转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 49 / 137 下载 TSV

上一页 49 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003187 Chr05 NC_080391.1:40779550-40779564promoter 内 1140-1154 bp - 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 40775798-40776703(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACGC
SmilChr01G000194 Chr01 NC_080387.1:3356656-3356670promoter 内 945-959 bp - 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 3351514-3353614(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCATCA
SmilChr05G003761 Chr05 NC_080391.1:50861408-50861422promoter 内 3830-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 50861579-50864291(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGATCCTACGTGGCA
SmilChr04G003859 Chr04 NC_080390.1:54528935-54528949promoter 内 3676-3690 bp - 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 54526297-54528624(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGACACC
SmilChr08G004881 Chr08 NC_080394.1:57905212-57905226promoter 内 2997-3011 bp - 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57906216-57906659(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CATGCTGACGTGGAC
SmilChr08G004844 Chr08 NC_080394.1:57693694-57693708promoter 内 2994-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57694701-57695144(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CATGCTGACGTGGAC
SmilChr02G001735 Chr02 NC_080388.1:31891451-31891465promoter 内 2702-2716 bp + 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 31887148-31890166(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACCACTGACGTGGCA
SmilChr04G003907 Chr04 NC_080390.1:54818391-54818405promoter 内 2636-2650 bp + 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 54819756-54824337(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGCGGC
SmilChr05G004313 Chr05 NC_080391.1:56806163-56806177promoter 内 2595-2609 bp + 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 56807569-56810137(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCATCA
SmilChr03G003222 Chr03 NC_080389.1:49891363-49891377promoter 内 2576-2590 bp - 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 49888345-49889952(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGTCTAT
SmilChr01G002328 Chr01 NC_080387.1:40439127-40439141promoter 内 2372-2386 bp - 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 40440756-40444375(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCGTGACACGTGGCA
SmilChr03G001252 Chr03 NC_080389.1:14441935-14441949promoter 内 1346-1360 bp - 2641 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 14444590-14449243(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAGTGTGACGTGGCT
SmilChr08G002226 Chr08 NC_080394.1:20315650-20315664promoter 内 1254-1268 bp - 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 20309153-20312917(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACGC
SmilChr08G004882 Chr08 NC_080394.1:57905212-57905226promoter 内 1096-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57908117-57910710(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CATGCTGACGTGGAC
SmilChr03G003221 Chr03 NC_080389.1:49891363-49891377promoter 内 962-976 bp - 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 49887374-49888338(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGTCTAT
SmilChr05G004312 Chr05 NC_080391.1:56806163-56806177promoter 内 884-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 56800603-56803060(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGATGACACGTGGCA
SmilChr08G004845 Chr08 NC_080394.1:57693694-57693708promoter 内 221-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57697474-57700463(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CATGCTGACGTGGAC
SmilChr02G002772 Chr02 NC_080388.1:47793643-47793657promoter 内 155-169 bp + 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 47788873-47789811(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGATGACACGTGGCA
SmilChr02G005462 Chr02 NC_080388.1:74930030-74930044promoter 内 104-118 bp + 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 74921594-74926147(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTGTCTGACGTGTCA
SmilChr01G001167 Chr01 NC_080387.1:23704844-23704858promoter 内 3948-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 23704897-23715789(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTAGGTGACGTGGAC
SmilChr01G001209 Chr01 NC_080387.1:24312123-24312137promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24312181-24321725(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTAGGTGACGTGGAC
SmilChr02G000458 Chr02 NC_080388.1:6121335-6121349promoter 内 3913-3927 bp - 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6118977-6121261(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCACAGAT
SmilChr08G000799 Chr08 NC_080394.1:5864513-5864527promoter 内 3912-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5864602-5867455(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATAGACGACGTGGAA
SmilChr01G006191 Chr01 NC_080387.1:77523653-77523667promoter 内 3818-3832 bp - 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 77517612-77523484(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr01G006190 Chr01 NC_080387.1:77517566-77517580promoter 内 3772-3786 bp - 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 77513390-77517351(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr07G003537 Chr07 NC_080393.1:40884446-40884460promoter 内 3741-3755 bp - 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40880485-40884200(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr01G000060 Chr01 NC_080387.1:959593-959607promoter 内 3701-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 957173-959307(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAGATAA
SmilChr01G002438 Chr01 NC_080387.1:41967607-41967621promoter 内 3690-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41963510-41967310(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACCACTGACGTGGCA
SmilChr02G000637 Chr02 NC_080388.1:9629179-9629193promoter 内 3618-3632 bp + 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9629562-9631322(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr02G003430 Chr02 NC_080388.1:55523818-55523832promoter 内 3586-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55524233-55529275(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAATCCTACGTGGCA
SmilChr02G002052 Chr02 NC_080388.1:36932487-36932501promoter 内 3549-3563 bp + 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36932939-36935810(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr02G002170 Chr02 NC_080388.1:38912478-38912492promoter 内 3498-3512 bp + 489 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38912981-38915528(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCGGACGC
SmilChr03G001554 Chr03 NC_080389.1:19583678-19583692promoter 内 3484-3498 bp + 503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 19584195-19587310(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr08G001518 Chr08 NC_080394.1:12335165-12335179promoter 内 3413-3427 bp + 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12331922-12334591(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCGGCGACGTGGCT
SmilChr06G002184 Chr06 NC_080392.1:30189367-30189381promoter 内 3386-3400 bp + 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30189982-30191257(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCACGCCG
SmilChr01G002206 Chr01 NC_080387.1:38388895-38388909promoter 内 3364-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38389532-38392060(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr02G000835 Chr02 NC_080388.1:14110388-14110402promoter 内 3259-3273 bp + 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14111130-14114061(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr08G001170 Chr08 NC_080394.1:9365685-9365699promoter 内 3215-3229 bp - 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9366471-9367551(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATGCGCGACGTGGCA
SmilChr02G002137 Chr02 NC_080388.1:38472434-38472448promoter 内 3189-3203 bp + 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38473246-38475937(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr06G002902 Chr06 NC_080392.1:41835426-41835440promoter 内 3173-3187 bp + 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41831685-41834612(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTTCTCACGTGGCT
SmilChr03G001886 Chr03 NC_080389.1:26265513-26265527promoter 内 3147-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 26266367-26267052(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATAGACGACGTGGAA
SmilChr07G003093 Chr07 NC_080393.1:32706392-32706406promoter 内 3117-3131 bp + 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32707276-32709301(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr06G000726 Chr06 NC_080392.1:6688447-6688461promoter 内 3112-3126 bp - 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6689336-6691770(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGGCGCGACGTGGCA
SmilChr07G004304 Chr07 NC_080393.1:55628701-55628715promoter 内 3054-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55629648-55632562(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr07G003444 Chr07 NC_080393.1:38230205-38230219promoter 内 2884-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38225197-38229102(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTACAGACGTGGCA
SmilChr01G003298 Chr01 NC_080387.1:51665575-51665589promoter 内 2823-2837 bp - 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51666753-51674549(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCGGCGACGTGGCT
SmilChr01G005657 Chr01 NC_080387.1:72915953-72915967promoter 内 2597-2611 bp + 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 72917357-72919095(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGACACGTCAGCCTC
SmilChr07G003615 Chr07 NC_080393.1:42525597-42525611promoter 内 2512-2526 bp - 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 42527086-42528188(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTGATTACGTGGCG
SmilChr04G000765 Chr04 NC_080390.1:9319541-9319555promoter 内 2488-2502 bp + 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9315101-9318042(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGGTGACACGTGGCA
SmilChr07G002617 Chr07 NC_080393.1:25265213-25265227promoter 内 2318-2332 bp + 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25266896-25270760(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCGGAGCC