转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 68 / 149 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003023 Chr07 NC_080393.1:31271524-31271534promoter 内 2753-2763 bp - 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 31272772-31277140(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr05G000243 Chr05 NC_080391.1:1852367-1852377promoter 内 2720-2730 bp + 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 1853648-1854834(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr06G002083 Chr06 NC_080392.1:27478167-27478177promoter 内 2711-2721 bp - 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 27475703-27476887(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr03G003757 Chr03 NC_080389.1:56686177-56686187promoter 内 2593-2603 bp + 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56682950-56684779(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAT
SmilChr05G001067 Chr05 NC_080391.1:8805333-8805343promoter 内 2492-2502 bp - 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 8806842-8819661(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr02G004970 Chr02 NC_080388.1:71598443-71598453promoter 内 2482-2492 bp + 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71595479-71596934(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr01G004464 Chr01 NC_080387.1:62746945-62746955promoter 内 2476-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 62743094-62745430(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr03G000424 Chr03 NC_080389.1:4604790-4604800promoter 内 2473-2483 bp + 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4606318-4613616(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr06G002084 Chr06 NC_080392.1:27478167-27478177promoter 内 2451-2461 bp - 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 27479717-27479824(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr01G002467 Chr01 NC_080387.1:42364569-42364579promoter 内 2443-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42366127-42368224(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr05G000027 Chr05 NC_080391.1:136101-136111promoter 内 2401-2411 bp + 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 137701-141067(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr07G002904 Chr07 NC_080393.1:29459840-29459850promoter 内 2361-2371 bp + 1630 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 29461480-29466946(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr03G003770 Chr03 NC_080389.1:56845907-56845917promoter 内 2339-2349 bp + 1652 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56836499-56844255(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAC
SmilChr03G003959 Chr03 NC_080389.1:58635316-58635326promoter 内 2271-2281 bp - 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 58637046-58638175(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAT
SmilChr07G002083 Chr07 NC_080393.1:18946403-18946413promoter 内 2220-2230 bp + 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 18948184-18948253(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr05G000229 Chr05 NC_080391.1:1787272-1787282promoter 内 2210-2220 bp + 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 1783269-1785491(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr03G001908 Chr03 NC_080389.1:26699877-26699887promoter 内 2171-2181 bp + 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 26701707-26704144(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr04G000475 Chr04 NC_080390.1:5069890-5069900promoter 内 2162-2172 bp + 1829 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5071729-5072562(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCA
SmilChr01G000488 Chr01 NC_080387.1:9953898-9953908promoter 内 2084-2094 bp - 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9950355-9951991(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G001834 Chr01 NC_080387.1:33279261-33279271promoter 内 2084-2094 bp + 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 33281178-33283356(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr05G003954 Chr05 NC_080391.1:53260624-53260634promoter 内 2083-2093 bp + 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 53256496-53258716(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr03G000423 Chr03 NC_080389.1:4604790-4604800promoter 内 2067-2077 bp + 1924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4600185-4602866(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr01G005150 Chr01 NC_080387.1:69274558-69274568promoter 内 2049-2059 bp - 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 69266267-69272616(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr06G003120 Chr06 NC_080392.1:44027808-44027818promoter 内 2049-2059 bp + 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44019043-44025866(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr05G004226 Chr05 NC_080391.1:56103822-56103832promoter 内 1998-2008 bp + 1993 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56099672-56101829(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr05G003286 Chr05 NC_080391.1:42951986-42951996promoter 内 1963-1973 bp + 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42954024-42958204(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr05G003603 Chr05 NC_080391.1:48110354-48110364promoter 内 1924-1934 bp - 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48107091-48108287(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr07G000163 Chr07 NC_080393.1:966828-966838promoter 内 1904-1914 bp + 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 968925-970815(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr01G006185 Chr01 NC_080387.1:77363814-77363824promoter 内 1881-1891 bp + 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 77359226-77361704(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr03G003522 Chr03 NC_080389.1:53829566-53829576promoter 内 1831-1841 bp - 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 53831736-53836179(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAC
SmilChr07G002456 Chr07 NC_080393.1:23069640-23069650promoter 内 1819-1829 bp - 2172 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 23065884-23067468(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr04G002816 Chr04 NC_080390.1:44201586-44201596promoter 内 1814-1824 bp - 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44203773-44205946(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr01G000899 Chr01 NC_080387.1:19057924-19057934promoter 内 1767-1777 bp - 2224 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 19060158-19062455(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr02G001980 Chr02 NC_080388.1:35749077-35749087promoter 内 1756-1766 bp - 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 35738340-35746842(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr06G001829 Chr06 NC_080392.1:21463282-21463292promoter 内 1731-1741 bp + 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21465552-21467515(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr02G001527 Chr02 NC_080388.1:28398621-28398631promoter 内 1723-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 28400899-28404000(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr02G000485 Chr02 NC_080388.1:6619127-6619137promoter 内 1686-1696 bp - 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6613893-6616822(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G003193 Chr01 NC_080387.1:50681833-50681843promoter 内 1652-1662 bp + 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 50684182-50687485(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr05G002666 Chr05 NC_080391.1:30160234-30160244promoter 内 1579-1589 bp + 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30154774-30157822(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr02G000047 Chr02 NC_080388.1:635128-635138promoter 内 1535-1545 bp + 2456 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 637594-649458(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCA
SmilChr06G001838 Chr06 NC_080392.1:21592643-21592653promoter 内 1505-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21587931-21590157(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr04G003686 Chr04 NC_080390.1:53275123-53275133promoter 内 1493-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 53271866-53272625(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr05G002647 Chr05 NC_080391.1:29902102-29902112promoter 内 1436-1446 bp + 2555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 29904667-29906354(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCC
SmilChr06G000606 Chr06 NC_080392.1:5234478-5234488promoter 内 1420-1430 bp - 2571 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5237059-5239973(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGC
SmilChr06G002085 Chr06 NC_080392.1:27478167-27478177promoter 内 1405-1415 bp - 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 27480763-27481551(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr02G000630 Chr02 NC_080388.1:9513264-9513274promoter 内 1357-1367 bp - 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9504658-9510630(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr01G004316 Chr01 NC_080387.1:61351505-61351515promoter 内 1330-1340 bp - 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 61331580-61348844(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCA
SmilChr01G000241 Chr01 NC_080387.1:4495184-4495194promoter 内 1289-1299 bp + 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4497896-4500637(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr01G001623 Chr01 NC_080387.1:30311292-30311302promoter 内 1267-1277 bp - 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30314026-30315456(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr01G002692 Chr01 NC_080387.1:45166158-45166168promoter 内 1193-1203 bp - 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 45162758-45163360(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG