转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 64 / 143 下载 TSV

上一页 64 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003245 Chr05 NC_080391.1:41780085-41780096promoter 内 3637-3648 bp - 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41778822-41779732(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAG
SmilChr01G002372 Chr01 NC_080387.1:40945476-40945487promoter 内 3542-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 40945935-40950772(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTG
SmilChr02G002483 Chr02 NC_080388.1:43216179-43216190promoter 内 3337-3348 bp - 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 43216843-43218769(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCGC
SmilChr05G003628 Chr05 NC_080391.1:48574228-48574239promoter 内 3282-3293 bp - 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 48570019-48573520(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTATT
SmilChr05G000430 Chr05 NC_080391.1:3225363-3225374promoter 内 3127-3138 bp - 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3226237-3230665(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAT
SmilChr08G000124 Chr08 NC_080394.1:778341-778352promoter 内 3043-3054 bp - 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 779299-781278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGG
SmilChr08G002549 Chr08 NC_080394.1:24783237-24783248promoter 内 3033-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24784205-24788507(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAA
SmilChr05G000443 Chr05 NC_080391.1:3363839-3363850promoter 内 2840-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3359226-3362689(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr01G000660 Chr01 NC_080387.1:14725438-14725449promoter 内 2758-2769 bp - 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 14726681-14734421(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAGT
SmilChr08G002794 Chr08 NC_080394.1:27658802-27658813promoter 内 2682-2693 bp - 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27648616-27657494(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGC
SmilChr07G003421 Chr07 NC_080393.1:37376884-37376895promoter 内 2612-2623 bp + 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 37372334-37375506(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAACTGTCAA
SmilChr01G005477 Chr01 NC_080387.1:71767012-71767023promoter 内 2547-2558 bp + 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71759353-71765569(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAT
SmilChr08G000031 Chr08 NC_080394.1:193727-193738promoter 内 2504-2515 bp + 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 195224-198523(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTAGG
SmilChr01G002061 Chr01 NC_080387.1:36451785-36451796promoter 内 2463-2474 bp + 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36447473-36450258(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAT
SmilChr04G003872 Chr04 NC_080390.1:54619279-54619290promoter 内 2374-2385 bp - 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 54616007-54617663(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAA
SmilChr05G001192 Chr05 NC_080391.1:9987910-9987921promoter 内 2372-2383 bp - 1618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9989539-9992850(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAT
SmilChr05G004347 Chr05 NC_080391.1:57097887-57097898promoter 内 2366-2377 bp + 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 57093444-57096263(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCGA
SmilChr01G002635 Chr01 NC_080387.1:44633538-44633549promoter 内 2312-2323 bp - 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 44635227-44639956(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAG
SmilChr04G004037 Chr04 NC_080390.1:55609987-55609998promoter 内 2258-2269 bp + 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 55605554-55608255(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCAC
SmilChr05G002459 Chr05 NC_080391.1:27126299-27126310promoter 内 2202-2213 bp + 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27121433-27124511(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTG
SmilChr04G002101 Chr04 NC_080390.1:33901873-33901884promoter 内 2162-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 33895820-33900045(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAT
SmilChr05G004203 Chr05 NC_080391.1:55910222-55910233promoter 内 2156-2167 bp + 1834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 55904834-55908388(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAT
SmilChr03G002514 Chr03 NC_080389.1:40009654-40009665promoter 内 2154-2165 bp - 1836 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 40011501-40012238(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGG
SmilChr08G000481 Chr08 NC_080394.1:3452610-3452621promoter 内 2124-2135 bp - 1866 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3445178-3450744(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCAA
SmilChr06G001136 Chr06 NC_080392.1:11393224-11393235promoter 内 2067-2078 bp - 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 11395158-11395228(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAT
SmilChr06G001134 Chr06 NC_080392.1:11393224-11393235promoter 内 1810-1821 bp - 2180 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 11387656-11391044(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr08G001076 Chr08 NC_080394.1:8287297-8287308promoter 内 1754-1765 bp + 2236 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8279572-8285061(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAT
SmilChr06G000710 Chr06 NC_080392.1:6394645-6394656promoter 内 1709-1720 bp - 2281 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 6396937-6401290(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAT
SmilChr06G000266 Chr06 NC_080392.1:1809969-1809980promoter 内 1703-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 1799954-1807682(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATG
SmilChr08G003674 Chr08 NC_080394.1:40858499-40858510promoter 内 1702-1713 bp + 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 40854089-40856211(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAGT
SmilChr07G003567 Chr07 NC_080393.1:41668422-41668433promoter 内 1684-1695 bp - 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41664136-41666116(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAG
SmilChr03G004579 Chr03 NC_080389.1:63666577-63666588promoter 内 1660-1671 bp + 2330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 63668918-63671346(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr08G000033 Chr08 NC_080394.1:234436-234447promoter 内 1659-1670 bp + 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 236778-240106(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTAGG
SmilChr04G001686 Chr04 NC_080390.1:27885374-27885385promoter 内 1613-1624 bp + 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27887762-27890697(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr03G002594 Chr03 NC_080389.1:41245548-41245559promoter 内 1603-1614 bp - 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41242315-41243161(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr08G001937 Chr08 NC_080394.1:16998282-16998293promoter 内 1503-1514 bp + 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 17000780-17001724(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGC
SmilChr05G004142 Chr05 NC_080391.1:55371536-55371547promoter 内 1456-1467 bp + 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 55374081-55377896(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTA
SmilChr03G004243 Chr03 NC_080389.1:60948434-60948445promoter 内 1354-1365 bp - 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 60942628-60945798(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr08G002153 Chr08 NC_080394.1:19413943-19413954promoter 内 1352-1363 bp + 2638 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 19416592-19420788(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAA
SmilChr06G003254 Chr06 NC_080392.1:45213352-45213363promoter 内 1267-1278 bp + 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 45201247-45210629(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCGA
SmilChr07G000373 Chr07 NC_080393.1:2545457-2545468promoter 内 1044-1055 bp + 2946 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 2535674-2542511(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTG
SmilChr05G001042 Chr05 NC_080391.1:8528874-8528885promoter 内 938-949 bp - 3052 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8531937-8532604(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAC
SmilChr03G003051 Chr03 NC_080389.1:47414644-47414655promoter 内 887-898 bp - 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 47410249-47411541(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAA
SmilChr07G001397 Chr07 NC_080393.1:10849167-10849178promoter 内 830-841 bp - 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 10852338-10853114(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCTC
SmilChr07G001030 Chr07 NC_080393.1:7524723-7524734promoter 内 752-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 7520520-7521485(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATG
SmilChr06G002502 Chr06 NC_080392.1:35913356-35913367promoter 内 725-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 35907881-35910091(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAT
SmilChr05G000349 Chr05 NC_080391.1:2623226-2623237promoter 内 723-734 bp + 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 2618851-2619959(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCGA
SmilChr08G001136 Chr08 NC_080394.1:8920980-8920991promoter 内 681-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8924300-8924828(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr05G000350 Chr05 NC_080391.1:2623226-2623237promoter 内 655-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 2626572-2628586(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATG
SmilChr03G003202 Chr03 NC_080389.1:49578701-49578712promoter 内 600-611 bp - 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 49573389-49575311(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCAA