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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 95 / 133 下载 TSV

上一页 95 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003936 Chr02 NC_080388.1:61437989-61438003promoter 内 2000-2014 bp - 1987 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 61434867-61436002(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGTGGATAATGAGGC
SmilChr01G002201 Chr01 NC_080387.1:38289750-38289764promoter 内 1859-1873 bp - 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 38291892-38292689(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTTTGTTATCCAAT
SmilChr01G003359 Chr01 NC_080387.1:52335693-52335707promoter 内 1725-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 52325564-52333431(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAGGGATAAGTATCA
SmilChr01G002917 Chr01 NC_080387.1:47889348-47889362promoter 内 1636-1650 bp - 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 47891713-47901820(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTGTCATTATCCATA
SmilChr03G000386 Chr03 NC_080389.1:4289085-4289099promoter 内 1621-1635 bp - 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 4291465-4292439(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGGACTTATCCATT
SmilChr03G000536 Chr03 NC_080389.1:5777509-5777523promoter 内 1425-1439 bp + 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 5780085-5827863(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAATATATT
SmilChr03G000956 Chr03 NC_080389.1:10806165-10806179promoter 内 979-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 10809187-10810392(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGGACTTATCCATT
SmilChr03G000351 Chr03 NC_080389.1:3932127-3932141promoter 内 821-835 bp + 3166 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 3935307-3936363(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGTGGGA
SmilChr03G000387 Chr03 NC_080389.1:4289085-4289099promoter 内 760-774 bp - 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 4292326-4293199(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGGACTTATCCATT
SmilChr01G000025 Chr01 NC_080387.1:461633-461647promoter 内 474-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 452475-458120(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAATGGGAT
SmilChr01G004074 Chr01 NC_080387.1:59181671-59181685promoter 内 338-352 bp + 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 59176511-59178022(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTTTCTTATCCCAC
SmilChr01G005660 Chr01 NC_080387.1:72937598-72937612promoter 内 168-182 bp + 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 72941431-72945167(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAAGCTAC
SmilChr03G000957 Chr03 NC_080389.1:10806165-10806179promoter 内 59-73 bp - 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 10810107-10812420(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGGACTTATCCATT
SmilChr02G000209 Chr02 NC_080388.1:2745776-2745790promoter 内 3923-3937 bp - 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2743985-2745712(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCTGGATAACACTTA
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SmilChr02G002820 Chr02 NC_080388.1:48291908-48291922promoter 内 3818-3832 bp - 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48291014-48291739(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAATATGAA
SmilChr02G001137 Chr02 NC_080388.1:20501430-20501444promoter 内 3790-3804 bp - 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20501641-20503792(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CGACCCTTATCTAAG
SmilChr02G000210 Chr02 NC_080388.1:2745776-2745790promoter 内 3746-3760 bp - 241 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2746031-2749058(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAGTGTTATCCAGA
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SmilChr02G003967 Chr02 NC_080388.1:61803590-61803604promoter 内 3589-3603 bp + 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61804002-61804074(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAACTTTAA
SmilChr01G003313 Chr01 NC_080387.1:51846654-51846668promoter 内 3527-3541 bp + 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 51847128-51853630(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAATGAGTT
SmilChr02G002633 Chr02 NC_080388.1:45702768-45702782promoter 内 3521-3535 bp - 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 45702231-45702302(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAATGACAA
SmilChr02G002972 Chr02 NC_080388.1:50264784-50264798promoter 内 3479-3493 bp - 508 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 50265306-50267624(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATATATTATCCAAA
SmilChr01G003597 Chr01 NC_080387.1:54520344-54520358promoter 内 3432-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54520913-54523342(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGGATAAGTGTTC
SmilChr02G000049 Chr02 NC_080388.1:653183-653197promoter 内 3420-3434 bp + 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 653764-653844(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGCTGATAAGGTGGT
SmilChr02G000174 Chr02 NC_080388.1:2215418-2215432promoter 内 3420-3434 bp - 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2214771-2214851(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGCTGATAAGGTGGT
SmilChr01G001695 Chr01 NC_080387.1:31203353-31203367promoter 内 3369-3383 bp + 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31201668-31202735(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATCCACTTATCCAAT
SmilChr02G003138 Chr02 NC_080388.1:52384358-52384372promoter 内 3281-3295 bp + 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 52385078-52385840(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GATGGATAAGACCAT
SmilChr02G003372 Chr02 NC_080388.1:54851081-54851095promoter 内 3246-3260 bp - 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54851836-54853897(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTATTATTATCCATT
SmilChr02G002245 Chr02 NC_080388.1:39867870-39867884promoter 内 3173-3187 bp + 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39864346-39867056(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCAGCCTTATCTCTG
SmilChr01G001787 Chr01 NC_080387.1:32745331-32745345promoter 内 3084-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 32743124-32744428(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTACCCTTATCTCAG
SmilChr01G002491 Chr01 NC_080387.1:42628274-42628288promoter 内 3064-3078 bp - 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42620759-42627351(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAATAATAA
SmilChr01G005853 Chr01 NC_080387.1:74481935-74481949promoter 内 2995-3009 bp + 992 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74482941-74485901(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAATGAATT
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SmilChr02G005438 Chr02 NC_080388.1:74785864-74785878promoter 内 2933-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74783142-74784810(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAACATACA
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SmilChr03G001723 Chr03 NC_080389.1:23135687-23135701promoter 内 2869-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 23133489-23134569(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCAACATTATCCATG
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SmilChr02G002824 Chr02 NC_080388.1:48354328-48354342promoter 内 2664-2678 bp + 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48351833-48353005(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACCCCGTTATCCATT
SmilChr01G001883 Chr01 NC_080387.1:33866369-33866383promoter 内 2642-2656 bp - 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 33867728-33868929(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GAAGCCTTATCTTTC
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SmilChr03G000098 Chr03 NC_080389.1:1097290-1097304promoter 内 2457-2471 bp - 1530 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1084505-1095760(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGGGGATAAGCCCGA
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SmilChr02G003349 Chr02 NC_080388.1:54685711-54685725promoter 内 2159-2173 bp - 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54687553-54688263(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATTTTTATCCACA