转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001111; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023725-RA_Salv SmilChr06G001111 MYB XP_057768512.1 MP00388 AAAGTTAGGTATAA

可能结合的靶基因

9774 个结合位点 6870 个候选靶基因 第 68 / 138 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003641 Chr02 NC_080388.1:57771833-57771846promoter 内 784-797 bp + 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57764398-57768629(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TACAACCTAACCTC
SmilChr03G000731 Chr03 NC_080389.1:8220853-8220866promoter 内 219-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 8215976-8217084(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAAATTAGGTAAAC
SmilChr02G000910 Chr02 NC_080388.1:15748542-15748555promoter 内 155-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 15743999-15744709(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAGGACCTAACAAC
SmilChr03G000412 Chr03 NC_080389.1:4447017-4447030promoter 内 53-66 bp + 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 4450965-4453127(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GGTGTTAGGTCCTG
SmilChr02G004256 Chr02 NC_080388.1:64756633-64756646promoter 内 34-47 bp + 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 64760600-64760672(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACAGTTAGGTCTTG
SmilChr01G003884 Chr01 NC_080387.1:57164046-57164059promoter 内 3836-3849 bp + 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 57164211-57166340(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGGGTTAGGTCATG
SmilChr02G002062 Chr02 NC_080388.1:37160744-37160757promoter 内 3713-3726 bp + 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37149450-37160469(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTATACCTAATCGT
SmilChr03G000892 Chr03 NC_080389.1:10198270-10198283promoter 内 3690-3703 bp + 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10181406-10197972(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACTTACCTAATCAT
SmilChr01G002792 Chr01 NC_080387.1:46434832-46434845promoter 内 3677-3690 bp + 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 46435156-46437299(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTTATTAGGTATAA
SmilChr01G000018 Chr01 NC_080387.1:373991-374004promoter 内 3405-3418 bp + 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 371113-373408(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTATACCTACTCAA
SmilChr03G000179 Chr03 NC_080389.1:1922829-1922842promoter 内 3390-3403 bp - 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1923440-2552598(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACTTACCTAATCAT
SmilChr03G000318 Chr03 NC_080389.1:3638066-3638079promoter 内 3369-3382 bp + 619 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3638698-3641891(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr03G000851 Chr03 NC_080389.1:9707804-9707817promoter 内 3367-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9708438-9711293(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr02G000994 Chr02 NC_080388.1:17457951-17457964promoter 内 3347-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 17458605-17462223(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAATACCTAACAAA
SmilChr01G004532 Chr01 NC_080387.1:63495882-63495895promoter 内 3330-3343 bp - 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63493513-63495224(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGAGTTAGGTTATA
SmilChr03G002429 Chr03 NC_080389.1:38578234-38578247promoter 内 3319-3332 bp + 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 38578916-38581857(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr01G000108 Chr01 NC_080387.1:1851960-1851973promoter 内 3296-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1852665-1854729(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTATACCTACTCAA
SmilChr01G000366 Chr01 NC_080387.1:7572184-7572197promoter 内 3277-3290 bp + 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7572908-7575735(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr01G000158 Chr01 NC_080387.1:2675675-2675688promoter 内 3214-3227 bp - 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2676462-2677486(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GATCACCTAACTTA
SmilChr03G000184 Chr03 NC_080389.1:1958615-1958628promoter 内 3190-3203 bp + 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1959426-1962875(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACAGGTAGGTATTT
SmilChr03G000194 Chr03 NC_080389.1:2173230-2173243promoter 内 3154-3167 bp - 834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2169373-2172396(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr03G000128 Chr03 NC_080389.1:1409303-1409316promoter 内 3141-3154 bp - 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1405567-1408456(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr01G001761 Chr01 NC_080387.1:32341063-32341076promoter 内 3119-3132 bp - 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 32341945-32346332(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGAAACCTAACTGA
SmilChr02G004498 Chr02 NC_080388.1:67486733-67486746promoter 内 3091-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 67482937-67485836(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr03G001165 Chr03 NC_080389.1:13421889-13421902promoter 内 3070-3083 bp + 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 13422820-13425557(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr02G001079 Chr02 NC_080388.1:19340224-19340237promoter 内 3060-3073 bp - 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 19336612-19339296(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr03G001167 Chr03 NC_080389.1:13435691-13435704promoter 内 3056-3069 bp + 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 13436636-13439364(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr01G004240 Chr01 NC_080387.1:60719846-60719859promoter 内 3045-3058 bp - 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 60715424-60718903(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACAGTTAGGCAAGC
SmilChr03G000672 Chr03 NC_080389.1:7524776-7524789promoter 内 3045-3058 bp - 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7520940-7523833(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr01G005491 Chr01 NC_080387.1:71834879-71834892promoter 内 3029-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71833093-71833920(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGAAACCTAACTAG
SmilChr01G003938 Chr01 NC_080387.1:57709603-57709616promoter 内 3027-3040 bp + 961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 57706030-57708642(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CATTACCTAACAAG
SmilChr03G000312 Chr03 NC_080389.1:3554350-3554363promoter 内 3010-3023 bp + 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3555341-3558022(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGTTAGGTCCTG
SmilChr01G001053 Chr01 NC_080387.1:21873123-21873136promoter 内 2960-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21874164-21877195(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGACACCTAACCAC
SmilChr03G002547 Chr03 NC_080389.1:40628790-40628803promoter 内 2941-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40629850-40631590(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGTTACCTAATTTC
SmilChr01G000194 Chr01 NC_080387.1:3354665-3354678promoter 内 2937-2950 bp - 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3351514-3353614(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAATTAGGTACTT
SmilChr01G004433 Chr01 NC_080387.1:62424340-62424353promoter 内 2934-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 62425407-62433090(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTTGTTAGGTATTT
SmilChr01G005084 Chr01 NC_080387.1:68719867-68719880promoter 内 2868-2881 bp - 1120 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 68721000-68722304(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGCCACCTAACAAA
SmilChr02G003598 Chr02 NC_080388.1:57170246-57170259promoter 内 2800-2813 bp + 1188 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 57171447-57173363(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAATTAGGTACTT
SmilChr02G003537 Chr02 NC_080388.1:56516730-56516743promoter 内 2797-2810 bp + 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 56517934-56519916(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAATTAGGTACTT
SmilChr02G004289 Chr02 NC_080388.1:65216973-65216986promoter 内 2760-2773 bp + 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 65215359-65215745(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAACACCTAACTCC
SmilChr03G001691 Chr03 NC_080389.1:22427686-22427699promoter 内 2754-2767 bp + 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 22428933-22429433(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCGGTTAGGTTGAT
SmilChr01G000270 Chr01 NC_080387.1:5328448-5328461promoter 内 2728-2741 bp - 1260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5329721-5330807(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGGGACCTAACACA
SmilChr03G001878 Chr03 NC_080389.1:26067077-26067090promoter 内 2695-2708 bp - 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 26068383-26069999(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTCAGCCTAACTAT
SmilChr02G001688 Chr02 NC_080388.1:31113492-31113505promoter 内 2637-2650 bp + 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 31111086-31112141(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATATACCTAATCCT
SmilChr02G000213 Chr02 NC_080388.1:2765287-2765300promoter 内 2469-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2766819-2771340(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTAGTTAGGTCATA
SmilChr01G004949 Chr01 NC_080387.1:67576339-67576352promoter 内 2412-2425 bp - 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 67577928-67581118(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCAACCTCA
SmilChr03G002358 Chr03 NC_080389.1:37189641-37189654promoter 内 2383-2396 bp - 1605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37186934-37188036(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATAAGTAGGTATAT
SmilChr02G003440 Chr02 NC_080388.1:55680077-55680090promoter 内 2304-2317 bp + 1684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55674626-55678393(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAGGACCTAACAAC
SmilChr02G002937 Chr02 NC_080388.1:49877663-49877676promoter 内 2274-2287 bp - 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49879390-49884337(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATGAGCCTAACTTA
SmilChr02G001907 Chr02 NC_080388.1:34366022-34366035promoter 内 2253-2266 bp - 1735 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 34362319-34364287(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTTGTTAGGTCTGT