转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 106 / 149 下载 TSV

上一页 106 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001146 Chr02 NC_080388.1:20855060-20855070promoter 内 1037-1047 bp + 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20849516-20852106(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr01G002257 Chr01 NC_080387.1:39333906-39333916promoter 内 1017-1027 bp - 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39327723-39330932(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr01G005826 Chr01 NC_080387.1:74259759-74259769promoter 内 966-976 bp + 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74262794-74267868(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr04G004011 Chr04 NC_080390.1:55416935-55416945promoter 内 881-891 bp - 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55420055-55421017(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr04G000964 Chr04 NC_080390.1:12839508-12839518promoter 内 738-748 bp - 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12835629-12836255(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr01G001509 Chr01 NC_080387.1:28922404-28922414promoter 内 622-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28925783-28929363(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr03G004269 Chr03 NC_080389.1:61173931-61173941promoter 内 517-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 61165887-61170457(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr02G005181 Chr02 NC_080388.1:73110693-73110703promoter 内 484-494 bp + 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 73097487-73107186(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTT
SmilChr02G003435 Chr02 NC_080388.1:55583874-55583884promoter 内 479-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55587396-55589165(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr05G001521 Chr05 NC_080391.1:13936767-13936777promoter 内 467-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 13931869-13933243(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr05G001832 Chr05 NC_080391.1:18361390-18361400promoter 内 463-473 bp + 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 18364928-18367167(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCG
SmilChr02G002132 Chr02 NC_080388.1:38286188-38286198promoter 内 393-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38275997-38282590(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr02G004832 Chr02 NC_080388.1:70438808-70438818promoter 内 380-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 70431909-70435197(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr06G001241 Chr06 NC_080392.1:12793149-12793159promoter 内 328-338 bp + 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12796822-12805597(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr07G000455 Chr07 NC_080393.1:3217566-3217576promoter 内 289-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3221278-3225546(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr04G003547 Chr04 NC_080390.1:51814999-51815009promoter 内 284-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 51818716-51820269(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr06G002221 Chr06 NC_080392.1:31180964-31180974promoter 内 238-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 31184727-31188274(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCG
SmilChr02G004975 Chr02 NC_080388.1:71642096-71642106promoter 内 224-234 bp - 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71632567-71638329(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr07G002049 Chr07 NC_080393.1:18620110-18620120promoter 内 179-189 bp + 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 18615423-18616298(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTT
SmilChr03G000696 Chr03 NC_080389.1:7773140-7773150promoter 内 157-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7763238-7769306(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr05G003862 Chr05 NC_080391.1:52176542-52176552promoter 内 126-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52180417-52182652(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr01G001253 Chr01 NC_080387.1:25168125-25168135promoter 内 22-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 25172104-25174860(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr04G000662 Chr04 NC_080390.1:7486366-7486376promoter 内 1492-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 7481036-7483867(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr04G000661 Chr04 NC_080390.1:7476871-7476881promoter 内 1490-1500 bp - 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 7471540-7474370(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr02G002899 Chr02 NC_080388.1:49257185-49257195promoter 内 1489-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 49259697-49261085(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr04G000663 Chr04 NC_080390.1:7495862-7495872promoter 内 1194-1204 bp - 2797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 7490554-7493065(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr04G002525 Chr04 NC_080390.1:40281843-40281853promoter 内 1193-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 40284651-40287196(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr02G003206 Chr02 NC_080388.1:53199664-53199674promoter 内 1159-1169 bp + 2832 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 53202506-53205087(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr01G005084 Chr01 NC_080387.1:68720922-68720932promoter 内 3923-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 68721000-68722304(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAT
SmilChr05G002760 Chr05 NC_080391.1:31949908-31949918promoter 内 2935-2945 bp - 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 31945610-31948852(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr01G004828 Chr01 NC_080387.1:66434539-66434549promoter 内 2930-2940 bp + 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 66432362-66433478(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr03G003444 Chr03 NC_080389.1:52811705-52811715promoter 内 2899-2909 bp - 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52812807-52814357(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr03G003446 Chr03 NC_080389.1:52819827-52819837promoter 内 2899-2909 bp - 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52820929-52822479(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr04G000633 Chr04 NC_080390.1:7203451-7203461promoter 内 2663-2673 bp + 1328 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 7200782-7202123(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr05G003762 Chr05 NC_080391.1:50915292-50915302promoter 内 2653-2663 bp - 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 50911236-50913954(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCG
SmilChr05G000868 Chr05 NC_080391.1:6873258-6873268promoter 内 2614-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 6874645-6877135(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATA
SmilChr03G002914 Chr03 NC_080389.1:45901704-45901714promoter 内 2555-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 45898867-45900268(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr03G003971 Chr03 NC_080389.1:58748889-58748899promoter 内 2456-2466 bp + 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 58743127-58747354(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr04G003610 Chr04 NC_080390.1:52589216-52589226promoter 内 2451-2461 bp + 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52585272-52587676(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr01G001443 Chr01 NC_080387.1:28136814-28136824promoter 内 1654-1664 bp + 2337 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 28133035-28134477(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr04G002410 Chr04 NC_080390.1:38689740-38689750promoter 内 1616-1626 bp + 2375 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 38685772-38687365(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr04G001494 Chr04 NC_080390.1:24499375-24499385promoter 内 1390-1400 bp - 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 24501986-24503327(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr05G000349 Chr05 NC_080391.1:2623227-2623237promoter 内 723-733 bp - 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 2618851-2619959(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCG
SmilChr05G000350 Chr05 NC_080391.1:2623227-2623237promoter 内 656-666 bp - 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 2626572-2628586(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATG
SmilChr03G004565 Chr03 NC_080389.1:63576580-63576590promoter 内 649-659 bp - 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 63579932-63587672(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr03G003481 Chr03 NC_080389.1:53374010-53374020promoter 内 444-454 bp - 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 53362783-53370463(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr03G002915 Chr03 NC_080389.1:45901704-45901714promoter 内 400-410 bp + 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 45905305-45905967(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr06G003010 Chr06 NC_080392.1:42978888-42978898promoter 内 211-221 bp + 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 42982678-42983722(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr04G001183 Chr04 NC_080390.1:17936490-17936500promoter 内 3988-3998 bp - 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 17932247-17936487(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAT
SmilChr07G002272 Chr07 NC_080393.1:20935461-20935471promoter 内 3946-3956 bp - 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20935516-20938996(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATA