63722849(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTAAGAATATACT
SmilChr02G002532 Chr02 NC_080388.1:44029411-44029423promoter 内 3212-3224 bp + 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 44027948-44028634(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCGTC
SmilChr02G000627 Chr02 NC_080388.1:9367045-9367057promoter 内 3101-3113 bp - 888 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 9367945-9370806(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCCTC
SmilChr02G003951 Chr02 NC_080388.1:61680939-61680951promoter 内 3049-3061 bp - 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 61675241-61679999(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTAAGAATATACT
SmilChr03G000877 Chr03 NC_080389.1:9950082-9950094promoter 内 2974-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 9951109-9955430(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTATG
SmilChr02G002021 Chr02 NC_080388.1:36436718-36436730promoter 内 2889-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 36437830-36440922(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGCATATTCTCCA
SmilChr01G000113 Chr01 NC_080387.1:1940572-1940584promoter 内 2824-2836 bp + 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 1941749-1946063(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTAAGAATATACT
SmilChr02G003039 Chr02 NC_080388.1:51109509-51109521promoter 内 2646-2658 bp + 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 51110864-51114251(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGGGAATATTTT
SmilChr01G005462 Chr01 NC_080387.1:71637679-71637691promoter 内 2372-2384 bp + 1617 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 71632959-71636062(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCCCT
SmilChr01G004311 Chr01 NC_080387.1:61293309-61293321promoter 内 2226-2238 bp + 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 61289693-61291546(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGCATATTCTTTA
SmilChr02G002126 Chr02 NC_080388.1:38077729-38077741promoter 内 2192-2204 bp + 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 38079538-38081399(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGGGAATATTTT
SmilChr02G003267 Chr02 NC_080388.1:53934288-53934300promoter 内 1410-1422 bp - 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 53936879-53938637(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGCATATTCTAAT
SmilChr02G003789 Chr02 NC_080388.1:59528719-59528731promoter 内 1213-1225 bp - 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 59531507-59532062(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCATATTCTTAT
SmilChr02G003787 Chr02 NC_080388.1:59528719-59528731promoter 内 1177-1189 bp - 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 59522829-59525907(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATGCT
SmilChr02G005025 Chr02 NC_080388.1:71998374-71998386promoter 内 916-928 bp + 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 72001459-72001530(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAAGAATATGCG
SmilChr01G000010 Chr01 NC_080387.1:228551-228563promoter 内 852-864 bp - 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 221140-225414(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTAAGAATATACT
SmilChr03G001658 Chr03 NC_080389.1:21537252-21537264promoter 内 652-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 21533286-21533915(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCGTC